More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1398 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1398  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 
553 aa  1143    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  49.28 
 
 
566 aa  541  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002001  periplasmic alpha-amylase  35.67 
 
 
694 aa  303  5.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0054  periplasmic alpha-amylase precursor  34.88 
 
 
688 aa  299  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0016  periplasmic alpha-amylase precursor  34.79 
 
 
687 aa  295  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24938  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0150  periplasmic alpha-amylase precursor  35.09 
 
 
676 aa  289  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0139  alpha amylase catalytic region  35.13 
 
 
676 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0143  periplasmic alpha-amylase precursor  35.13 
 
 
676 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3774  periplasmic alpha-amylase precursor  35.13 
 
 
676 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03423  periplasmic alpha-amylase precursor  35.13 
 
 
676 aa  287  4e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03374  hypothetical protein  35.13 
 
 
676 aa  287  4e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4947  periplasmic alpha-amylase precursor  35.13 
 
 
676 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876495  normal  0.214816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3133  periplasmic alpha-amylase precursor  34.83 
 
 
687 aa  286  8e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21513  normal  0.0265446 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4068  periplasmic alpha-amylase precursor  34.73 
 
 
676 aa  286  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5156  alpha amylase catalytic region  33.46 
 
 
631 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.794447 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3951  periplasmic alpha-amylase precursor  34.33 
 
 
676 aa  281  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3894  periplasmic alpha-amylase precursor  34.73 
 
 
676 aa  278  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3790  periplasmic alpha-amylase precursor  33.84 
 
 
687 aa  276  6e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  33.65 
 
 
687 aa  276  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3878  periplasmic alpha-amylase precursor  33.72 
 
 
675 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3862  periplasmic alpha-amylase precursor  33.14 
 
 
675 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3942  periplasmic alpha-amylase precursor  33.72 
 
 
675 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.973795 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  34.51 
 
 
690 aa  274  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4048  periplasmic alpha-amylase precursor  33.72 
 
 
675 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.555384 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3987  periplasmic alpha-amylase precursor  32.95 
 
 
675 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  34.35 
 
 
686 aa  271  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  33.9 
 
 
686 aa  269  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2966  periplasmic alpha-amylase precursor  26.46 
 
 
554 aa  158  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0359773  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  27.85 
 
 
599 aa  147  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  26.93 
 
 
528 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  27.82 
 
 
528 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  28.6 
 
 
511 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  26.55 
 
 
533 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  30.04 
 
 
2638 aa  140  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  28.52 
 
 
752 aa  140  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  28.15 
 
 
510 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  30.56 
 
 
1021 aa  135  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0173524 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  28.51 
 
 
462 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  26.41 
 
 
593 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  26.81 
 
 
838 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.17 
 
 
1855 aa  124  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  26.4 
 
 
609 aa  123  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  27.17 
 
 
925 aa  123  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  26.41 
 
 
604 aa  122  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.67 
 
 
1891 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  26.83 
 
 
526 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  24.46 
 
 
914 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  26.75 
 
 
622 aa  117  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  24.91 
 
 
1005 aa  116  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  27.86 
 
 
739 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  26.33 
 
 
484 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.14 
 
 
1975 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  25.93 
 
 
1942 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  27.22 
 
 
600 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  25.96 
 
 
524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  25.04 
 
 
1017 aa  111  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.51 
 
 
2068 aa  110  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  24.12 
 
 
885 aa  110  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  25.74 
 
 
742 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  25.36 
 
 
490 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  26.48 
 
 
623 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  25.59 
 
 
614 aa  108  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  25.59 
 
 
836 aa  106  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  26.18 
 
 
582 aa  105  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  23.76 
 
 
620 aa  103  8e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  26.04 
 
 
610 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  25.42 
 
 
762 aa  100  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  24.83 
 
 
584 aa  100  7e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  24.12 
 
 
481 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  23.82 
 
 
589 aa  98.6  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  26.54 
 
 
583 aa  96.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  24.29 
 
 
477 aa  96.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  24.07 
 
 
1643 aa  96.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  23.9 
 
 
481 aa  95.5  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  25.5 
 
 
586 aa  95.5  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  24.67 
 
 
459 aa  95.1  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  23.3 
 
 
481 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  24.86 
 
 
472 aa  94.7  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  34.84 
 
 
646 aa  94.7  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  26.77 
 
 
561 aa  94.4  5e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  26.52 
 
 
532 aa  93.6  8e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  25.14 
 
 
642 aa  93.2  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  25.89 
 
 
574 aa  93.2  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  33.12 
 
 
662 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  22.93 
 
 
484 aa  92.4  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0951  alpha amylase, catalytic region  25.25 
 
 
655 aa  92.8  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1743  alpha amylase, catalytic region  28.53 
 
 
619 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  37.9 
 
 
703 aa  91.7  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0834  alpha amylase catalytic region  24.64 
 
 
650 aa  90.5  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  25.05 
 
 
576 aa  90.5  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  26.09 
 
 
499 aa  89  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  21.92 
 
 
571 aa  87.8  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  24.47 
 
 
609 aa  87.8  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1887  alpha amylase catalytic region  23.29 
 
 
659 aa  87.4  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  25.17 
 
 
586 aa  87  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  25.56 
 
 
588 aa  87  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0104  alpha amylase catalytic region  26.11 
 
 
653 aa  87.4  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  24.4 
 
 
481 aa  87  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  25.06 
 
 
723 aa  86.7  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  38.58 
 
 
631 aa  87  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>