More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0210 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  63.56 
 
 		 767 aa  971    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0210  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 741 aa  1525    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0538024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  37.66 
 
 		 703 aa  386  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  34.31 
 
 		 739 aa  355  1e-96  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  32.16 
 
 		 742 aa  322  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  35.58 
 
 		 526 aa  281  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  31.11 
 
 		 642 aa  211  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  28.97 
 
 		 649 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  29.41 
 
 		 620 aa  172  2e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  24.68 
 
 		 836 aa  152  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  28.01 
 
 		 571 aa  145  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  26.36 
 
 		 510 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  27.57 
 
 		 564 aa  137  9e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  26.97 
 
 		 814 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  26.18 
 
 		 838 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  26.94 
 
 		 600 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  26.21 
 
 		 609 aa  121  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2186  alpha amylase, catalytic region  25.89 
 
 		 576 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 511 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  25.1 
 
 		 619 aa  118  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  22.83 
 
 		 623 aa  116  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  25.77 
 
 		 762 aa  115  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  25.52 
 
 		 885 aa  114  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  26.84 
 
 		 610 aa  114  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  25.86 
 
 		 630 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.63 
 
 		 1891 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  25.1 
 
 		 524 aa  111  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  26.38 
 
 		 1005 aa  108  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  25.69 
 
 		 1021 aa  105  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  25.76 
 
 		 663 aa  102  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.28 
 
 		 1975 aa  101  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  25.53 
 
 		 614 aa  101  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  26.99 
 
 		 1942 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.22 
 
 		 1855 aa  99.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2667  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 853 aa  99.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.749886 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  23.67 
 
 		 493 aa  99.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  25.27 
 
 		 1017 aa  99.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  23.49 
 
 		 481 aa  99  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  23.59 
 
 		 484 aa  99  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  25.9 
 
 		 607 aa  98.2  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0895639 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  24.76 
 
 		 462 aa  97.8  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  23.05 
 
 		 609 aa  97.8  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  26 
 
 		 604 aa  97.8  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  25.81 
 
 		 593 aa  95.1  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  24.82 
 
 		 559 aa  94.4  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  24.58 
 
 		 532 aa  93.6  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  25.93 
 
 		 599 aa  93.6  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  24.54 
 
 		 481 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  22.89 
 
 		 481 aa  92.4  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  24.33 
 
 		 487 aa  91.3  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  22.58 
 
 		 622 aa  91.7  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  24.64 
 
 		 583 aa  91.3  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.64 
 
 		 2068 aa  91.3  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0148  alpha amylase catalytic region  23.94 
 
 		 878 aa  90.5  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0174055 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3131  maltodextrin glucosidase  24 
 
 		 609 aa  90.5  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3271  maltodextrin glucosidase  23.68 
 
 		 609 aa  90.5  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  26.87 
 
 		 654 aa  89.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  22.63 
 
 		 481 aa  89  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  24.43 
 
 		 558 aa  89  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  22.36 
 
 		 623 aa  88.2  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  25.27 
 
 		 561 aa  88.2  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  22.2 
 
 		 479 aa  88.2  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  25.29 
 
 		 521 aa  87  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4198  alpha amylase catalytic region  23.62 
 
 		 878 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  25.19 
 
 		 528 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  25.97 
 
 		 454 aa  86.3  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4158  alpha amylase catalytic region  23.62 
 
 		 878 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  24.77 
 
 		 679 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  24.94 
 
 		 624 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  26.92 
 
 		 258 aa  85.5  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  23.24 
 
 		 538 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  23.73 
 
 		 1643 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  25.09 
 
 		 528 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  23.42 
 
 		 552 aa  84.7  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  23.09 
 
 		 639 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  24.44 
 
 		 490 aa  84.7  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  23.42 
 
 		 644 aa  84.7  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  23.32 
 
 		 605 aa  84.7  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  25.64 
 
 		 606 aa  84.3  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  25.64 
 
 		 606 aa  84.3  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  22.7 
 
 		 665 aa  84.3  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  24.77 
 
 		 925 aa  84.3  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  22.75 
 
 		 488 aa  83.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  22.88 
 
 		 486 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  24.19 
 
 		 543 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  24.81 
 
 		 555 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  23.72 
 
 		 617 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  23.76 
 
 		 455 aa  83.2  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  33.77 
 
 		 2638 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  25.18 
 
 		 560 aa  82.8  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  22.88 
 
 		 486 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  24.26 
 
 		 605 aa  82.4  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  21.54 
 
 		 610 aa  82  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  24.55 
 
 		 605 aa  82.4  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  24.81 
 
 		 555 aa  82  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  23.21 
 
 		 553 aa  81.6  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0473  maltodextrin glucosidase  23.43 
 
 		 605 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  23.46 
 
 		 533 aa  82  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  22.48 
 
 		 536 aa  81.6  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3133  periplasmic alpha-amylase precursor  24.66 
 
 		 687 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21513  normal  0.0265446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>