More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3186 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  60 
 
 
2022 aa  930    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  63.2 
 
 
2414 aa  979    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  45.61 
 
 
2048 aa  751    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  69.69 
 
 
2026 aa  862    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  100 
 
 
2092 aa  4140    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  46.86 
 
 
1866 aa  670    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  44.33 
 
 
1956 aa  739    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  69.69 
 
 
2026 aa  863    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  66.39 
 
 
2137 aa  794    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  54.55 
 
 
1888 aa  1026    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  44.23 
 
 
2009 aa  731    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  59.4 
 
 
2070 aa  935    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 
2012 aa  737    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  58.68 
 
 
2164 aa  1075    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  52.92 
 
 
1970 aa  1032    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  51.8 
 
 
1907 aa  594  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  50.65 
 
 
1960 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  47.59 
 
 
1643 aa  570  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 
1974 aa  522  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 
2212 aa  522  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
2539 aa  519  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 
2423 aa  516  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  40.52 
 
 
2301 aa  512  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  38.22 
 
 
2336 aa  513  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 
1758 aa  500  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.02 
 
 
1971 aa  497  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 
1832 aa  499  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 
1725 aa  486  1e-135  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  38.48 
 
 
1992 aa  483  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  45.39 
 
 
1646 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  45.39 
 
 
1646 aa  476  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  37.88 
 
 
1987 aa  476  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 
1725 aa  476  1e-132  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  42.34 
 
 
1834 aa  474  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  42.79 
 
 
2458 aa  476  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  45.07 
 
 
1647 aa  473  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  42.65 
 
 
2476 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 
2175 aa  460  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
1609 aa  452  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  34.23 
 
 
2301 aa  445  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  33.91 
 
 
2284 aa  439  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
934 aa  333  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.35 
 
 
2325 aa  330  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 
1127 aa  328  6e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
1155 aa  321  9e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
1616 aa  310  3e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
740 aa  307  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
952 aa  306  3.0000000000000004e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 
1137 aa  306  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 
1065 aa  305  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 
1125 aa  304  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
928 aa  301  8e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
1012 aa  300  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 
1736 aa  298  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  30.6 
 
 
734 aa  295  6e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
1098 aa  293  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0519  putative CheA signal transduction histidine kinases  31.4 
 
 
1029 aa  292  6e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.65 
 
 
974 aa  289  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
1098 aa  289  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.62 
 
 
1180 aa  288  5.999999999999999e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
1078 aa  287  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
784 aa  285  5.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
741 aa  281  8e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  31 
 
 
974 aa  278  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
679 aa  275  6e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 
977 aa  275  6e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
777 aa  274  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
941 aa  272  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  32.97 
 
 
1197 aa  273  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
679 aa  272  5e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
742 aa  270  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  33.47 
 
 
785 aa  265  8.999999999999999e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  34 
 
 
777 aa  265  8.999999999999999e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
989 aa  262  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
989 aa  262  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  39.75 
 
 
1983 aa  261  9e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  35.05 
 
 
769 aa  260  2e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  33.93 
 
 
769 aa  258  9e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  32.93 
 
 
783 aa  258  9e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  34.64 
 
 
769 aa  258  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.87 
 
 
789 aa  256  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4348  CheA signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 
911 aa  256  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  33.13 
 
 
770 aa  256  5.000000000000001e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  32.74 
 
 
770 aa  256  5.000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 
808 aa  254  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4288  CheA signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 
911 aa  254  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  32.88 
 
 
774 aa  253  2e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  33.4 
 
 
803 aa  252  4e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
772 aa  252  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  33.63 
 
 
798 aa  251  8e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0714  CheA signal transduction histidine kinases  29.03 
 
 
1020 aa  250  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  32.63 
 
 
878 aa  247  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
777 aa  247  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 
705 aa  244  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 
681 aa  244  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 
755 aa  241  8e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
705 aa  241  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
756 aa  240  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  35.89 
 
 
839 aa  239  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3533  CheA signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
808 aa  239  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.229129  normal  0.100521 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>