39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2742 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2742  CheC domain protein  100 
 
 
288 aa  592  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00482165  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1373  hypothetical protein  51.04 
 
 
288 aa  301  6.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000882706  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1618  hypothetical protein  51.04 
 
 
287 aa  295  6e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1606  hypothetical protein  50 
 
 
287 aa  291  8e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000014118  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  30.97 
 
 
1141 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1307  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.86 
 
 
440 aa  63.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000813036  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2061  hypothetical protein  33.87 
 
 
356 aa  62.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264827  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0079  hypothetical protein  29.73 
 
 
256 aa  56.6  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.990933  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  36.14 
 
 
888 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  30.84 
 
 
340 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  21.23 
 
 
154 aa  50.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2573  hypothetical protein  30.47 
 
 
249 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  40 
 
 
570 aa  49.7  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1124  general secretion pathway protein E  37.8 
 
 
1017 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.553401 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  39.62 
 
 
574 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  35.37 
 
 
885 aa  47.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  34.94 
 
 
841 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1638  type II secretion system protein E  26.77 
 
 
644 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4230  heat shock protein DnaJ domain protein  26.92 
 
 
267 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0473127  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1966  type II secretion system protein E  32 
 
 
642 aa  45.8  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56575  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4205  heat shock protein DnaJ domain protein  26.92 
 
 
270 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0861  type II secretion system protein E  29.82 
 
 
642 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  35.85 
 
 
574 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  35.59 
 
 
574 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  38.6 
 
 
567 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  37.93 
 
 
582 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0126  CheC-like protein  20.57 
 
 
154 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000893437  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  36.84 
 
 
566 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0972  type II secretion system protein E  35.23 
 
 
528 aa  43.9  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  42 
 
 
570 aa  44.3  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2823  MSHA biogenesis protein MshE  43.14 
 
 
575 aa  43.5  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  42.86 
 
 
553 aa  43.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2722  hypothetical protein  33.9 
 
 
398 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266732  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  32.53 
 
 
891 aa  43.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1768  CheC-like protein  26.04 
 
 
165 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16020  hypothetical protein  37.74 
 
 
228 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0394744  normal  0.745254 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0771  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.24 
 
 
245 aa  42.7  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2814  hypothetical protein  32.2 
 
 
398 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0508779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2906  hypothetical protein  32.2 
 
 
398 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>