More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3894 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3790  periplasmic alpha-amylase precursor  70.15 
 
 		 687 aa  979    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3951  periplasmic alpha-amylase precursor  96.89 
 
 		 676 aa  1367    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03423  periplasmic alpha-amylase precursor  97.19 
 
 		 676 aa  1373    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0139  alpha amylase catalytic region  97.34 
 
 		 676 aa  1373    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  70.3 
 
 		 687 aa  982    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0016  periplasmic alpha-amylase precursor  70.46 
 
 		 687 aa  980    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24938  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3942  periplasmic alpha-amylase precursor  81.21 
 
 		 675 aa  1165    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.973795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3987  periplasmic alpha-amylase precursor  81.07 
 
 		 675 aa  1164    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3894  periplasmic alpha-amylase precursor  100 
 
 		 676 aa  1404    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4048  periplasmic alpha-amylase precursor  81.21 
 
 		 675 aa  1163    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.555384 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0054  periplasmic alpha-amylase precursor  70.3 
 
 		 688 aa  987    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0143  periplasmic alpha-amylase precursor  97.34 
 
 		 676 aa  1373    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002001  periplasmic alpha-amylase  53.4 
 
 		 694 aa  745    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4068  periplasmic alpha-amylase precursor  97.78 
 
 		 676 aa  1375    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3878  periplasmic alpha-amylase precursor  81.51 
 
 		 675 aa  1169    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4947  periplasmic alpha-amylase precursor  97.93 
 
 		 676 aa  1380    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876495  normal  0.214816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3862  periplasmic alpha-amylase precursor  81.66 
 
 		 675 aa  1170    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3774  periplasmic alpha-amylase precursor  97.34 
 
 		 676 aa  1373    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0150  periplasmic alpha-amylase precursor  79.94 
 
 		 676 aa  1135    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03374  hypothetical protein  97.19 
 
 		 676 aa  1373    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3133  periplasmic alpha-amylase precursor  56.18 
 
 		 687 aa  599  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21513  normal  0.0265446 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  44.55 
 
 		 690 aa  548  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  42.34 
 
 		 686 aa  543  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  42.21 
 
 		 686 aa  542  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5156  alpha amylase catalytic region  51.2 
 
 		 631 aa  473  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.794447 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2966  periplasmic alpha-amylase precursor  33.8 
 
 		 554 aa  283  7.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0359773  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  36.01 
 
 		 566 aa  280  6e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1398  alpha amylase, catalytic region  34.53 
 
 		 553 aa  277  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  32.48 
 
 		 528 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  33.27 
 
 		 533 aa  189  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  32.08 
 
 		 528 aa  188  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  27.54 
 
 		 2638 aa  154  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.36 
 
 		 1891 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  28.02 
 
 		 609 aa  144  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  28.65 
 
 		 1942 aa  141  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  26.13 
 
 		 1005 aa  137  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  26.06 
 
 		 614 aa  137  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.01 
 
 		 2068 aa  136  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.6 
 
 		 1975 aa  134  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.19 
 
 		 1855 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  25.83 
 
 		 604 aa  130  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  26.71 
 
 		 600 aa  130  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  25.82 
 
 		 1017 aa  130  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  28.54 
 
 		 925 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  25.96 
 
 		 723 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  24.71 
 
 		 836 aa  129  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  30.97 
 
 		 599 aa  125  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  24.95 
 
 		 814 aa  125  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  24.32 
 
 		 593 aa  122  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  26.65 
 
 		 481 aa  120  7.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  22.54 
 
 		 838 aa  120  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  39.61 
 
 		 752 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  24.31 
 
 		 582 aa  114  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  25.45 
 
 		 472 aa  110  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  25.7 
 
 		 586 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  21.91 
 
 		 574 aa  108  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  42.54 
 
 		 622 aa  107  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  23.4 
 
 		 885 aa  107  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  36.09 
 
 		 511 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  37.59 
 
 		 510 aa  106  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  29.43 
 
 		 490 aa  103  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  42.52 
 
 		 620 aa  103  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  24.69 
 
 		 589 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  23.59 
 
 		 588 aa  102  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  22.16 
 
 		 649 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  23.38 
 
 		 589 aa  101  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  39.23 
 
 		 610 aa  99.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  24.44 
 
 		 477 aa  99.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  24.71 
 
 		 496 aa  98.6  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  31.13 
 
 		 1021 aa  97.8  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  27.33 
 
 		 624 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  25.15 
 
 		 587 aa  98.2  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  21.83 
 
 		 515 aa  97.8  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  24.84 
 
 		 642 aa  97.4  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  24.9 
 
 		 484 aa  96.7  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  24.47 
 
 		 586 aa  95.9  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  38.64 
 
 		 524 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  23.82 
 
 		 600 aa  95.9  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  24.03 
 
 		 584 aa  95.9  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  22.4 
 
 		 493 aa  95.9  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  24.22 
 
 		 742 aa  95.1  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  22.11 
 
 		 586 aa  94.7  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  22.48 
 
 		 462 aa  94.4  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  26.32 
 
 		 623 aa  94.4  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  23.91 
 
 		 526 aa  94.4  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2667  alpha amylase catalytic region  39.55 
 
 		 853 aa  94  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.749886 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  22.11 
 
 		 586 aa  94  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0148  alpha amylase catalytic region  39.29 
 
 		 878 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0174055 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  28.37 
 
 		 532 aa  93.6  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0104  alpha amylase catalytic region  27.83 
 
 		 653 aa  93.6  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  23.25 
 
 		 488 aa  92.8  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  21.09 
 
 		 575 aa  92.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  37.41 
 
 		 654 aa  92.8  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  23.93 
 
 		 593 aa  91.7  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  34.15 
 
 		 646 aa  91.7  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  24.05 
 
 		 481 aa  91.3  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  23.94 
 
 		 486 aa  91.3  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  34.36 
 
 		 662 aa  91.3  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4198  alpha amylase catalytic region  31 
 
 		 878 aa  90.5  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4158  alpha amylase catalytic region  31 
 
 		 878 aa  90.5  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>