More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0197 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  54.38 
 
 		 1942 aa  704    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  60.52 
 
 		 1005 aa  1024    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 925 aa  1863    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  59.43 
 
 		 1017 aa  1041    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  45.49 
 
 		 1891 aa  619  1e-176  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  44.09 
 
 		 1975 aa  619  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  48.77 
 
 		 1855 aa  572  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  51.72 
 
 		 600 aa  532  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  47.33 
 
 		 609 aa  521  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  44.09 
 
 		 723 aa  497  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  46.02 
 
 		 2068 aa  483  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  46.27 
 
 		 622 aa  473  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  50.57 
 
 		 614 aa  472  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  42.07 
 
 		 599 aa  451  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  44.88 
 
 		 593 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  41.96 
 
 		 604 aa  423  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  27.97 
 
 		 838 aa  211  4e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  30.21 
 
 		 620 aa  189  2e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  29.3 
 
 		 510 aa  183  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  29.43 
 
 		 511 aa  179  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  28.17 
 
 		 885 aa  178  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  27.34 
 
 		 814 aa  175  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  27.65 
 
 		 836 aa  171  8e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1743  alpha amylase, catalytic region  28.89 
 
 		 619 aa  164  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  29.03 
 
 		 617 aa  159  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0833  Alpha amylase, catalytic region  27.5 
 
 		 617 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  28.92 
 
 		 610 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  29.48 
 
 		 564 aa  155  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  28.72 
 
 		 587 aa  152  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  30.12 
 
 		 528 aa  150  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  28.98 
 
 		 662 aa  150  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  27.79 
 
 		 526 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  27.94 
 
 		 2638 aa  150  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  29.19 
 
 		 624 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  30.12 
 
 		 528 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  27.39 
 
 		 571 aa  149  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  27.58 
 
 		 582 aa  147  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0951  alpha amylase, catalytic region  27.22 
 
 		 655 aa  147  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0104  alpha amylase catalytic region  27.53 
 
 		 653 aa  146  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  30.58 
 
 		 524 aa  145  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  29.16 
 
 		 646 aa  145  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1887  alpha amylase catalytic region  26.41 
 
 		 659 aa  144  6e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  28.71 
 
 		 533 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  30.54 
 
 		 1021 aa  143  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  27.62 
 
 		 752 aa  142  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0834  alpha amylase catalytic region  26.77 
 
 		 650 aa  140  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  29.4 
 
 		 490 aa  139  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  28.75 
 
 		 690 aa  138  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  27.82 
 
 		 527 aa  138  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  28.03 
 
 		 642 aa  137  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  26.57 
 
 		 462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  23.05 
 
 		 610 aa  134  9e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  22.69 
 
 		 610 aa  134  9e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  29.71 
 
 		 623 aa  133  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  29.36 
 
 		 686 aa  133  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  26.23 
 
 		 649 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  27.64 
 
 		 589 aa  132  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  28.15 
 
 		 687 aa  131  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3878  periplasmic alpha-amylase precursor  30.02 
 
 		 675 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3894  periplasmic alpha-amylase precursor  28.54 
 
 		 676 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4068  periplasmic alpha-amylase precursor  29.36 
 
 		 676 aa  129  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002001  periplasmic alpha-amylase  27.71 
 
 		 694 aa  129  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03423  periplasmic alpha-amylase precursor  28.32 
 
 		 676 aa  129  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0139  alpha amylase catalytic region  28.32 
 
 		 676 aa  129  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0143  periplasmic alpha-amylase precursor  28.32 
 
 		 676 aa  129  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03374  hypothetical protein  28.32 
 
 		 676 aa  129  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3774  periplasmic alpha-amylase precursor  28.32 
 
 		 676 aa  129  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3862  periplasmic alpha-amylase precursor  30.49 
 
 		 675 aa  128  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0150  periplasmic alpha-amylase precursor  29.45 
 
 		 676 aa  128  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  25.52 
 
 		 477 aa  128  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3942  periplasmic alpha-amylase precursor  29.95 
 
 		 675 aa  127  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.973795 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4947  periplasmic alpha-amylase precursor  28.1 
 
 		 676 aa  126  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876495  normal  0.214816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  28.94 
 
 		 635 aa  127  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0054  periplasmic alpha-amylase precursor  27.8 
 
 		 688 aa  126  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3987  periplasmic alpha-amylase precursor  29.57 
 
 		 675 aa  126  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  27.42 
 
 		 509 aa  126  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3951  periplasmic alpha-amylase precursor  30 
 
 		 676 aa  126  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4048  periplasmic alpha-amylase precursor  29.57 
 
 		 675 aa  126  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.555384 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  27.12 
 
 		 630 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  26.52 
 
 		 566 aa  125  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  26.7 
 
 		 588 aa  125  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  24.08 
 
 		 574 aa  124  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  26.44 
 
 		 589 aa  123  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1398  alpha amylase, catalytic region  26.61 
 
 		 553 aa  123  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2186  alpha amylase, catalytic region  24 
 
 		 576 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  22.43 
 
 		 586 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  26.26 
 
 		 552 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  26.09 
 
 		 486 aa  119  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  28.18 
 
 		 572 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0016  periplasmic alpha-amylase precursor  27.63 
 
 		 687 aa  117  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24938  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  27.81 
 
 		 521 aa  117  7.999999999999999e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  28.14 
 
 		 623 aa  117  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  29.15 
 
 		 561 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  26.48 
 
 		 574 aa  116  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3790  periplasmic alpha-amylase precursor  27.46 
 
 		 687 aa  116  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  23.88 
 
 		 619 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  25.54 
 
 		 742 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  27.17 
 
 		 609 aa  114  9e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  29.69 
 
 		 606 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  29.69 
 
 		 606 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>