258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2157 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  100 
 
 
1141 aa  2237    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  63.57 
 
 
916 aa  511  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  48.49 
 
 
675 aa  496  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  53.16 
 
 
1439 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  55.99 
 
 
1496 aa  323  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  50.12 
 
 
482 aa  313  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  45.6 
 
 
1047 aa  278  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1307  Allergen V5/Tpx-1 family protein  64.49 
 
 
440 aa  277  7e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000813036  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  40.5 
 
 
1096 aa  240  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  39.07 
 
 
1219 aa  234  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2061  hypothetical protein  40.3 
 
 
356 aa  219  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264827  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  52.67 
 
 
777 aa  219  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  36.2 
 
 
499 aa  187  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  44.85 
 
 
827 aa  186  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.4 
 
 
587 aa  157  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.97 
 
 
587 aa  146  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  35.52 
 
 
1537 aa  140  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0507  serine protease  43.24 
 
 
606 aa  139  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0788  thermostable serine protease  36.84 
 
 
606 aa  124  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282797  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.42 
 
 
612 aa  123  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2223  peptidase-like protein  37.02 
 
 
343 aa  115  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1888  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.7 
 
 
626 aa  115  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67203  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  55.46 
 
 
549 aa  112  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  31.84 
 
 
3562 aa  113  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.06 
 
 
626 aa  111  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  37.7 
 
 
1152 aa  105  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3562  filamentous hemeagglutinin outer membrane protein  41.7 
 
 
577 aa  101  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  33.47 
 
 
1146 aa  100  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  32.57 
 
 
2178 aa  98.2  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  52.17 
 
 
491 aa  96.7  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.29 
 
 
6885 aa  92.8  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  30.05 
 
 
744 aa  92  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  34.65 
 
 
1406 aa  89.4  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  25.54 
 
 
2402 aa  86.3  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  41.75 
 
 
2002 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  41.67 
 
 
331 aa  84  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  34.07 
 
 
1538 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  37.77 
 
 
1053 aa  80.5  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  51.82 
 
 
534 aa  79.3  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  30.49 
 
 
1452 aa  79  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  32.02 
 
 
1059 aa  78.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  35.36 
 
 
1127 aa  78.2  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  46.94 
 
 
2192 aa  78.2  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  27.11 
 
 
4678 aa  77.8  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  27.94 
 
 
4430 aa  77.4  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  35.42 
 
 
1054 aa  75.9  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  35.14 
 
 
1127 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  36 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  29.79 
 
 
1332 aa  73.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  26.99 
 
 
680 aa  73.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0648  Fibronectin type III domain protein  27.23 
 
 
1795 aa  72.8  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.034686  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  36.84 
 
 
1601 aa  72.4  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  27.85 
 
 
12684 aa  72.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  34.78 
 
 
14944 aa  71.6  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  27.98 
 
 
846 aa  71.6  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  31.41 
 
 
2170 aa  70.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  35.43 
 
 
1123 aa  71.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  34.25 
 
 
1127 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  24.92 
 
 
3516 aa  67.8  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  32.94 
 
 
1285 aa  67.4  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  32.43 
 
 
1127 aa  66.6  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  31.79 
 
 
1129 aa  67  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  49.09 
 
 
553 aa  66.6  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  26.26 
 
 
846 aa  66.6  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2709  BNR domain-containing protein  24.48 
 
 
1554 aa  65.5  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  34.27 
 
 
1051 aa  65.9  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  26.86 
 
 
4689 aa  65.5  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  29.58 
 
 
1224 aa  65.5  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2742  CheC domain protein  30.97 
 
 
288 aa  64.3  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00482165  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2573  hypothetical protein  30.11 
 
 
249 aa  64.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  24.67 
 
 
1224 aa  63.5  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  32 
 
 
846 aa  62.4  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  31.68 
 
 
5442 aa  62.4  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0628  hypothetical protein  28.97 
 
 
1457 aa  62  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  32.2 
 
 
1887 aa  61.6  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0875  serine protease  32.38 
 
 
663 aa  61.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.923473  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05607  hypothetical protein  28.57 
 
 
962 aa  61.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1482  protein of unknown function DUF214  24.95 
 
 
1411 aa  60.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.356591  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  38.54 
 
 
1031 aa  60.1  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3960  hypothetical protein  32.67 
 
 
168 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  29.21 
 
 
1695 aa  60.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  26.58 
 
 
5561 aa  59.3  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.08 
 
 
5216 aa  59.3  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  53.33 
 
 
561 aa  59.3  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  33.49 
 
 
1247 aa  58.9  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  26.15 
 
 
5743 aa  58.5  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2605  hypothetical protein  28.42 
 
 
218 aa  58.5  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.103693 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  29.79 
 
 
831 aa  58.5  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  40.91 
 
 
963 aa  58.5  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1688  hypothetical protein  38.75 
 
 
1035 aa  58.2  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  26.67 
 
 
5561 aa  58.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  38.89 
 
 
743 aa  58.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  27.8 
 
 
458 aa  57.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  27.61 
 
 
4761 aa  57.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  29.74 
 
 
895 aa  58.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  25.76 
 
 
5561 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  33.55 
 
 
1474 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2985  hypothetical protein  34.31 
 
 
249 aa  57.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0275079  hitchhiker  0.000737309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  29.42 
 
 
3586 aa  57.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2922  hypothetical protein  35.77 
 
 
265 aa  58.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0126105  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>