39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1768 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1768  CheC-like protein  100 
 
 
165 aa  336  9e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1493  chemotaxis protein CheX  39.07 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0691  CheC-like family protein  33.96 
 
 
161 aa  88.6  4e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0452521  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1063  CheC domain protein  30.32 
 
 
155 aa  85.1  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0634  CheC domain protein  29.14 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2134  CheC domain protein  32.17 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  31.36 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0151  CheC domain-containing protein  30.36 
 
 
156 aa  72  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1447  chemotaxis operon protein  28.22 
 
 
158 aa  72  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34666  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0126  CheC-like protein  29.91 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000893437  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2308  CheC-like protein  25.32 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1932  CheC domain protein  25.5 
 
 
157 aa  67  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0227289  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  29.2 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1446  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  32.77 
 
 
152 aa  61.2  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2263  CheC domain protein  26.03 
 
 
152 aa  60.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000104148  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  25.64 
 
 
155 aa  57.4  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1173  CheC domain-containing protein  27.12 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.362697  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1282  CheC domain-containing protein  27.12 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.233529  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  25.64 
 
 
152 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  26.5 
 
 
152 aa  51.6  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2406  hypothetical protein  24.32 
 
 
170 aa  47.4  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  22.88 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0913  response regulator receiver protein  26.28 
 
 
301 aa  45.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.348072  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1604  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.81 
 
 
464 aa  45.4  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  23.73 
 
 
154 aa  45.1  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  26.98 
 
 
171 aa  44.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  23.89 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2233  hypothetical protein  24.74 
 
 
157 aa  43.9  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1666  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.76 
 
 
205 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0231538  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0811  chemotaxis protein CheX, putative  25.17 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0035  CheC domain protein  20.25 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2742  CheC domain protein  26.04 
 
 
288 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00482165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1176  CheC-like protein  26.35 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3246  putative chemotaxis protein CheX  18.3 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000130186  hitchhiker  0.00000986039 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1606  hypothetical protein  29.49 
 
 
287 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000014118  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.81 
 
 
204 aa  41.2  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.81 
 
 
204 aa  41.2  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1530  type IV pilus assembly PilZ  22.39 
 
 
300 aa  41.2  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174773  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3056  putative chemotaxis protein CheX  18.83 
 
 
154 aa  40.8  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.23032  normal  0.617715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>