More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05090 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  57.26 
 
 		 623 aa  740    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  100 
 
 		 609 aa  1270    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1399  alpha amylase, catalytic region  57.52 
 
 		 620 aa  728    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  42.11 
 
 		 654 aa  528  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  42.76 
 
 		 631 aa  512  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  41.45 
 
 		 619 aa  506  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2313  alpha amylase, catalytic region  40 
 
 		 686 aa  500  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  39.3 
 
 		 665 aa  491  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2211  alpha amylase, catalytic region  39.68 
 
 		 665 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  39.14 
 
 		 765 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  41.06 
 
 		 639 aa  487  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  41.33 
 
 		 641 aa  484  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  38.25 
 
 		 786 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  38.63 
 
 		 778 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  38.75 
 
 		 774 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  40.43 
 
 		 644 aa  457  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  36.42 
 
 		 683 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  36.26 
 
 		 630 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  33.11 
 
 		 610 aa  326  6e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  29.67 
 
 		 511 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  28.66 
 
 		 510 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  29.67 
 
 		 582 aa  179  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  26.88 
 
 		 574 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  30.62 
 
 		 587 aa  161  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  30.56 
 
 		 477 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  27.53 
 
 		 610 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  28.4 
 
 		 481 aa  159  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  32.23 
 
 		 589 aa  158  3e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  28.04 
 
 		 493 aa  158  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  27.13 
 
 		 610 aa  157  6e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  27.79 
 
 		 481 aa  155  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  26.79 
 
 		 588 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  26.4 
 
 		 481 aa  154  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  27.59 
 
 		 472 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  27.58 
 
 		 481 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  30.54 
 
 		 574 aa  152  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  26.87 
 
 		 599 aa  151  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  27.49 
 
 		 620 aa  150  8e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  28.54 
 
 		 593 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  25.82 
 
 		 484 aa  149  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  26.65 
 
 		 586 aa  147  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  27.2 
 
 		 836 aa  146  9e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  29.58 
 
 		 499 aa  146  9e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.65 
 
 		 1891 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  26.65 
 
 		 586 aa  146  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  26.19 
 
 		 481 aa  145  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  26.22 
 
 		 586 aa  145  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  25.74 
 
 		 488 aa  144  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  25.39 
 
 		 486 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  27.91 
 
 		 509 aa  144  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.94 
 
 		 1855 aa  143  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  25.2 
 
 		 486 aa  143  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  29.5 
 
 		 1021 aa  143  9e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  28.07 
 
 		 838 aa  143  9e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  26.24 
 
 		 564 aa  143  9e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  25.45 
 
 		 589 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  26.12 
 
 		 609 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  25.17 
 
 		 571 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.64 
 
 		 2068 aa  141  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  28.25 
 
 		 584 aa  141  3.9999999999999997e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  27.86 
 
 		 583 aa  140  7.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  26.31 
 
 		 484 aa  139  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  30.81 
 
 		 522 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.79 
 
 		 1975 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  25.39 
 
 		 586 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  26.34 
 
 		 600 aa  137  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  27.79 
 
 		 524 aa  137  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  26.14 
 
 		 487 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  26.2 
 
 		 604 aa  137  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  26.6 
 
 		 586 aa  136  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  26.6 
 
 		 586 aa  136  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  26.6 
 
 		 586 aa  136  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  26.24 
 
 		 575 aa  136  9e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  25.25 
 
 		 586 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  26.6 
 
 		 586 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  24.02 
 
 		 528 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  24.56 
 
 		 586 aa  136  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  23.93 
 
 		 528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  27.61 
 
 		 588 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  26.06 
 
 		 690 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  26.4 
 
 		 586 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  25.24 
 
 		 526 aa  134  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  25.65 
 
 		 586 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  27.33 
 
 		 642 aa  133  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  27.92 
 
 		 663 aa  133  7.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  25.72 
 
 		 562 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  26.21 
 
 		 614 aa  131  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  26.95 
 
 		 649 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  25 
 
 		 496 aa  131  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  26.85 
 
 		 575 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  29.91 
 
 		 515 aa  130  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  26.32 
 
 		 622 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  25.85 
 
 		 608 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  26.74 
 
 		 1942 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0589  glycosidases-like  26.91 
 
 		 705 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.361866  normal  0.0110561 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  26.85 
 
 		 703 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  24.37 
 
 		 486 aa  128  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  23.78 
 
 		 533 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  25.32 
 
 		 543 aa  127  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  28.27 
 
 		 493 aa  127  8.000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>