More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1399 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  56.66 
 
 		 623 aa  751    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  57.52 
 
 		 609 aa  737    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1399  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 620 aa  1290    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  41.1 
 
 		 631 aa  513  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  40.19 
 
 		 654 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  39.39 
 
 		 619 aa  501  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  37.89 
 
 		 665 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  41.59 
 
 		 644 aa  496  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2211  alpha amylase, catalytic region  38.1 
 
 		 665 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2313  alpha amylase, catalytic region  37.71 
 
 		 686 aa  486  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  39.4 
 
 		 641 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  37.3 
 
 		 639 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  36.5 
 
 		 765 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  35.51 
 
 		 774 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  35.26 
 
 		 778 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  34.93 
 
 		 786 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  39.31 
 
 		 630 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  36.17 
 
 		 683 aa  421  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  33.28 
 
 		 610 aa  337  5e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  29.75 
 
 		 510 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  29.55 
 
 		 511 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  29.38 
 
 		 582 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  27.44 
 
 		 574 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  27.42 
 
 		 588 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  32.54 
 
 		 587 aa  154  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  29.04 
 
 		 589 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  30.42 
 
 		 589 aa  150  7e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  27.99 
 
 		 586 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  25.29 
 
 		 481 aa  149  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  27.78 
 
 		 586 aa  147  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  27.8 
 
 		 586 aa  146  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  27.82 
 
 		 477 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  25.88 
 
 		 484 aa  141  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  27.2 
 
 		 593 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  25.57 
 
 		 586 aa  140  8.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  25.68 
 
 		 836 aa  139  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  26.92 
 
 		 586 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  26.43 
 
 		 493 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  27.63 
 
 		 583 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  24.12 
 
 		 528 aa  137  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  26.38 
 
 		 814 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  25.77 
 
 		 610 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  26.93 
 
 		 584 aa  136  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  24.12 
 
 		 528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  29.84 
 
 		 838 aa  135  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  27.18 
 
 		 586 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  27.18 
 
 		 586 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  27.18 
 
 		 586 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  29.22 
 
 		 586 aa  134  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  28.26 
 
 		 586 aa  134  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  25.91 
 
 		 599 aa  133  9e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  26.99 
 
 		 586 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  26.81 
 
 		 509 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  28.2 
 
 		 1021 aa  132  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  25.15 
 
 		 610 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.14 
 
 		 1855 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  27.22 
 
 		 620 aa  131  4.0000000000000003e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  25.7 
 
 		 564 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  26.56 
 
 		 586 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  27.23 
 
 		 486 aa  130  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  25.69 
 
 		 588 aa  130  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  26.88 
 
 		 885 aa  130  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  27.89 
 
 		 578 aa  130  9.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  30.64 
 
 		 499 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  26.24 
 
 		 524 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  29.07 
 
 		 2638 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  28.35 
 
 		 752 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  26.16 
 
 		 472 aa  128  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  26.5 
 
 		 575 aa  128  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.24 
 
 		 1891 aa  127  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  30 
 
 		 583 aa  127  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  28.8 
 
 		 574 aa  127  5e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  24.02 
 
 		 533 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  28.69 
 
 		 522 aa  127  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  25.11 
 
 		 481 aa  127  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  26.96 
 
 		 595 aa  126  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  27.48 
 
 		 481 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  24.5 
 
 		 496 aa  126  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  23.46 
 
 		 635 aa  125  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.47 
 
 		 2068 aa  124  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  24.52 
 
 		 484 aa  121  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  25.42 
 
 		 614 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  27.33 
 
 		 593 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  24.57 
 
 		 481 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  26.12 
 
 		 562 aa  120  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  27.93 
 
 		 622 aa  120  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  24.2 
 
 		 541 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  25.43 
 
 		 486 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  24.95 
 
 		 663 aa  120  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  27.72 
 
 		 481 aa  119  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  23.99 
 
 		 545 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  28.06 
 
 		 575 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  25.24 
 
 		 486 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  24.2 
 
 		 541 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  26.78 
 
 		 715 aa  118  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  25.34 
 
 		 654 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  23.76 
 
 		 571 aa  118  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  27.23 
 
 		 493 aa  118  3.9999999999999997e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  26.33 
 
 		 515 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  26.01 
 
 		 649 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>