More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4176 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  100 
 
 		 128 aa  253  6e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  45.08 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  41.8 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  46.83 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 124 aa  110  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0046  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 125 aa  104  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1099  response regulator receiver  42.86 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3271  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 120 aa  104  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 1977 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  38.33 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  38.33 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  43.55 
 
 		 1242 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0903  cell division response regulator DivK  37.5 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.91869  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 144 aa  100  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.15 
 
 		 948 aa  99.8  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  43.1 
 
 		 121 aa  99.4  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 1279 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  36.67 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.93 
 
 		 870 aa  99  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 123 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  44.83 
 
 		 265 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  39.17 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  39.17 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 127 aa  97.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  39.17 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  39.17 
 
 		 121 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  40 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 123 aa  97.1  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  35.83 
 
 		 123 aa  97.1  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 126 aa  96.7  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1737  response regulator receiver domain-containing protein  40.95 
 
 		 277 aa  95.9  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.570794  normal  0.630295 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 123 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 123 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 125 aa  95.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 1352 aa  95.1  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 		 1274 aa  95.5  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 397 aa  95.9  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2535  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 126 aa  94.7  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.82 
 
 		 664 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3009  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 120 aa  94  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 		 392 aa  93.6  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4585  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0945273  normal  0.0607582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4215  response regulator receiver  40.16 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.412692 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2299  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 275 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0218685  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.14 
 
 		 1007 aa  90.9  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 		 234 aa  90.9  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.32 
 
 		 454 aa  90.5  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 1121 aa  90.9  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 1245 aa  90.5  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  39.45 
 
 		 927 aa  90.5  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1220  response regulator  39.05 
 
 		 277 aa  90.1  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327631  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 391 aa  90.5  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4732  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 133 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  decreased coverage  0.0029072 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 131 aa  90.1  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.54 
 
 		 858 aa  89.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3427  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  39.5 
 
 		 2031 aa  90.1  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0889636 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 126 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2781  response regulator receiver protein  37.98 
 
 		 133 aa  89.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 1788 aa  89.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6413  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  44.07 
 
 		 404 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.341429  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2709  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000626377  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 245 aa  89  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0978  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 280 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000299391  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 		 1651 aa  88.6  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 257 aa  89  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5252  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  44.23 
 
 		 1698 aa  88.6  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0958  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 		 734 aa  87.8  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 134 aa  87.8  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.23 
 
 		 764 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  39.42 
 
 		 933 aa  87.8  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.83 
 
 		 354 aa  87.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1018  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 441 aa  87.4  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00729938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  35.83 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0584  response regulator receiver protein  50 
 
 		 216 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0767221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0195  two component transcriptional regulator  41.32 
 
 		 222 aa  87.4  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2347  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 202 aa  87.4  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.56815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.83 
 
 		 352 aa  87  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 1002 aa  87  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1597  histidine kinase  40 
 
 		 537 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0756537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>