More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK02760 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  100 
 
 
572 aa  1181    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  43.64 
 
 
532 aa  414  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  40.65 
 
 
490 aa  359  8e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  40.17 
 
 
623 aa  343  4e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.91072 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  36.77 
 
 
462 aa  318  2e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  38.4 
 
 
561 aa  313  6.999999999999999e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  37 
 
 
521 aa  307  4.0000000000000004e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  36.47 
 
 
606 aa  299  1e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  36.47 
 
 
606 aa  299  1e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  35.19 
 
 
552 aa  294  3e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  32.68 
 
 
559 aa  291  2e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  29.14 
 
 
510 aa  187  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  34.04 
 
 
511 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  31.8 
 
 
524 aa  174  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  31.25 
 
 
620 aa  171  4e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  30.5 
 
 
1021 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  28.11 
 
 
526 aa  157  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  27.99 
 
 
838 aa  150  7e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  29.44 
 
 
814 aa  139  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  27.48 
 
 
885 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  25.77 
 
 
836 aa  134  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  28.12 
 
 
610 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  28.21 
 
 
484 aa  131  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  26.15 
 
 
703 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  26.64 
 
 
609 aa  118  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  28 
 
 
599 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  28.18 
 
 
925 aa  117  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  25.19 
 
 
593 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  26.21 
 
 
642 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.1 
 
 
1891 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  25.53 
 
 
649 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.61 
 
 
1855 aa  113  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  25.93 
 
 
622 aa  112  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.54 
 
 
2068 aa  109  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  26.5 
 
 
533 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  25 
 
 
1005 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  28.45 
 
 
752 aa  108  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  29.09 
 
 
2638 aa  108  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  26.3 
 
 
600 aa  107  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  26.46 
 
 
528 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  25.84 
 
 
562 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  23.38 
 
 
762 aa  105  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  23.86 
 
 
614 aa  105  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  25 
 
 
690 aa  105  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.7 
 
 
1975 aa  104  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  26.05 
 
 
619 aa  104  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  24.63 
 
 
589 aa  103  9e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  26.75 
 
 
630 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  26.23 
 
 
528 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  22.61 
 
 
739 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  26.38 
 
 
742 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  24.6 
 
 
604 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  23.27 
 
 
589 aa  102  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  25.06 
 
 
571 aa  101  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  24.86 
 
 
575 aa  101  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  25.96 
 
 
644 aa  100  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  22.63 
 
 
588 aa  100  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  27.58 
 
 
587 aa  99.4  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  24.42 
 
 
584 aa  98.6  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  23.96 
 
 
610 aa  97.4  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2186  alpha amylase, catalytic region  27.06 
 
 
576 aa  97.1  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  23.92 
 
 
610 aa  96.7  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  23.95 
 
 
574 aa  96.3  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  25.69 
 
 
624 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  23.74 
 
 
683 aa  96.7  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  24.66 
 
 
654 aa  95.5  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  25.5 
 
 
564 aa  95.1  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  24.04 
 
 
686 aa  94.7  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  23.8 
 
 
767 aa  92.4  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  23.29 
 
 
586 aa  92.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  24.59 
 
 
644 aa  92.4  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  23.5 
 
 
586 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  23.29 
 
 
586 aa  92  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  26.3 
 
 
623 aa  91.7  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  22.86 
 
 
586 aa  91.3  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  23.08 
 
 
586 aa  90.9  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  23.08 
 
 
586 aa  90.9  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  23.08 
 
 
586 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  24.27 
 
 
631 aa  90.5  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  20.87 
 
 
576 aa  90.1  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  24.03 
 
 
583 aa  89.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  25.06 
 
 
635 aa  89.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  23.29 
 
 
586 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  22.18 
 
 
1017 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  25.72 
 
 
723 aa  87.8  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  24.75 
 
 
665 aa  87.8  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  24.64 
 
 
815 aa  87  9e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  24.29 
 
 
687 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  24.48 
 
 
555 aa  86.7  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  23.66 
 
 
574 aa  86.7  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  24.42 
 
 
555 aa  86.3  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  23.06 
 
 
586 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  23.63 
 
 
481 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0833  Alpha amylase, catalytic region  23.86 
 
 
617 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2211  alpha amylase, catalytic region  23.75 
 
 
665 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  24.29 
 
 
422 aa  85.9  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  34.81 
 
 
686 aa  85.9  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  23.06 
 
 
586 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  25.55 
 
 
496 aa  85.1  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  22.38 
 
 
617 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>