More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0372 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  100 
 
 		 340 aa  683    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1737  response regulator receiver domain-containing protein  54.91 
 
 		 277 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.570794  normal  0.630295 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1220  response regulator  51.99 
 
 		 277 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2299  response regulator receiver protein  54.01 
 
 		 275 aa  310  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0218685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1135  response regulator receiver protein  48.34 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3127  response regulator receiver protein  48.71 
 
 		 283 aa  263  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0978  response regulator receiver protein  44.65 
 
 		 280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000299391  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1942  response regulator receiver protein  40.73 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2281  response regulator receiver protein  40.36 
 
 		 280 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.217898  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2813  response regulator receiver protein  39.63 
 
 		 274 aa  220  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2420  response regulator receiver protein  39.18 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1797  response regulator receiver protein  39.93 
 
 		 292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0698667 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2262  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 123 aa  99  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.62 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  41.43 
 
 		 553 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  39.23 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3553  response regulator receiver  41.73 
 
 		 384 aa  94  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  34.29 
 
 		 553 aa  92.4  9e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 242 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  36.07 
 
 		 242 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 941 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  36.16 
 
 		 555 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 245 aa  90.1  5e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  34.68 
 
 		 2301 aa  90.1  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0500  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 373 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3524  two component LuxR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 353 aa  89.7  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.428998 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 122 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  44.12 
 
 		 2092 aa  89.7  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  34.92 
 
 		 2284 aa  89.4  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.52 
 
 		 236 aa  89.4  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4238  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.92 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1228  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.06 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 245 aa  88.6  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 		 440 aa  88.6  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.33 
 
 		 488 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 121 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0671  two component LuxR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 333 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0205263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0356  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 360 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  35.25 
 
 		 242 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.75 
 
 		 236 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 231 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  35.97 
 
 		 554 aa  88.6  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0575  response regulator PleD  41.59 
 
 		 456 aa  87.8  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0610  response regulator PleD  41.59 
 
 		 461 aa  87.8  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.961713  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 407 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 1426 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1577  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.07 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 304 aa  87.8  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 128 aa  87  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3134  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 200 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 122 aa  86.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1382  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 302 aa  85.9  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 1118 aa  85.9  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  38.46 
 
 		 121 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2749  response regulator receiver domain-containing protein  37.82 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.48 
 
 		 231 aa  85.5  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0979  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3790  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.72 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 231 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4060  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.84 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2543  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 121 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4068  response regulator receiver  35.94 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.706307  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  31.18 
 
 		 1299 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 1431 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  34.78 
 
 		 122 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 437 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  35.83 
 
 		 1427 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 134 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.83 
 
 		 234 aa  85.1  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 		 1631 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 576 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1307  DNA-binding heavy metal response regulator  38.05 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150056  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  35.14 
 
 		 1866 aa  84  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 437 aa  84  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.93 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.52 
 
 		 1049 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 523 aa  84  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4379  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 120 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 123 aa  84.3  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1118  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 452 aa  84  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000972917  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  31.62 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25160  response regulator  37.4 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  34.75 
 
 		 122 aa  84  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0065  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2452  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.01 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101758 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1127  heavy metal response regulator  38.05 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294376  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.84 
 
 		 659 aa  83.6  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 		 1415 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0828  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2384  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 123 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3677  response regulator PleD  38.94 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345303  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 1003 aa  83.6  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  33.87 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.51 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3005  response regulator receiver  38.33 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.931132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4530  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  40 
 
 		 795 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1006  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.88 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>