More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2636 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  100 
 
 		 617 aa  1260    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0833  Alpha amylase, catalytic region  83.14 
 
 		 617 aa  1074    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1743  alpha amylase, catalytic region  62.9 
 
 		 619 aa  740    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0104  alpha amylase catalytic region  51.38 
 
 		 653 aa  623  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1887  alpha amylase catalytic region  50.77 
 
 		 659 aa  611  1e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0951  alpha amylase, catalytic region  50.93 
 
 		 655 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0834  alpha amylase catalytic region  50.38 
 
 		 650 aa  587  1e-166  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  38.53 
 
 		 624 aa  360  6e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  38.55 
 
 		 662 aa  336  7.999999999999999e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  40.54 
 
 		 646 aa  332  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  27.69 
 
 		 527 aa  205  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  30.1 
 
 		 614 aa  171  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  30.59 
 
 		 609 aa  169  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  27.9 
 
 		 1005 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  28.57 
 
 		 600 aa  163  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  29.18 
 
 		 1942 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  26.93 
 
 		 838 aa  162  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  28.72 
 
 		 622 aa  161  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  29.03 
 
 		 925 aa  160  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  27.27 
 
 		 1017 aa  159  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  27.37 
 
 		 599 aa  158  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.44 
 
 		 1855 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  25.9 
 
 		 593 aa  157  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  28.14 
 
 		 836 aa  151  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.75 
 
 		 1975 aa  150  9e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  24.6 
 
 		 885 aa  144  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  25.24 
 
 		 511 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.76 
 
 		 1891 aa  140  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  25.05 
 
 		 510 aa  134  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  25.85 
 
 		 526 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  26.42 
 
 		 814 aa  130  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  25 
 
 		 604 aa  129  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.27 
 
 		 2068 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  26.43 
 
 		 723 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  25.7 
 
 		 620 aa  117  6.9999999999999995e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  24.47 
 
 		 739 aa  114  5e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  24.91 
 
 		 610 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  25.98 
 
 		 524 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  37.58 
 
 		 1021 aa  108  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  23.78 
 
 		 574 aa  106  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  24.4 
 
 		 767 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  20.43 
 
 		 586 aa  104  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  24.59 
 
 		 742 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  23.95 
 
 		 574 aa  103  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  20.27 
 
 		 586 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  20.4 
 
 		 586 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  20.27 
 
 		 586 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  20.27 
 
 		 586 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  20.27 
 
 		 586 aa  102  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  26.54 
 
 		 575 aa  102  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  35.47 
 
 		 484 aa  100  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  24.9 
 
 		 914 aa  98.2  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  24.12 
 
 		 462 aa  97.4  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  24.59 
 
 		 576 aa  97.4  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3131  maltodextrin glucosidase  25.3 
 
 		 609 aa  97.8  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3271  maltodextrin glucosidase  25.3 
 
 		 609 aa  97.4  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  22.8 
 
 		 649 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  23.11 
 
 		 642 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  24 
 
 		 623 aa  95.1  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  25.38 
 
 		 752 aa  94.7  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  23.68 
 
 		 765 aa  95.1  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  23.64 
 
 		 499 aa  94  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  31.25 
 
 		 2638 aa  94  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  23.09 
 
 		 774 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  22.76 
 
 		 583 aa  92.4  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  21.92 
 
 		 619 aa  91.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  23.54 
 
 		 778 aa  91.3  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  48.15 
 
 		 815 aa  90.5  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002001  periplasmic alpha-amylase  27.49 
 
 		 694 aa  90.5  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  23.6 
 
 		 786 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  23.38 
 
 		 665 aa  90.1  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  30.07 
 
 		 490 aa  89.7  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  23.74 
 
 		 561 aa  89.7  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  25.51 
 
 		 587 aa  88.6  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4048  periplasmic alpha-amylase precursor  26.36 
 
 		 675 aa  88.2  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.555384 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  23.89 
 
 		 607 aa  88.2  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  23.1 
 
 		 605 aa  88.2  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  24.01 
 
 		 509 aa  87.8  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  45.24 
 
 		 562 aa  87.4  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  26.11 
 
 		 522 aa  87.4  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  22.7 
 
 		 600 aa  87.4  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  23.74 
 
 		 566 aa  87  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  23.64 
 
 		 559 aa  86.3  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  27.25 
 
 		 533 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  23.02 
 
 		 605 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3878  periplasmic alpha-amylase precursor  25.84 
 
 		 675 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  24.6 
 
 		 586 aa  85.9  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4198  alpha amylase catalytic region  24.62 
 
 		 878 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  22.78 
 
 		 564 aa  85.9  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1398  alpha amylase, catalytic region  26.27 
 
 		 553 aa  85.9  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  23.02 
 
 		 605 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4068  periplasmic alpha-amylase precursor  33.33 
 
 		 676 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3206  alpha amylase catalytic region  23.63 
 
 		 605 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.608393  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  23.63 
 
 		 605 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  22.83 
 
 		 623 aa  85.1  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3133  periplasmic alpha-amylase precursor  35.67 
 
 		 687 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21513  normal  0.0265446 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4158  alpha amylase catalytic region  24.37 
 
 		 878 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  22.61 
 
 		 572 aa  84.7  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0480  maltodextrin glucosidase  23.63 
 
 		 604 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  30.36 
 
 		 686 aa  84.3  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>