More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4622 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  74.5 
 
 		 642 aa  1021    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 649 aa  1356    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  39.29 
 
 		 526 aa  346  7e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  33.27 
 
 		 739 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  34.81 
 
 		 703 aa  296  9e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  32.92 
 
 		 742 aa  282  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  30.07 
 
 		 620 aa  222  1.9999999999999999e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  30.9 
 
 		 767 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  31.47 
 
 		 511 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0210  alpha amylase catalytic region  28.97 
 
 		 741 aa  206  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0538024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  31.61 
 
 		 510 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  28.79 
 
 		 571 aa  201  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  35.71 
 
 		 814 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  33.12 
 
 		 836 aa  196  9e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  31.58 
 
 		 524 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  26.62 
 
 		 564 aa  179  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.26 
 
 		 1891 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2186  alpha amylase, catalytic region  27.32 
 
 		 576 aa  171  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  31.11 
 
 		 1021 aa  164  6e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  30.28 
 
 		 630 aa  161  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  27.68 
 
 		 1942 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  27.77 
 
 		 885 aa  159  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  26.2 
 
 		 600 aa  158  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  27.83 
 
 		 599 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  26.86 
 
 		 609 aa  156  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  29.41 
 
 		 838 aa  155  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  28.17 
 
 		 528 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.37 
 
 		 1975 aa  154  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  28.98 
 
 		 623 aa  154  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  27.95 
 
 		 528 aa  153  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.06 
 
 		 1855 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  27.59 
 
 		 1017 aa  152  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  27.57 
 
 		 484 aa  152  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  27.45 
 
 		 472 aa  151  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  26.4 
 
 		 604 aa  148  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.77 
 
 		 2068 aa  147  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  24.95 
 
 		 481 aa  147  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  27.07 
 
 		 593 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  27.71 
 
 		 1005 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  27.95 
 
 		 533 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  25.93 
 
 		 481 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  27.15 
 
 		 614 aa  139  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  26.64 
 
 		 619 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  26.44 
 
 		 490 aa  136  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  27.14 
 
 		 559 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  27.83 
 
 		 723 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  26.92 
 
 		 631 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  25.59 
 
 		 481 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  26.33 
 
 		 925 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  26.95 
 
 		 609 aa  130  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  25.69 
 
 		 462 aa  130  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  25.62 
 
 		 481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  26.02 
 
 		 532 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  27.22 
 
 		 623 aa  126  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  27.85 
 
 		 644 aa  126  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  26.7 
 
 		 486 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  26.7 
 
 		 486 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  27 
 
 		 561 aa  125  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  27.37 
 
 		 752 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  27.37 
 
 		 587 aa  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  26.72 
 
 		 2638 aa  125  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  25.91 
 
 		 477 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  26.68 
 
 		 484 aa  124  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  24.75 
 
 		 496 aa  122  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  27.9 
 
 		 635 aa  122  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  25.79 
 
 		 521 aa  120  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  25.74 
 
 		 545 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  24.4 
 
 		 610 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  24.69 
 
 		 663 aa  120  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  26.11 
 
 		 606 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  26.11 
 
 		 606 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  27.13 
 
 		 641 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  25.59 
 
 		 574 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  28.1 
 
 		 644 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  26.47 
 
 		 493 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  26.15 
 
 		 488 aa  117  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  24.95 
 
 		 683 aa  117  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  22.81 
 
 		 690 aa  117  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  26.08 
 
 		 541 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  24.05 
 
 		 586 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  24.82 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  24.82 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  25.21 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  24.52 
 
 		 487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  26.71 
 
 		 586 aa  115  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  25.83 
 
 		 481 aa  115  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3333  alpha amylase, catalytic region  25.36 
 
 		 434 aa  115  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.320284  normal  0.0371883 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 541 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  23 
 
 		 686 aa  114  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1399  alpha amylase, catalytic region  25.97 
 
 		 620 aa  114  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  24.07 
 
 		 586 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  25.3 
 
 		 572 aa  113  9e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3059  alpha amylase, catalytic region  25.62 
 
 		 434 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  25.24 
 
 		 433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  27.66 
 
 		 654 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  24.21 
 
 		 562 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  23.15 
 
 		 582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  24.07 
 
 		 586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  22.58 
 
 		 686 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  25.13 
 
 		 1847 aa  112  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>