More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0660 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 484 aa  983    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  35.99 
 
 		 510 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  37.78 
 
 		 1021 aa  240  5e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  33.2 
 
 		 511 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  35.12 
 
 		 524 aa  213  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  28.88 
 
 		 620 aa  201  3e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  30.71 
 
 		 610 aa  199  7.999999999999999e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  35.85 
 
 		 533 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  35.36 
 
 		 528 aa  190  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  35.08 
 
 		 528 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  29.62 
 
 		 526 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  30.07 
 
 		 2638 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  29.15 
 
 		 752 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  27.22 
 
 		 836 aa  170  5e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  30.69 
 
 		 762 aa  167  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  31.7 
 
 		 885 aa  162  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  28.89 
 
 		 642 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  27.73 
 
 		 574 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  27.48 
 
 		 814 aa  157  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  29.79 
 
 		 742 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  27.57 
 
 		 649 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  29.47 
 
 		 739 aa  150  4e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  31.65 
 
 		 559 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  26.52 
 
 		 586 aa  147  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  28.67 
 
 		 604 aa  146  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  27.11 
 
 		 586 aa  146  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  27.11 
 
 		 586 aa  146  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  27.11 
 
 		 586 aa  146  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  28.85 
 
 		 630 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  26.88 
 
 		 586 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  26.88 
 
 		 586 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  26.88 
 
 		 586 aa  144  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  28.97 
 
 		 838 aa  144  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  26.65 
 
 		 586 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  27.69 
 
 		 462 aa  143  7e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  25.6 
 
 		 481 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  26.2 
 
 		 586 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  28.4 
 
 		 481 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  26.42 
 
 		 586 aa  141  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  26.55 
 
 		 576 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  26.76 
 
 		 481 aa  140  7e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  27.73 
 
 		 588 aa  140  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  26.31 
 
 		 609 aa  140  7e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  26.69 
 
 		 488 aa  139  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  29.53 
 
 		 481 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  26.43 
 
 		 490 aa  139  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  27.08 
 
 		 703 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  29.19 
 
 		 584 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  28.95 
 
 		 586 aa  137  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  26.89 
 
 		 599 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  25.06 
 
 		 582 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  25.99 
 
 		 593 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.85 
 
 		 1855 aa  136  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  26.21 
 
 		 589 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1399  alpha amylase, catalytic region  25.55 
 
 		 620 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.55 
 
 		 1891 aa  134  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  27.78 
 
 		 583 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  25.82 
 
 		 575 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  26.23 
 
 		 619 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  26.17 
 
 		 586 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  30.29 
 
 		 572 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  30.08 
 
 		 606 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  30.08 
 
 		 606 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  30.68 
 
 		 477 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  28.75 
 
 		 541 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  29.29 
 
 		 587 aa  130  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  27.47 
 
 		 481 aa  130  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  25.9 
 
 		 686 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  26.52 
 
 		 493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  26.87 
 
 		 690 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  25.35 
 
 		 663 aa  129  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  25.54 
 
 		 521 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  25.1 
 
 		 767 aa  127  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  25.7 
 
 		 686 aa  126  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  27.88 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  30.53 
 
 		 459 aa  126  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  29.84 
 
 		 545 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  24.65 
 
 		 623 aa  125  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  27.13 
 
 		 571 aa  126  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  27.82 
 
 		 1942 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  27.88 
 
 		 641 aa  124  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  27.43 
 
 		 496 aa  124  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  28.23 
 
 		 541 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  28.93 
 
 		 484 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  29.44 
 
 		 472 aa  124  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  29.03 
 
 		 578 aa  123  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  24.61 
 
 		 499 aa  123  8e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.52 
 
 		 1975 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3790  periplasmic alpha-amylase precursor  27.04 
 
 		 687 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  27.27 
 
 		 487 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0016  periplasmic alpha-amylase precursor  27 
 
 		 687 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24938  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  27.27 
 
 		 622 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  27 
 
 		 687 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  28.4 
 
 		 486 aa  121  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  49.22 
 
 		 614 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  26.72 
 
 		 639 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  27.59 
 
 		 778 aa  120  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  24.95 
 
 		 623 aa  120  7.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  25.54 
 
 		 610 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  27.45 
 
 		 765 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>