More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_4138 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03423  periplasmic alpha-amylase precursor  69.74 
 
 		 676 aa  986    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0139  alpha amylase catalytic region  69.88 
 
 		 676 aa  988    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3942  periplasmic alpha-amylase precursor  67.35 
 
 		 675 aa  963    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.973795 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0143  periplasmic alpha-amylase precursor  69.88 
 
 		 676 aa  988    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3951  periplasmic alpha-amylase precursor  69.3 
 
 		 676 aa  984    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3862  periplasmic alpha-amylase precursor  67.64 
 
 		 675 aa  967    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3987  periplasmic alpha-amylase precursor  67.49 
 
 		 675 aa  964    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  100 
 
 		 687 aa  1425    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4048  periplasmic alpha-amylase precursor  67.06 
 
 		 675 aa  958    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.555384 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0016  periplasmic alpha-amylase precursor  99.56 
 
 		 687 aa  1420    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24938  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4068  periplasmic alpha-amylase precursor  69.88 
 
 		 676 aa  989    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4947  periplasmic alpha-amylase precursor  69.88 
 
 		 676 aa  988    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876495  normal  0.214816 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3774  periplasmic alpha-amylase precursor  69.88 
 
 		 676 aa  988    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03374  hypothetical protein  69.74 
 
 		 676 aa  986    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002001  periplasmic alpha-amylase  55.16 
 
 		 694 aa  769    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3878  periplasmic alpha-amylase precursor  67.49 
 
 		 675 aa  963    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0054  periplasmic alpha-amylase precursor  79.04 
 
 		 688 aa  1127    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3894  periplasmic alpha-amylase precursor  69.44 
 
 		 676 aa  984    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3790  periplasmic alpha-amylase precursor  99.56 
 
 		 687 aa  1420    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0150  periplasmic alpha-amylase precursor  69.87 
 
 		 676 aa  984    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3133  periplasmic alpha-amylase precursor  56.89 
 
 		 687 aa  612  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21513  normal  0.0265446 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  45.18 
 
 		 690 aa  566  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  44.85 
 
 		 686 aa  560  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  43.88 
 
 		 686 aa  560  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5156  alpha amylase catalytic region  50.76 
 
 		 631 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.794447 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2966  periplasmic alpha-amylase precursor  34.61 
 
 		 554 aa  300  9e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0359773  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1398  alpha amylase, catalytic region  34.98 
 
 		 553 aa  294  4e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  34.87 
 
 		 566 aa  271  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  31.31 
 
 		 533 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  30.37 
 
 		 528 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  29.98 
 
 		 528 aa  173  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  29.92 
 
 		 2638 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  30.16 
 
 		 752 aa  166  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.79 
 
 		 1891 aa  148  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  27.12 
 
 		 604 aa  140  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  28.52 
 
 		 1942 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  25.58 
 
 		 1005 aa  139  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  26.29 
 
 		 1021 aa  138  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  25.43 
 
 		 1017 aa  138  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.39 
 
 		 1975 aa  137  7.000000000000001e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.11 
 
 		 1855 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  23.17 
 
 		 511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  28.57 
 
 		 622 aa  132  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  26.25 
 
 		 586 aa  131  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  28.15 
 
 		 925 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  26.68 
 
 		 609 aa  130  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  24.96 
 
 		 614 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  27.13 
 
 		 600 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  24.27 
 
 		 836 aa  127  8.000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  24.63 
 
 		 593 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  24.08 
 
 		 814 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  22.3 
 
 		 574 aa  122  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  25.55 
 
 		 723 aa  121  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  24.11 
 
 		 582 aa  120  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  25.84 
 
 		 481 aa  118  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  26.35 
 
 		 462 aa  117  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  24.52 
 
 		 586 aa  117  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  25.05 
 
 		 599 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  26.54 
 
 		 484 aa  116  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  22.56 
 
 		 885 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  23.6 
 
 		 586 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  23.6 
 
 		 586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  24.76 
 
 		 589 aa  111  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  23.94 
 
 		 515 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  22.36 
 
 		 575 aa  108  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  34.97 
 
 		 510 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  22.49 
 
 		 477 aa  107  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  23.75 
 
 		 620 aa  105  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  23.75 
 
 		 587 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  24.61 
 
 		 588 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  24.38 
 
 		 589 aa  106  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  23.49 
 
 		 586 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  23.49 
 
 		 586 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  23.49 
 
 		 586 aa  105  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  23.49 
 
 		 586 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  24.29 
 
 		 486 aa  105  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  24.32 
 
 		 586 aa  105  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  24.21 
 
 		 490 aa  104  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  23.88 
 
 		 586 aa  105  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  23.3 
 
 		 586 aa  103  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  24.41 
 
 		 742 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  23.5 
 
 		 586 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  21.07 
 
 		 642 aa  101  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  22.96 
 
 		 610 aa  100  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  23.02 
 
 		 649 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  23.9 
 
 		 619 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  24.77 
 
 		 541 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  23.97 
 
 		 526 aa  99.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  35.1 
 
 		 2068 aa  99.4  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  23.53 
 
 		 1643 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  24.72 
 
 		 532 aa  99.8  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  26.48 
 
 		 624 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  25.3 
 
 		 623 aa  97.8  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  38.64 
 
 		 524 aa  98.2  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  28.97 
 
 		 561 aa  97.1  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  22.67 
 
 		 610 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  23.25 
 
 		 493 aa  97.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  24.07 
 
 		 552 aa  96.3  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  22.91 
 
 		 459 aa  95.9  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  24.45 
 
 		 541 aa  95.1  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>