More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0377 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  72.26 
 
 		 686 aa  1038    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  71.22 
 
 		 686 aa  1028    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  100 
 
 		 690 aa  1438    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002001  periplasmic alpha-amylase  44.93 
 
 		 694 aa  595  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  44.04 
 
 		 687 aa  568  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3790  periplasmic alpha-amylase precursor  44.04 
 
 		 687 aa  566  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3133  periplasmic alpha-amylase precursor  45.92 
 
 		 687 aa  565  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21513  normal  0.0265446 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0054  periplasmic alpha-amylase precursor  45.97 
 
 		 688 aa  562  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0016  periplasmic alpha-amylase precursor  45.18 
 
 		 687 aa  565  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24938  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0150  periplasmic alpha-amylase precursor  45.4 
 
 		 676 aa  556  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3942  periplasmic alpha-amylase precursor  43.47 
 
 		 675 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.973795 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3862  periplasmic alpha-amylase precursor  43.61 
 
 		 675 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3894  periplasmic alpha-amylase precursor  43.18 
 
 		 676 aa  551  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3987  periplasmic alpha-amylase precursor  43.47 
 
 		 675 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03423  periplasmic alpha-amylase precursor  43.18 
 
 		 676 aa  547  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0139  alpha amylase catalytic region  43.18 
 
 		 676 aa  546  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0143  periplasmic alpha-amylase precursor  43.18 
 
 		 676 aa  546  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03374  hypothetical protein  43.18 
 
 		 676 aa  547  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4048  periplasmic alpha-amylase precursor  43.61 
 
 		 675 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.555384 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3774  periplasmic alpha-amylase precursor  43.18 
 
 		 676 aa  546  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4068  periplasmic alpha-amylase precursor  43.32 
 
 		 676 aa  546  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3878  periplasmic alpha-amylase precursor  43.47 
 
 		 675 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4947  periplasmic alpha-amylase precursor  43.18 
 
 		 676 aa  547  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876495  normal  0.214816 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3951  periplasmic alpha-amylase precursor  42.53 
 
 		 676 aa  545  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5156  alpha amylase catalytic region  44.19 
 
 		 631 aa  420  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.794447 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1398  alpha amylase, catalytic region  34.51 
 
 		 553 aa  275  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  32.73 
 
 		 566 aa  257  5e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2966  periplasmic alpha-amylase precursor  30.63 
 
 		 554 aa  254  4.0000000000000004e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0359773  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  32.93 
 
 		 528 aa  207  5e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  32.73 
 
 		 528 aa  206  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  31.72 
 
 		 533 aa  197  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  29.61 
 
 		 2638 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  28.74 
 
 		 752 aa  174  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  29.02 
 
 		 510 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  27.59 
 
 		 511 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.34 
 
 		 1891 aa  157  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  28.72 
 
 		 1021 aa  154  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  28.16 
 
 		 1942 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  27.16 
 
 		 582 aa  146  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  28 
 
 		 1005 aa  144  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  26.83 
 
 		 814 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  26.69 
 
 		 885 aa  141  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  28.75 
 
 		 925 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  25.63 
 
 		 836 aa  139  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.44 
 
 		 1855 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  31.33 
 
 		 600 aa  139  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  27.54 
 
 		 610 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  27 
 
 		 609 aa  137  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  26.06 
 
 		 609 aa  136  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  27.54 
 
 		 622 aa  136  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  26.76 
 
 		 604 aa  135  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  25.55 
 
 		 575 aa  134  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.85 
 
 		 1975 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  25.6 
 
 		 599 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  27.51 
 
 		 614 aa  131  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  31.03 
 
 		 723 aa  131  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  26.96 
 
 		 477 aa  130  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  25.78 
 
 		 838 aa  130  7.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  24.78 
 
 		 1017 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  25.3 
 
 		 462 aa  128  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  25.05 
 
 		 619 aa  129  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  30.28 
 
 		 593 aa  127  9e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  26.73 
 
 		 484 aa  124  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  27.16 
 
 		 620 aa  124  6e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  25.45 
 
 		 586 aa  124  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  25.45 
 
 		 586 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  25.28 
 
 		 586 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  24.3 
 
 		 1643 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  26.31 
 
 		 488 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  26.16 
 
 		 493 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  25.27 
 
 		 586 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  23.39 
 
 		 574 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  25.27 
 
 		 586 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  25.27 
 
 		 586 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  25.27 
 
 		 586 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  24.95 
 
 		 589 aa  120  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  25.23 
 
 		 586 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  25.09 
 
 		 586 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  26.64 
 
 		 584 aa  119  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  26.83 
 
 		 587 aa  118  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  25.93 
 
 		 589 aa  117  8.999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  22.81 
 
 		 649 aa  117  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  24.3 
 
 		 472 aa  117  8.999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  24.49 
 
 		 588 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  26.92 
 
 		 532 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  23.65 
 
 		 586 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  23.42 
 
 		 586 aa  117  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  24.59 
 
 		 639 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  26.25 
 
 		 484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  23.94 
 
 		 610 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  24.3 
 
 		 593 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  24.86 
 
 		 586 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  25.1 
 
 		 481 aa  115  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  25 
 
 		 610 aa  115  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  26.22 
 
 		 481 aa  114  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  25.85 
 
 		 486 aa  112  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  25.55 
 
 		 623 aa  111  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  23.56 
 
 		 595 aa  111  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  26.86 
 
 		 606 aa  110  6e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  26.86 
 
 		 606 aa  110  6e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>