More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1797 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1797  response regulator receiver protein  100 
 
 		 292 aa  592  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0698667 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2420  response regulator receiver protein  95.89 
 
 		 292 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0978  response regulator receiver protein  47.25 
 
 		 280 aa  272  6e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000299391  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2281  response regulator receiver protein  45.65 
 
 		 280 aa  255  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.217898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1942  response regulator receiver protein  46.01 
 
 		 280 aa  255  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2813  response regulator receiver protein  40.37 
 
 		 274 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2262  response regulator receiver protein  38.35 
 
 		 281 aa  202  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  39.93 
 
 		 340 aa  198  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1737  response regulator receiver domain-containing protein  38.06 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.570794  normal  0.630295 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1220  response regulator  38.2 
 
 		 277 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2299  response regulator receiver protein  36.57 
 
 		 275 aa  179  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0218685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1135  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3127  response regulator receiver protein  37.22 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 1013 aa  86.3  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 1631 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 122 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  33.91 
 
 		 122 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.82 
 
 		 1431 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0930  response regulator receiver protein  26.22 
 
 		 456 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139996  normal  0.100238 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0166  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  38.14 
 
 		 697 aa  80.1  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2998  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 807 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.745142 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.26 
 
 		 348 aa  79  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 		 1407 aa  79  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  34.75 
 
 		 128 aa  79  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 686 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 235 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  36.07 
 
 		 1418 aa  78.2  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 1049 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  33.58 
 
 		 513 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2392  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.5 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0321511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2712  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 576 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2357  putative PAS/PAC sensor protein  35.34 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3548  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 		 1681 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  33.05 
 
 		 121 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  35.16 
 
 		 641 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.54 
 
 		 655 aa  77  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0922  response regulator receiver protein  24.91 
 
 		 459 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0873  response regulator receiver domain-containing protein  25.68 
 
 		 483 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0633299  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  33.87 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 121 aa  77  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 1559 aa  76.3  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 1003 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0482  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 		 1681 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  28.05 
 
 		 1834 aa  76.3  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 1832 aa  75.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 865 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 720 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 865 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 440 aa  75.9  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 433 aa  75.9  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0480  putative PAS/PAC sensor protein  35.16 
 
 		 1686 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0846  response regulator receiver protein  37.01 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282438 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 120 aa  75.1  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2053  DNA-binding response regulator  34.68 
 
 		 237 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3716  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  37.69 
 
 		 247 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422774  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.05 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 1177 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2192  DNA-binding response regulator  34.68 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3394  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 		 560 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  35.09 
 
 		 121 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 1816 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2398  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.61 
 
 		 469 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.313034  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2310  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.61 
 
 		 469 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294968  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 		 1029 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1220  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 130 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  33.62 
 
 		 645 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  36.45 
 
 		 1060 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 121 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 939 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 1383 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 		 984 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 124 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 		 1651 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3625  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.62 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  33.85 
 
 		 919 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0598  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  36.22 
 
 		 470 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02350  protein-histidine kinase, putative  34.35 
 
 		 1614 aa  73.9  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16806  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  28.15 
 
 		 2284 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 123 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.3 
 
 		 1152 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 1406 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2316  response regulator  31.62 
 
 		 527 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000645629  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0337  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 139 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  34.96 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2346  histidine kinase  33.33 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 796 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1713  two component LuxR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.310925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 		 1222 aa  73.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 123 aa  73.9  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0302  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4386  histidine kinase  33.9 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>