More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1180 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 526 aa  1077    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  44.27 
 
 		 739 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  43.15 
 
 		 742 aa  430  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  42.58 
 
 		 703 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  40.94 
 
 		 642 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  39.29 
 
 		 649 aa  346  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  36.98 
 
 		 767 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0210  alpha amylase catalytic region  35.58 
 
 		 741 aa  281  2e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0538024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  34.78 
 
 		 620 aa  247  4e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  35.47 
 
 		 510 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  33.14 
 
 		 511 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  33.14 
 
 		 838 aa  227  5.0000000000000005e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  29.35 
 
 		 571 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  33.56 
 
 		 524 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  30.4 
 
 		 836 aa  207  4e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  32.2 
 
 		 814 aa  205  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  31.07 
 
 		 885 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  29.22 
 
 		 564 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  35.71 
 
 		 1021 aa  188  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  29.65 
 
 		 484 aa  182  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  27.87 
 
 		 593 aa  179  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  29.7 
 
 		 610 aa  177  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  29.5 
 
 		 609 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  30.25 
 
 		 600 aa  171  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  27.34 
 
 		 619 aa  171  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2186  alpha amylase, catalytic region  27.27 
 
 		 576 aa  170  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  29.66 
 
 		 1942 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  31.67 
 
 		 462 aa  167  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  28.82 
 
 		 1017 aa  167  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  28.54 
 
 		 630 aa  166  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.55 
 
 		 1891 aa  161  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  29.63 
 
 		 574 aa  156  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  27.66 
 
 		 599 aa  153  8e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  28.36 
 
 		 604 aa  153  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.87 
 
 		 1975 aa  152  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  27.79 
 
 		 925 aa  151  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  28.93 
 
 		 559 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  27.81 
 
 		 1005 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  28.5 
 
 		 572 aa  147  5e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.85 
 
 		 2068 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  28.36 
 
 		 532 aa  144  6e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  28.18 
 
 		 552 aa  143  7e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  28.64 
 
 		 521 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  31.06 
 
 		 2638 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  26.16 
 
 		 635 aa  141  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  28.09 
 
 		 663 aa  140  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  26.09 
 
 		 623 aa  140  7e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  30.27 
 
 		 752 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  26.63 
 
 		 622 aa  137  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.44 
 
 		 1855 aa  136  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  28.63 
 
 		 606 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  28.63 
 
 		 606 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  26.86 
 
 		 639 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  28.07 
 
 		 490 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  27.35 
 
 		 472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  25.24 
 
 		 609 aa  134  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  26.3 
 
 		 644 aa  134  5e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  25.66 
 
 		 683 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  29.8 
 
 		 561 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  25.05 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  25.85 
 
 		 617 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  25.11 
 
 		 486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  28.6 
 
 		 622 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  27.6 
 
 		 582 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  26.57 
 
 		 528 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  25.51 
 
 		 481 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  26.57 
 
 		 528 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  28.32 
 
 		 644 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  28.51 
 
 		 723 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  28.57 
 
 		 527 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  26.98 
 
 		 631 aa  127  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  27.54 
 
 		 562 aa  127  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  25.15 
 
 		 665 aa  127  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  25.65 
 
 		 576 aa  127  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0833  Alpha amylase, catalytic region  26.22 
 
 		 617 aa  126  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  27.64 
 
 		 1847 aa  126  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  24.12 
 
 		 481 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  26.04 
 
 		 623 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  26.57 
 
 		 588 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  26.81 
 
 		 641 aa  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  25.94 
 
 		 606 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1743  alpha amylase, catalytic region  27.5 
 
 		 619 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  27.35 
 
 		 762 aa  124  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  25.98 
 
 		 533 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  25.42 
 
 		 774 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  25.62 
 
 		 765 aa  124  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  26.42 
 
 		 484 aa  123  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  25.52 
 
 		 610 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2313  alpha amylase, catalytic region  25.17 
 
 		 686 aa  121  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  25.51 
 
 		 786 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  25.39 
 
 		 486 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  25.36 
 
 		 778 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  27.45 
 
 		 584 aa  120  7e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  27.85 
 
 		 583 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  25.21 
 
 		 496 aa  119  9e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1398  alpha amylase, catalytic region  26.83 
 
 		 553 aa  119  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  24.26 
 
 		 481 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  26.81 
 
 		 493 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  26.55 
 
 		 477 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  24.86 
 
 		 488 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>