More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5853 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 742 aa  1497    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  43.53 
 
 		 739 aa  588  1e-167  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  40.41 
 
 		 703 aa  480  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  43.15 
 
 		 526 aa  432  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  33.6 
 
 		 767 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0210  alpha amylase catalytic region  32.16 
 
 		 741 aa  322  9.999999999999999e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0538024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  32.92 
 
 		 649 aa  283  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  34.13 
 
 		 642 aa  273  7e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  32.11 
 
 		 620 aa  191  5.999999999999999e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  28.44 
 
 		 571 aa  172  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  26.57 
 
 		 511 aa  167  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  29.12 
 
 		 524 aa  166  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  27.06 
 
 		 510 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  29.49 
 
 		 484 aa  154  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  27.8 
 
 		 885 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  31.51 
 
 		 1021 aa  152  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  27.34 
 
 		 836 aa  147  6e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  26.49 
 
 		 838 aa  147  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  29.45 
 
 		 610 aa  147  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.36 
 
 		 1891 aa  144  7e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  27.85 
 
 		 814 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  27.82 
 
 		 528 aa  142  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  28.02 
 
 		 528 aa  140  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  28.17 
 
 		 1942 aa  137  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  27.08 
 
 		 1017 aa  135  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  26.64 
 
 		 609 aa  134  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  26.19 
 
 		 722 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  27.47 
 
 		 533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  29.06 
 
 		 561 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  25.1 
 
 		 481 aa  130  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  26.81 
 
 		 574 aa  129  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  25.35 
 
 		 564 aa  129  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  27.16 
 
 		 559 aa  127  9e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  25.75 
 
 		 593 aa  124  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  27.19 
 
 		 914 aa  124  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  28.77 
 
 		 2638 aa  124  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  26.82 
 
 		 663 aa  121  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  28.61 
 
 		 752 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  27.66 
 
 		 630 aa  121  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  25.09 
 
 		 600 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  25.72 
 
 		 477 aa  119  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.99 
 
 		 1975 aa  117  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  24.64 
 
 		 614 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  25.18 
 
 		 552 aa  116  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  25.88 
 
 		 1005 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  25.54 
 
 		 925 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  25 
 
 		 472 aa  116  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  24.6 
 
 		 762 aa  115  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  26 
 
 		 462 aa  114  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  25.1 
 
 		 599 aa  114  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  27.27 
 
 		 623 aa  114  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  28.74 
 
 		 723 aa  114  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  24.92 
 
 		 604 aa  113  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  25.19 
 
 		 521 aa  113  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  24.73 
 
 		 635 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  29.09 
 
 		 606 aa  112  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  29.09 
 
 		 606 aa  112  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  26.24 
 
 		 623 aa  111  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  26.82 
 
 		 488 aa  110  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  25.95 
 
 		 481 aa  110  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  25.59 
 
 		 481 aa  109  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  24.49 
 
 		 583 aa  109  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.55 
 
 		 1855 aa  109  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1398  alpha amylase, catalytic region  25.69 
 
 		 553 aa  109  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.88 
 
 		 2068 aa  108  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2874  alpha amylase catalytic region  23.45 
 
 		 1299 aa  108  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2435  alpha amylase catalytic region  25.78 
 
 		 451 aa  108  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  26 
 
 		 475 aa  108  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  23.89 
 
 		 486 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  23.89 
 
 		 486 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  25.69 
 
 		 686 aa  107  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  25.72 
 
 		 582 aa  107  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  26.61 
 
 		 433 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  23.5 
 
 		 1643 aa  107  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  26.61 
 
 		 433 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  25.3 
 
 		 686 aa  106  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  20.98 
 
 		 1193 aa  105  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  24.4 
 
 		 481 aa  105  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  25.88 
 
 		 575 aa  105  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  23.82 
 
 		 481 aa  105  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  25.71 
 
 		 609 aa  105  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  26.32 
 
 		 433 aa  105  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  23.66 
 
 		 606 aa  104  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  25.96 
 
 		 589 aa  104  6e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  24.59 
 
 		 617 aa  104  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  27.63 
 
 		 532 aa  104  7e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  26.55 
 
 		 778 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  24.41 
 
 		 687 aa  103  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  25.43 
 
 		 586 aa  103  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  25.66 
 
 		 490 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0016  periplasmic alpha-amylase precursor  24.41 
 
 		 687 aa  103  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24938  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  25.15 
 
 		 496 aa  103  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  26.5 
 
 		 487 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  23.55 
 
 		 1175 aa  103  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  26.98 
 
 		 765 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  25.71 
 
 		 631 aa  103  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0150  periplasmic alpha-amylase precursor  25.49 
 
 		 676 aa  102  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  25.53 
 
 		 624 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2186  alpha amylase, catalytic region  24.81 
 
 		 576 aa  101  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3790  periplasmic alpha-amylase precursor  24.22 
 
 		 687 aa  101  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>