More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3895 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  49.9 
 
 		 1907 aa  828    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  40.55 
 
 		 2048 aa  772    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  100 
 
 		 1866 aa  3734    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  38.93 
 
 		 1956 aa  802    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  44.38 
 
 		 1960 aa  889    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 		 2022 aa  652    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  48.06 
 
 		 2137 aa  640    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  47.06 
 
 		 1983 aa  638    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 		 2012 aa  779    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  39.1 
 
 		 1888 aa  734    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  42.45 
 
 		 1643 aa  686    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  48.13 
 
 		 1989 aa  695    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 		 2009 aa  790    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 		 2026 aa  660    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  42.7 
 
 		 2164 aa  669    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  37.65 
 
 		 1970 aa  707    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  44.92 
 
 		 2070 aa  629  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  53.93 
 
 		 2092 aa  629  1e-178  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  52.46 
 
 		 2414 aa  618  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 1832 aa  599  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 2539 aa  563  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  40.22 
 
 		 2336 aa  558  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  45.47 
 
 		 1974 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 2423 aa  549  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 		 1758 aa  538  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  41.37 
 
 		 2301 aa  536  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 2212 aa  535  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  39.5 
 
 		 2458 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.72 
 
 		 1971 aa  520  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  36.29 
 
 		 1987 aa  516  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  45.96 
 
 		 1834 aa  516  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  39.08 
 
 		 1992 aa  509  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  33.01 
 
 		 2301 aa  503  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  45.32 
 
 		 1725 aa  488  1e-136  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  45.32 
 
 		 1725 aa  488  1e-136  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 		 1609 aa  483  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 1629 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  32.86 
 
 		 2284 aa  479  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 		 1646 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  38.47 
 
 		 1646 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 1647 aa  466  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 		 2175 aa  412  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 1065 aa  343  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 1127 aa  341  8e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.49 
 
 		 2325 aa  340  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 741 aa  329  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.68 
 
 		 974 aa  328  4.0000000000000003e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 740 aa  328  9e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 934 aa  325  4e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 1155 aa  322  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 928 aa  320  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 742 aa  317  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 952 aa  315  4.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 977 aa  313  1e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 1012 aa  311  8e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 679 aa  309  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 1736 aa  305  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 1616 aa  304  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 1098 aa  304  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 679 aa  303  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 1078 aa  302  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 1098 aa  300  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  32.47 
 
 		 1197 aa  300  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 941 aa  299  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 974 aa  297  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  29.81 
 
 		 769 aa  295  4e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  31.09 
 
 		 734 aa  294  9e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 1125 aa  293  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  35.52 
 
 		 770 aa  292  4e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 1137 aa  291  7e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 783 aa  291  7e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 762 aa  291  7e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  30.01 
 
 		 769 aa  290  1e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  29.81 
 
 		 769 aa  290  1e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 911 aa  289  2.9999999999999996e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0519  putative CheA signal transduction histidine kinases  29.73 
 
 		 1029 aa  288  5e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4348  CheA signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 911 aa  284  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  33.95 
 
 		 785 aa  284  1e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4288  CheA signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 911 aa  283  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  28.55 
 
 		 1180 aa  280  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  35.56 
 
 		 803 aa  280  3e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 784 aa  278  5e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  33.88 
 
 		 783 aa  279  5e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 760 aa  278  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 705 aa  274  9e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0469  CheA signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 830 aa  273  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153889  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  35.62 
 
 		 839 aa  272  5e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 808 aa  270  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 705 aa  269  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 777 aa  268  8e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 777 aa  267  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  35.23 
 
 		 798 aa  267  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 781 aa  267  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0714  CheA signal transduction histidine kinases  30.81 
 
 		 1020 aa  265  6e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  27.89 
 
 		 764 aa  264  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  30.02 
 
 		 878 aa  264  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 756 aa  264  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 896 aa  262  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 896 aa  261  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 777 aa  257  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>