75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2279 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  100 
 
 
154 aa  307  4e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0126  CheC-like protein  67.53 
 
 
154 aa  221  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000893437  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2134  CheC domain protein  52 
 
 
158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0151  CheC domain-containing protein  42.38 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1493  chemotaxis protein CheX  34.42 
 
 
154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0691  CheC-like family protein  31.45 
 
 
161 aa  87.4  6e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0452521  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0634  CheC domain protein  32.61 
 
 
160 aa  86.7  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1282  CheC domain-containing protein  32.03 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.233529  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1446  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  36.64 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1173  CheC domain-containing protein  31.37 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.362697  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  32.03 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1768  CheC-like protein  31.36 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  33.07 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1932  CheC domain protein  29.37 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0227289  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2308  CheC-like protein  28.99 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0523  CheC-like protein  30.46 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000195961  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1832  CheC domain-containing protein  33.06 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000797818  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1063  CheC domain protein  30.5 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  28.67 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1176  CheC-like protein  33.06 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  29.14 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2679  chemotaxis protein CheX, putative  29.25 
 
 
155 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.513529 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  25.9 
 
 
152 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1447  chemotaxis operon protein  25 
 
 
158 aa  60.5  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34666  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  28.26 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2263  CheC domain protein  27.74 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000104148  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  27.86 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4092  hypothetical protein  28.48 
 
 
171 aa  57.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0178506  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  25.9 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  28.47 
 
 
168 aa  57  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0035  CheC domain protein  24.48 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1817  chemotaxis protein CheX, putative  28.26 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  25.55 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1986  chemotaxis protein CheX, putative  30.66 
 
 
158 aa  54.3  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  27.69 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3056  putative chemotaxis protein CheX  27.13 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.23032  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  25.52 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0765  putative chemotaxis protein CheX  27.14 
 
 
154 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1373  hypothetical protein  28.47 
 
 
288 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000882706  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0409  cheC-like family protein  30.34 
 
 
154 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0760  putative chemotaxis protein CheX  25.32 
 
 
154 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000652399  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0719  putative chemotaxis protein CheX  24.52 
 
 
154 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137536  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0739  CheC domain protein  24.52 
 
 
154 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000054191  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0748  CheC domain-containing protein  24.52 
 
 
154 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000188683  hitchhiker  0.000145879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3636  putative chemotaxis protein CheX  24.52 
 
 
154 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000517443  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2742  CheC domain protein  21.23 
 
 
288 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00482165  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1606  hypothetical protein  30.56 
 
 
287 aa  50.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000014118  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0696  putative chemotaxis protein CheX  26.43 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000403522  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002342  chemotaxis protein CheX  25.17 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3246  putative chemotaxis protein CheX  26.49 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000130186  hitchhiker  0.00000986039 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00011  chemotaxis protein CheX  25.17 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0715  putative chemotaxis protein CheX  26.43 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000857864  hitchhiker  0.000181388 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0913  response regulator receiver protein  27.78 
 
 
301 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.348072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  25.96 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3915  hypothetical protein  25.87 
 
 
154 aa  47.4  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  27.13 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2787  hypothetical protein  24.81 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.834766  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  31.31 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0386  putative chemotaxis protein  23.57 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1476  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  33.77 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0811  chemotaxis protein CheX, putative  26.8 
 
 
167 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2406  hypothetical protein  24.43 
 
 
170 aa  44.3  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  29.29 
 
 
169 aa  43.9  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  26.85 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.2 
 
 
370 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0257  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.89 
 
 
229 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3372  inhibitor of MCP methylation-like protein  30.7 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  29.29 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0888  inhibitor of MCP methylation-like protein  30.7 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0522691  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1618  hypothetical protein  21.23 
 
 
287 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  23.57 
 
 
166 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0650  inhibitor of MCP methylation, CheC-like protein  27.36 
 
 
158 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4204  CheC domain-containing protein  26.43 
 
 
204 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.994344  hitchhiker  0.00000174212 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2232  CheC domain protein  24.81 
 
 
158 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  29.41 
 
 
184 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>