More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH03660 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  100 
 
 		 606 aa  1235    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  100 
 
 		 606 aa  1235    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  41.85 
 
 		 561 aa  412  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  41.02 
 
 		 532 aa  330  4e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  38.35 
 
 		 490 aa  325  2e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  36.21 
 
 		 559 aa  317  3e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  36.74 
 
 		 552 aa  296  6e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  36.88 
 
 		 572 aa  296  6e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  38.78 
 
 		 521 aa  293  4e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  36.46 
 
 		 623 aa  291  2e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  34.85 
 
 		 462 aa  265  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  32.99 
 
 		 524 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  28.46 
 
 		 510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  28.14 
 
 		 511 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  28.57 
 
 		 838 aa  151  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  28.03 
 
 		 814 aa  151  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  25.48 
 
 		 885 aa  146  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  28.97 
 
 		 836 aa  144  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  30.26 
 
 		 1021 aa  136  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  29.59 
 
 		 526 aa  135  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  30.25 
 
 		 620 aa  134  3.9999999999999996e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.89 
 
 		 1891 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  29.81 
 
 		 484 aa  128  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  28.61 
 
 		 703 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  28.47 
 
 		 642 aa  124  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  26.3 
 
 		 649 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  27.27 
 
 		 599 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  25.79 
 
 		 1942 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  26.43 
 
 		 1017 aa  117  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  29.69 
 
 		 925 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  26.6 
 
 		 593 aa  115  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  28.85 
 
 		 2638 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.46 
 
 		 1975 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  28.61 
 
 		 752 aa  114  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  29.09 
 
 		 742 aa  113  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  26.62 
 
 		 1005 aa  113  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  26.48 
 
 		 723 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  26.86 
 
 		 690 aa  111  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  27.79 
 
 		 600 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  28.21 
 
 		 528 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  27.64 
 
 		 533 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  27.92 
 
 		 528 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.17 
 
 		 1855 aa  107  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  25.85 
 
 		 609 aa  106  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  26.91 
 
 		 686 aa  106  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  26.35 
 
 		 686 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  26.34 
 
 		 610 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  26.71 
 
 		 767 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  25.67 
 
 		 624 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  23.77 
 
 		 762 aa  99  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  25.57 
 
 		 622 aa  98.6  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  27.53 
 
 		 739 aa  97.4  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  25.17 
 
 		 614 aa  97.1  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  25.18 
 
 		 604 aa  96.3  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  26.09 
 
 		 571 aa  95.9  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  24.6 
 
 		 562 aa  92.8  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  25.57 
 
 		 622 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3951  periplasmic alpha-amylase precursor  28.43 
 
 		 676 aa  90.5  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  24.04 
 
 		 614 aa  89.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0150  periplasmic alpha-amylase precursor  27.05 
 
 		 676 aa  89.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  26.09 
 
 		 558 aa  89.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  23.99 
 
 		 2068 aa  89.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  24.06 
 
 		 475 aa  88.6  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  25.47 
 
 		 566 aa  87.4  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  25.43 
 
 		 635 aa  87  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  25.33 
 
 		 527 aa  86.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4068  periplasmic alpha-amylase precursor  27.46 
 
 		 676 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3894  periplasmic alpha-amylase precursor  27.11 
 
 		 676 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03423  periplasmic alpha-amylase precursor  27.09 
 
 		 676 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0139  alpha amylase catalytic region  27.09 
 
 		 676 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03374  hypothetical protein  27.09 
 
 		 676 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4947  periplasmic alpha-amylase precursor  26.41 
 
 		 676 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876495  normal  0.214816 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3774  periplasmic alpha-amylase precursor  27.09 
 
 		 676 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0143  periplasmic alpha-amylase precursor  27.09 
 
 		 676 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  24.16 
 
 		 589 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  25.05 
 
 		 687 aa  85.1  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0210  alpha amylase catalytic region  25.38 
 
 		 741 aa  85.1  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0538024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  23.65 
 
 		 575 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0016  periplasmic alpha-amylase precursor  25.05 
 
 		 687 aa  84.7  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3790  periplasmic alpha-amylase precursor  27.57 
 
 		 687 aa  84.3  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  23.71 
 
 		 587 aa  84.3  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3133  periplasmic alpha-amylase precursor  26.39 
 
 		 687 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21513  normal  0.0265446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  25.73 
 
 		 646 aa  84  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  23.6 
 
 		 588 aa  84  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  24.13 
 
 		 509 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  22.11 
 
 		 582 aa  81.6  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  22.14 
 
 		 815 aa  81.3  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  21.78 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  21.78 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  24.12 
 
 		 619 aa  80.9  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  22.16 
 
 		 610 aa  80.5  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4048  periplasmic alpha-amylase precursor  25.98 
 
 		 675 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.555384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2186  alpha amylase, catalytic region  24.77 
 
 		 576 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3987  periplasmic alpha-amylase precursor  26.15 
 
 		 675 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0833  Alpha amylase, catalytic region  25.5 
 
 		 617 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  23.84 
 
 		 499 aa  79.7  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3942  periplasmic alpha-amylase precursor  25.62 
 
 		 675 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.973795 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0054  periplasmic alpha-amylase precursor  26.37 
 
 		 688 aa  79.3  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3862  periplasmic alpha-amylase precursor  25.62 
 
 		 675 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3878  periplasmic alpha-amylase precursor  26.15 
 
 		 675 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>