More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1428 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  43.45 
 
 		 814 aa  691    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 838 aa  1710    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  42.32 
 
 		 836 aa  687    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  37.56 
 
 		 885 aa  567  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  32.06 
 
 		 510 aa  230  7e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  33.14 
 
 		 526 aa  227  9e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  31.07 
 
 		 511 aa  225  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  32.02 
 
 		 1891 aa  221  3.9999999999999997e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  29.68 
 
 		 1017 aa  214  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  29.72 
 
 		 1005 aa  212  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  27.97 
 
 		 925 aa  212  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  30.52 
 
 		 609 aa  210  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  31.31 
 
 		 622 aa  207  5e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  31.34 
 
 		 600 aa  205  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  31.55 
 
 		 1942 aa  203  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  29.65 
 
 		 610 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  32.85 
 
 		 599 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  29.6 
 
 		 620 aa  197  5.000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  30.09 
 
 		 614 aa  195  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.57 
 
 		 1975 aa  194  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  29.81 
 
 		 723 aa  188  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.67 
 
 		 1855 aa  188  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  29.43 
 
 		 593 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  31.16 
 
 		 524 aa  180  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  29.37 
 
 		 462 aa  179  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.24 
 
 		 2068 aa  177  7e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  29.26 
 
 		 564 aa  174  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  30.75 
 
 		 1021 aa  174  9e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  30.44 
 
 		 739 aa  172  2e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  30.47 
 
 		 490 aa  171  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  27.2 
 
 		 571 aa  171  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  30.72 
 
 		 619 aa  170  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  26.87 
 
 		 604 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  29.05 
 
 		 624 aa  167  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  26.89 
 
 		 703 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2186  alpha amylase, catalytic region  29.22 
 
 		 576 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  26.93 
 
 		 617 aa  162  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  28.81 
 
 		 630 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  28.6 
 
 		 642 aa  160  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  27.97 
 
 		 583 aa  158  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  27.62 
 
 		 574 aa  156  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  29.41 
 
 		 649 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0833  Alpha amylase, catalytic region  27.08 
 
 		 617 aa  155  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72167 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  29.56 
 
 		 623 aa  151  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  28.07 
 
 		 623 aa  150  7e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  28.57 
 
 		 606 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  28.57 
 
 		 606 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  27.52 
 
 		 644 aa  149  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  26.6 
 
 		 742 aa  147  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1743  alpha amylase, catalytic region  27.85 
 
 		 619 aa  147  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  27.56 
 
 		 686 aa  146  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  29.55 
 
 		 528 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  26.42 
 
 		 683 aa  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  29.55 
 
 		 528 aa  146  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  29.49 
 
 		 527 aa  145  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  28.15 
 
 		 559 aa  145  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  26.89 
 
 		 686 aa  145  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  32.11 
 
 		 2638 aa  144  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  27.85 
 
 		 609 aa  143  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  28.12 
 
 		 572 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  28.33 
 
 		 786 aa  142  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  26.68 
 
 		 639 aa  142  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  30.88 
 
 		 752 aa  141  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  28.57 
 
 		 646 aa  141  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  31.59 
 
 		 574 aa  140  7.999999999999999e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1887  alpha amylase catalytic region  25.12 
 
 		 659 aa  140  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  28.97 
 
 		 584 aa  140  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  28.45 
 
 		 778 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  28.69 
 
 		 484 aa  139  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  27.04 
 
 		 588 aa  139  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  28.21 
 
 		 631 aa  139  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  29.09 
 
 		 589 aa  139  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  27.73 
 
 		 587 aa  139  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  27.76 
 
 		 610 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0834  alpha amylase catalytic region  26.91 
 
 		 650 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  28.05 
 
 		 765 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  27.62 
 
 		 774 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  27.98 
 
 		 561 aa  137  7.000000000000001e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2211  alpha amylase, catalytic region  27.51 
 
 		 665 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  27.44 
 
 		 582 aa  137  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002001  periplasmic alpha-amylase  26.51 
 
 		 694 aa  137  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  27.08 
 
 		 767 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  27.59 
 
 		 610 aa  137  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  27.57 
 
 		 665 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  27.62 
 
 		 589 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  26.5 
 
 		 622 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  26.34 
 
 		 762 aa  136  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1399  alpha amylase, catalytic region  29.84 
 
 		 620 aa  135  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  24.9 
 
 		 662 aa  134  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  28.23 
 
 		 654 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3133  periplasmic alpha-amylase precursor  24.49 
 
 		 687 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21513  normal  0.0265446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  27.65 
 
 		 635 aa  133  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  28.42 
 
 		 533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0951  alpha amylase, catalytic region  26.19 
 
 		 655 aa  132  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2313  alpha amylase, catalytic region  27.39 
 
 		 686 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  27.66 
 
 		 477 aa  130  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  26.72 
 
 		 481 aa  130  9.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  25.78 
 
 		 690 aa  130  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  26.8 
 
 		 562 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  28.83 
 
 		 641 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>