More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1179 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  95.5 
 
 
422 aa  842    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
422 aa  870    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  37.84 
 
 
426 aa  309  5e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  37.31 
 
 
426 aa  280  3e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  36.32 
 
 
434 aa  247  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  38.06 
 
 
463 aa  243  5e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  35.88 
 
 
459 aa  229  6e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  35.58 
 
 
450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  33.67 
 
 
467 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  36.04 
 
 
478 aa  217  4e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  31.83 
 
 
459 aa  207  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  27.91 
 
 
460 aa  168  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  26.32 
 
 
562 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  25.38 
 
 
728 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  26.49 
 
 
511 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  29.79 
 
 
687 aa  123  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  25.13 
 
 
1048 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  27.62 
 
 
510 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1052  alpha amylase catalytic region  25.06 
 
 
674 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  27.95 
 
 
589 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  26.28 
 
 
588 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3868  alpha amylase catalytic region  28.04 
 
 
752 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  26.79 
 
 
586 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  27.58 
 
 
479 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  25.9 
 
 
586 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  25.83 
 
 
586 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  26.36 
 
 
586 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  26.36 
 
 
586 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  26.36 
 
 
586 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  26.36 
 
 
586 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  24.35 
 
 
582 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  26.1 
 
 
586 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  27.58 
 
 
524 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  24.07 
 
 
576 aa  107  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  25.12 
 
 
758 aa  107  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2991  alpha amylase catalytic region  27.27 
 
 
479 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  25.12 
 
 
586 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  25.39 
 
 
586 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  27.23 
 
 
586 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.79 
 
 
1433 aa  103  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  26.35 
 
 
493 aa  103  5e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  26.1 
 
 
499 aa  103  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  26.51 
 
 
490 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  28.71 
 
 
484 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  28.7 
 
 
589 aa  101  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  26.94 
 
 
515 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0930  Alpha amylase, catalytic region  29.01 
 
 
402 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  26.25 
 
 
565 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  26.37 
 
 
462 aa  100  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2652  alpha amylase catalytic region  29.85 
 
 
682 aa  100  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  23.53 
 
 
635 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1302  alpha amylase catalytic region  27.01 
 
 
541 aa  97.8  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  26.23 
 
 
762 aa  97.8  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  27.08 
 
 
1021 aa  97.4  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  23.41 
 
 
522 aa  97.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0393  alpha amylase catalytic region  25.76 
 
 
735 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0232636 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  25.2 
 
 
593 aa  95.9  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1154  alpha amylase catalytic region  31.84 
 
 
752 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0897  alpha-amylase family protein  25.56 
 
 
534 aa  95.1  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0018  alpha amylase catalytic region  26.41 
 
 
485 aa  95.5  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  24.21 
 
 
509 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  26.47 
 
 
459 aa  94  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6072  alpha amylase catalytic region  36.68 
 
 
659 aa  94  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  25.71 
 
 
420 aa  93.6  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2417  alpha amylase catalytic region  32.2 
 
 
816 aa  93.6  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00733114  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  27.07 
 
 
584 aa  93.6  6e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  22.69 
 
 
838 aa  93.2  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  24.1 
 
 
541 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  24.34 
 
 
486 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  26.45 
 
 
575 aa  92.8  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  24.85 
 
 
486 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  31.15 
 
 
1122 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1076  alpha amylase domain-containing protein  23.71 
 
 
685 aa  92  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.819574 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  24.85 
 
 
486 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  25.73 
 
 
654 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3800  alpha amylase catalytic region  27.3 
 
 
435 aa  90.9  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.345712  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  24.94 
 
 
481 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  24.82 
 
 
583 aa  90.1  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  23.6 
 
 
477 aa  89.7  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  26.4 
 
 
575 aa  89.7  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  33.73 
 
 
1122 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  24.87 
 
 
574 aa  89.7  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4100  alpha amylase catalytic region  30.3 
 
 
687 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0191  glycosy hydrolase family protein  23.9 
 
 
534 aa  89.4  1e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3071  alpha amylase catalytic region  27.92 
 
 
674 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224313  normal  0.685148 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1604  Alpha amylase, catalytic region  27.49 
 
 
688 aa  89  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0314  alpha amylase, catalytic region  28.53 
 
 
646 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  24.46 
 
 
527 aa  89  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  24.39 
 
 
493 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1097  alpha amylase catalytic region  28.47 
 
 
716 aa  89  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.992454  hitchhiker  0.0010737 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1279  alpha amylase catalytic region  31.93 
 
 
666 aa  88.6  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0559691  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  27.67 
 
 
258 aa  87.8  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  23.12 
 
 
600 aa  87.8  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  23.92 
 
 
541 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0138  alpha amylase, catalytic region  22.28 
 
 
732 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  24.76 
 
 
610 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1105  alpha amylase catalytic region  30.74 
 
 
705 aa  87.4  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340579  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  24.03 
 
 
586 aa  87  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1419  alpha amylase, catalytic region  28.4 
 
 
708 aa  87  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.624823 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0331  alpha amylase catalytic region  32.16 
 
 
652 aa  86.7  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>