19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1618 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1618  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  590  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1606  hypothetical protein  74.91 
 
 		 287 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000014118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1373  hypothetical protein  57.99 
 
 		 288 aa  332  5e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000882706  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2742  CheC domain protein  51.04 
 
 		 288 aa  295  6e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00482165  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0079  hypothetical protein  28 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.990933  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1984  hypothetical protein  27.05 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  26.13 
 
 		 340 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2024  protein-tyrosine kinase  37.1 
 
 		 298 aa  46.2  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.607078  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  21.71 
 
 		 155 aa  46.2  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  30 
 
 		 571 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  26.17 
 
 		 1141 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2756  hypothetical protein  23.48 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2134  CheC domain protein  21.83 
 
 		 158 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0500  hypothetical protein  35.94 
 
 		 350 aa  43.5  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.260407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2917  hypothetical protein  29.31 
 
 		 244 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4081  heat shock protein DnaJ-like  27.83 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.05144  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1124  general secretion pathway protein E  28.43 
 
 		 1017 aa  42.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.553401 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4205  heat shock protein DnaJ domain protein  27.03 
 
 		 270 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0150  hypothetical protein  36.36 
 
 		 289 aa  42.4  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>