More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2083 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 778 aa  1606    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  94.69 
 
 		 786 aa  1485    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  54.83 
 
 		 641 aa  741    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  93.47 
 
 		 774 aa  1476    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  67.23 
 
 		 665 aa  965    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2211  alpha amylase, catalytic region  68.35 
 
 		 665 aa  965    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  54.13 
 
 		 639 aa  731    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2313  alpha amylase, catalytic region  67.32 
 
 		 686 aa  954    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  56.77 
 
 		 631 aa  784    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  92.82 
 
 		 765 aa  1409    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  53.88 
 
 		 654 aa  773    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  46.18 
 
 		 683 aa  619  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  41.67 
 
 		 644 aa  533  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  38.3 
 
 		 609 aa  481  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1399  alpha amylase, catalytic region  35.2 
 
 		 620 aa  456  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  38.35 
 
 		 623 aa  444  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  36.36 
 
 		 619 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  34.93 
 
 		 630 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  29.62 
 
 		 610 aa  291  4e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  28.38 
 
 		 510 aa  189  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  28.36 
 
 		 511 aa  185  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  27.53 
 
 		 600 aa  151  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  28.45 
 
 		 838 aa  140  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  28.1 
 
 		 1021 aa  138  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  27.13 
 
 		 609 aa  136  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  27.19 
 
 		 593 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  28.35 
 
 		 620 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  25.41 
 
 		 599 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  27.36 
 
 		 589 aa  131  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  24.31 
 
 		 533 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  25.96 
 
 		 583 aa  129  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  26.7 
 
 		 614 aa  126  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  25.14 
 
 		 584 aa  127  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  26.93 
 
 		 836 aa  124  6e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.06 
 
 		 1855 aa  124  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  25.21 
 
 		 528 aa  124  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  24.53 
 
 		 885 aa  123  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  28.4 
 
 		 574 aa  123  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  26.91 
 
 		 522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  25.55 
 
 		 528 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  24.95 
 
 		 574 aa  122  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  25.36 
 
 		 526 aa  120  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  23.8 
 
 		 586 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  27.49 
 
 		 484 aa  120  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  24.58 
 
 		 571 aa  118  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  25.16 
 
 		 562 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  24.05 
 
 		 564 aa  118  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  24.89 
 
 		 588 aa  118  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  27.41 
 
 		 610 aa  117  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  29.76 
 
 		 715 aa  117  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2158  hypothetical protein  62.77 
 
 		 108 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  25.97 
 
 		 589 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  25.17 
 
 		 583 aa  114  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  27.23 
 
 		 588 aa  114  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  27.38 
 
 		 610 aa  114  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  24.42 
 
 		 477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  26.84 
 
 		 586 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  24.52 
 
 		 1145 aa  111  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  25.61 
 
 		 499 aa  111  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  25.22 
 
 		 814 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  24.52 
 
 		 586 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  24.63 
 
 		 582 aa  110  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.51 
 
 		 1891 aa  110  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1887  alpha amylase catalytic region  25.05 
 
 		 659 aa  110  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  23.85 
 
 		 515 aa  109  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  26.07 
 
 		 586 aa  109  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  24.07 
 
 		 481 aa  108  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  23.18 
 
 		 654 aa  108  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  25.29 
 
 		 649 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  24.48 
 
 		 462 aa  107  8e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  25.1 
 
 		 686 aa  107  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  25.45 
 
 		 541 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  26.8 
 
 		 524 aa  106  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  24.57 
 
 		 586 aa  105  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  25.45 
 
 		 545 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  23.99 
 
 		 509 aa  105  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  24.89 
 
 		 586 aa  105  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  27.89 
 
 		 587 aa  103  9e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  24.36 
 
 		 586 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  24.36 
 
 		 586 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  24.36 
 
 		 586 aa  103  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  23.31 
 
 		 635 aa  103  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  24.36 
 
 		 586 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  25.28 
 
 		 593 aa  103  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  25.09 
 
 		 624 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  26.86 
 
 		 742 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  23.23 
 
 		 2638 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  24.31 
 
 		 578 aa  102  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0951  alpha amylase, catalytic region  23.85 
 
 		 655 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  24.68 
 
 		 586 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  24.95 
 
 		 558 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  29.98 
 
 		 739 aa  102  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  24.27 
 
 		 1175 aa  102  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  25.62 
 
 		 703 aa  102  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  24.65 
 
 		 595 aa  102  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  24.75 
 
 		 541 aa  102  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  24.94 
 
 		 575 aa  100  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  22.72 
 
 		 752 aa  100  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  27.35 
 
 		 524 aa  100  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  25.16 
 
 		 472 aa  100  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>