More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0827 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 687 aa  1421    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  48.87 
 
 		 524 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2991  alpha amylase catalytic region  49.55 
 
 		 479 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  49.32 
 
 		 479 aa  412  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  31.1 
 
 		 758 aa  193  9e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  30.35 
 
 		 728 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  30.04 
 
 		 515 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  31.83 
 
 		 459 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  30.02 
 
 		 459 aa  161  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  27.84 
 
 		 589 aa  158  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  30.79 
 
 		 576 aa  156  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2652  alpha amylase catalytic region  28.74 
 
 		 682 aa  156  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  27.58 
 
 		 583 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  28.79 
 
 		 450 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  28.75 
 
 		 434 aa  153  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  28.34 
 
 		 588 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  31.98 
 
 		 510 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1154  alpha amylase catalytic region  26.37 
 
 		 752 aa  149  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  29.88 
 
 		 463 aa  148  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  29.9 
 
 		 578 aa  147  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  31.78 
 
 		 538 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  30.31 
 
 		 635 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  27.47 
 
 		 644 aa  145  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  33.11 
 
 		 511 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1052  alpha amylase catalytic region  28.38 
 
 		 674 aa  145  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  28.37 
 
 		 586 aa  145  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  27.68 
 
 		 536 aa  144  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  28.05 
 
 		 587 aa  144  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  27.12 
 
 		 477 aa  143  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  27.62 
 
 		 586 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  31.2 
 
 		 540 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  29.25 
 
 		 622 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  30.35 
 
 		 499 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  30.31 
 
 		 472 aa  141  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  28.41 
 
 		 574 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  26.9 
 
 		 586 aa  140  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  29.21 
 
 		 467 aa  140  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  31.15 
 
 		 542 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  28.08 
 
 		 584 aa  139  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  26.91 
 
 		 553 aa  139  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  26.5 
 
 		 586 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  26.87 
 
 		 481 aa  138  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  25.99 
 
 		 575 aa  138  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  29.03 
 
 		 493 aa  137  5e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  26.5 
 
 		 586 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  31.9 
 
 		 541 aa  137  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  27.9 
 
 		 529 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  29.94 
 
 		 654 aa  136  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  29.28 
 
 		 549 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  29.82 
 
 		 610 aa  136  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  27.4 
 
 		 478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1414  alpha amylase catalytic region  28.75 
 
 		 703 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0623392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  28.67 
 
 		 486 aa  135  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  26.21 
 
 		 586 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  26.21 
 
 		 586 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  26.21 
 
 		 586 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  26.21 
 
 		 586 aa  134  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  30.77 
 
 		 538 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  25.81 
 
 		 562 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  26.21 
 
 		 586 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  25.98 
 
 		 586 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  26.21 
 
 		 586 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  28.67 
 
 		 496 aa  131  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0214  alpha-glucosidase  29.2 
 
 		 552 aa  131  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417345 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  28.57 
 
 		 460 aa  131  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  26.54 
 
 		 481 aa  131  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  29.66 
 
 		 532 aa  130  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  30.67 
 
 		 541 aa  130  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  25.66 
 
 		 582 aa  130  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  29.79 
 
 		 422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  30.54 
 
 		 528 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  39.02 
 
 		 533 aa  129  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  27.37 
 
 		 538 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  29.21 
 
 		 574 aa  128  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  27.91 
 
 		 593 aa  128  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  27.53 
 
 		 560 aa  128  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  27 
 
 		 522 aa  128  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  27.45 
 
 		 583 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  26.14 
 
 		 582 aa  127  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  32.54 
 
 		 1116 aa  127  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  30.38 
 
 		 448 aa  127  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  38.22 
 
 		 258 aa  127  8.000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  27.62 
 
 		 509 aa  127  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  32.14 
 
 		 1116 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  27.81 
 
 		 589 aa  127  9e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  29.33 
 
 		 555 aa  126  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  32.69 
 
 		 1121 aa  126  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  27.27 
 
 		 610 aa  126  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  26.04 
 
 		 554 aa  126  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  29.33 
 
 		 555 aa  126  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  29.06 
 
 		 575 aa  127  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  31.21 
 
 		 715 aa  125  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  30.33 
 
 		 541 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  27.25 
 
 		 481 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  30.33 
 
 		 541 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  35.47 
 
 		 543 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  26.65 
 
 		 487 aa  125  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  28.23 
 
 		 608 aa  124  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  28.72 
 
 		 422 aa  124  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  31.65 
 
 		 595 aa  124  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>