More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1454 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 739 aa  1504    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  43.78 
 
 		 742 aa  587  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  43.77 
 
 		 526 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  38.34 
 
 		 703 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  35.05 
 
 		 767 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0210  alpha amylase catalytic region  34.31 
 
 		 741 aa  355  1e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0538024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  33.27 
 
 		 649 aa  305  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  32.67 
 
 		 642 aa  303  5.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  30.34 
 
 		 885 aa  189  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  29.42 
 
 		 620 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  29.11 
 
 		 814 aa  183  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  29.65 
 
 		 836 aa  176  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  29.93 
 
 		 838 aa  174  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  29.26 
 
 		 510 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  28.63 
 
 		 524 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  27.97 
 
 		 511 aa  160  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  25.96 
 
 		 571 aa  154  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  26.92 
 
 		 609 aa  150  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  26.58 
 
 		 564 aa  146  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  29.12 
 
 		 484 aa  146  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  26.94 
 
 		 593 aa  145  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  28.76 
 
 		 574 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  27.14 
 
 		 623 aa  142  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  28.89 
 
 		 604 aa  141  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  28.75 
 
 		 559 aa  138  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  26.65 
 
 		 481 aa  137  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  28.57 
 
 		 605 aa  136  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  25.92 
 
 		 762 aa  135  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  30.86 
 
 		 583 aa  136  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  27.97 
 
 		 521 aa  135  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  26.81 
 
 		 552 aa  135  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  26.45 
 
 		 610 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.3 
 
 		 1891 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  27.44 
 
 		 1942 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  29.14 
 
 		 1021 aa  131  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  28.21 
 
 		 477 aa  129  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2186  alpha amylase, catalytic region  24.78 
 
 		 576 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  25.87 
 
 		 528 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  26.97 
 
 		 490 aa  127  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  25.82 
 
 		 528 aa  128  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.53 
 
 		 2068 aa  127  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  28.74 
 
 		 561 aa  126  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  25.69 
 
 		 600 aa  126  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  25.53 
 
 		 588 aa  125  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  25.56 
 
 		 599 aa  124  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  26 
 
 		 586 aa  124  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  27.07 
 
 		 582 aa  124  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  25.41 
 
 		 1005 aa  124  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  27.2 
 
 		 472 aa  124  8e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3705  alpha amylase catalytic region  25.37 
 
 		 617 aa  124  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00647332  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.87 
 
 		 1975 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.3 
 
 		 1855 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  25.6 
 
 		 481 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  29.27 
 
 		 575 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  23.65 
 
 		 622 aa  122  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  24.95 
 
 		 683 aa  122  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  27.27 
 
 		 639 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  25.58 
 
 		 533 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  29.51 
 
 		 2638 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 614 aa  120  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  27.22 
 
 		 481 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  26.12 
 
 		 462 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  25.49 
 
 		 644 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  25.75 
 
 		 1017 aa  117  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1398  alpha amylase, catalytic region  27.86 
 
 		 553 aa  116  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0833  Alpha amylase, catalytic region  24.36 
 
 		 617 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  25.93 
 
 		 459 aa  116  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  25.89 
 
 		 641 aa  115  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  28.42 
 
 		 752 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  23.96 
 
 		 617 aa  114  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  25.63 
 
 		 586 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  26.23 
 
 		 589 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  24.76 
 
 		 484 aa  113  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  25.63 
 
 		 586 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  25.78 
 
 		 586 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  27.31 
 
 		 630 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  24.53 
 
 		 608 aa  112  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  25.62 
 
 		 631 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  26.58 
 
 		 481 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  27.8 
 
 		 532 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  27.27 
 
 		 493 aa  111  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  28.89 
 
 		 665 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  26.81 
 
 		 663 aa  110  8.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  24.94 
 
 		 610 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  25.29 
 
 		 586 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  25.29 
 
 		 586 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  25.29 
 
 		 586 aa  109  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  26.54 
 
 		 605 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  25.43 
 
 		 622 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  25.1 
 
 		 586 aa  108  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  24.96 
 
 		 566 aa  108  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  23.67 
 
 		 610 aa  108  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  26.07 
 
 		 605 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  21.78 
 
 		 1193 aa  107  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1399  alpha amylase, catalytic region  23.78 
 
 		 620 aa  107  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0433  maltodextrin glucosidase  27.35 
 
 		 605 aa  107  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1458  alpha amylase, catalytic region  24.68 
 
 		 651 aa  107  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  27.35 
 
 		 605 aa  107  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  27.35 
 
 		 605 aa  107  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00355  hypothetical protein  27.35 
 
 		 605 aa  107  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>