More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0134 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  100 
 
 		 123 aa  246  6e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  71.9 
 
 		 123 aa  187  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  71.79 
 
 		 121 aa  179  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  65.57 
 
 		 125 aa  172  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  67.52 
 
 		 121 aa  167  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  64.66 
 
 		 128 aa  159  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0604  response regulator receiver protein  60.53 
 
 		 123 aa  149  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.72319  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  58.68 
 
 		 126 aa  148  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4585  response regulator receiver protein  57.38 
 
 		 124 aa  148  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0945273  normal  0.0607582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  59.13 
 
 		 125 aa  147  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4215  response regulator receiver  57.38 
 
 		 124 aa  148  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.412692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  52.03 
 
 		 131 aa  148  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4732  response regulator receiver protein  60.53 
 
 		 133 aa  147  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  decreased coverage  0.0029072 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5197  response regulator receiver protein  54.78 
 
 		 134 aa  141  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  54.17 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  54.62 
 
 		 139 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3877  response regulator receiver protein  53.04 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3308  response regulator receiver protein  48.33 
 
 		 130 aa  126  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.678314  normal  0.215079 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3077  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.75 
 
 		 1274 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  43.59 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  45 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.95 
 
 		 397 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  46.15 
 
 		 1053 aa  110  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 		 1352 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.76 
 
 		 1977 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 		 392 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3355  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  47.41 
 
 		 685 aa  105  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.35 
 
 		 1245 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3612  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4908  response regulator receiver protein  40.65 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100675  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4302  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 124 aa  103  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  49.12 
 
 		 651 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  47.37 
 
 		 735 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 		 1287 aa  102  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.63 
 
 		 1245 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  48.25 
 
 		 651 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.98 
 
 		 1937 aa  100  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.95 
 
 		 391 aa  100  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2535  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 126 aa  100  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  42.98 
 
 		 1937 aa  100  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 		 981 aa  100  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.72 
 
 		 1055 aa  100  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  50 
 
 		 645 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 		 124 aa  99.4  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.02 
 
 		 1033 aa  99.4  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  40.16 
 
 		 1200 aa  99.8  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  44.35 
 
 		 742 aa  99.4  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.32 
 
 		 1936 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.5 
 
 		 228 aa  99  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.32 
 
 		 1230 aa  99.4  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.11 
 
 		 454 aa  99  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.22 
 
 		 1788 aa  99.4  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.5 
 
 		 1234 aa  99.4  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.24 
 
 		 1271 aa  99.4  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  40.91 
 
 		 1574 aa  99  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  44.95 
 
 		 571 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.12 
 
 		 2213 aa  98.6  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  47.86 
 
 		 1131 aa  98.6  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  40.83 
 
 		 1233 aa  98.6  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  49.06 
 
 		 858 aa  97.8  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  45.3 
 
 		 921 aa  98.2  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 1238 aa  97.4  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  43.7 
 
 		 823 aa  97.8  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 1238 aa  97.4  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.83 
 
 		 1236 aa  97.4  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.83 
 
 		 1236 aa  97.4  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.83 
 
 		 1236 aa  97.4  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  41.18 
 
 		 1188 aa  97.4  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.34 
 
 		 863 aa  97.4  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  50.48 
 
 		 1560 aa  97.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.7 
 
 		 1499 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 1238 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 1238 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.35 
 
 		 957 aa  97.1  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4002  sensory transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 1689 aa  97.1  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  41.13 
 
 		 606 aa  96.7  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4337  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.62 
 
 		 1629 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571014  normal  0.322198 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  46.79 
 
 		 781 aa  96.3  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0080  response regulator receiver domain-containing protein  42.37 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.62 
 
 		 1629 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 		 1236 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  37.82 
 
 		 497 aa  96.3  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2619  histidine kinase  42.5 
 
 		 667 aa  96.3  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.01076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2670  histidine kinase  42.5 
 
 		 667 aa  96.3  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.754609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.06 
 
 		 1110 aa  96.3  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1307  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.04 
 
 		 391 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.62 
 
 		 1161 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.32 
 
 		 1442 aa  95.5  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.23 
 
 		 1223 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 		 1177 aa  95.9  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 		 1058 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.45 
 
 		 1135 aa  95.5  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1099  response regulator receiver  42.15 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 		 770 aa  94.7  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.83 
 
 		 1407 aa  95.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>