More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1638 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2609  type IV pilus assembly protein, putative  62.79 
 
 		 645 aa  866    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0279  putative phytochrome sensor protein  56.97 
 
 		 767 aa  664    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1638  type II secretion system protein E  100 
 
 		 644 aa  1309    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0861  type II secretion system protein E  64.75 
 
 		 642 aa  882    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1971  putative phytochrome sensor protein  55.25 
 
 		 771 aa  638    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000984823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0295  putative phytochrome sensor protein  56.64 
 
 		 767 aa  664    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.42905  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1244  putative phytochrome sensor protein  47.38 
 
 		 772 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000557718  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  42.27 
 
 		 841 aa  501  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1659  type II secretion system protein E  45.76 
 
 		 785 aa  483  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.233969  normal  0.903835 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0411  type II secretion system protein E  48.99 
 
 		 702 aa  479  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319721  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1966  type II secretion system protein E  41.82 
 
 		 642 aa  480  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56575  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3938  putative GAF sensor protein  43.21 
 
 		 806 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0923  putative phytochrome sensor protein  43.49 
 
 		 794 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3153  type II secretion system protein E  52.35 
 
 		 684 aa  423  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3152  type II secretion system protein E  50.72 
 
 		 677 aa  425  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  39.55 
 
 		 871 aa  422  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0467  putative GAF sensor protein  40.34 
 
 		 736 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.116791  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0421  putative phytochrome sensor protein  39.57 
 
 		 770 aa  411  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  38.01 
 
 		 566 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  39.36 
 
 		 553 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00443  type II secretion system protein E:GAF domain  39.24 
 
 		 738 aa  399  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  40.17 
 
 		 568 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  39.97 
 
 		 558 aa  395  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  38.92 
 
 		 555 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.97 
 
 		 563 aa  395  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  39.79 
 
 		 553 aa  394  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  39.08 
 
 		 568 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  37.69 
 
 		 557 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.86 
 
 		 568 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  38.41 
 
 		 556 aa  386  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.18 
 
 		 568 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  38.73 
 
 		 561 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  39.08 
 
 		 553 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  38.32 
 
 		 557 aa  385  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  37.8 
 
 		 571 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.25 
 
 		 568 aa  385  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.73 
 
 		 571 aa  385  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  38.95 
 
 		 558 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.48 
 
 		 568 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  38.03 
 
 		 787 aa  382  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  37.11 
 
 		 888 aa  381  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  37.17 
 
 		 885 aa  381  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.63 
 
 		 568 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  39.26 
 
 		 564 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3833  type II secretion system protein E  40.33 
 
 		 568 aa  375  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522953 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  37.48 
 
 		 558 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.65 
 
 		 568 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  38.97 
 
 		 563 aa  372  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  38.2 
 
 		 561 aa  371  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1701  type II secretion system protein E  37.52 
 
 		 578 aa  367  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  38.29 
 
 		 599 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  37.61 
 
 		 568 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  38.72 
 
 		 599 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  38.29 
 
 		 599 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  36.97 
 
 		 891 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.48 
 
 		 568 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.41 
 
 		 569 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.8 
 
 		 568 aa  369  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0787  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.99 
 
 		 549 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.44 
 
 		 562 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  37.59 
 
 		 569 aa  365  1e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1504  pilus assembly protein PilB  38.2 
 
 		 574 aa  365  1e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0312  type II secretion system protein E  36.11 
 
 		 571 aa  365  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3910  putative phytochrome sensor protein  38.43 
 
 		 727 aa  365  1e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0454039  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.07 
 
 		 569 aa  365  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  37.46 
 
 		 553 aa  365  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3942  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.41 
 
 		 570 aa  365  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  37.69 
 
 		 573 aa  365  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3867  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.41 
 
 		 570 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1479  pilus assembly protein PilB  38.03 
 
 		 574 aa  363  7.0000000000000005e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4060  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.24 
 
 		 570 aa  363  8e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0244852  normal  0.314215 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  37.41 
 
 		 603 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  36.66 
 
 		 572 aa  362  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04882  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.22 
 
 		 577 aa  361  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415694  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.41 
 
 		 570 aa  362  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00735332  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  37.39 
 
 		 564 aa  361  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0064  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilB  36.29 
 
 		 591 aa  360  3e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.978792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.41 
 
 		 569 aa  361  3e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1579  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.74 
 
 		 565 aa  360  3e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1620  type II secretion system protein E  37.29 
 
 		 616 aa  360  4e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3423  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.24 
 
 		 569 aa  360  4e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2034  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.24 
 
 		 577 aa  359  8e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.226289  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0420  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.83 
 
 		 569 aa  359  9e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  35.51 
 
 		 554 aa  358  9.999999999999999e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2079  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.82 
 
 		 578 aa  358  1.9999999999999998e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292786 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3783  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.07 
 
 		 568 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.458272  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  35.65 
 
 		 565 aa  357  2.9999999999999997e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.9 
 
 		 569 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4447  type IV pilus biogenesis protein PilB  37.86 
 
 		 566 aa  357  3.9999999999999996e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  38.16 
 
 		 563 aa  356  6.999999999999999e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3167  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.8 
 
 		 577 aa  356  7.999999999999999e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.644973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2114  pilus biogenesis protein  36.9 
 
 		 577 aa  356  8.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0313  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.9 
 
 		 569 aa  356  8.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3389  type II secretion system protein E  37.07 
 
 		 569 aa  355  1e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2184  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.94 
 
 		 572 aa  355  2e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0413  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.41 
 
 		 568 aa  355  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  38.97 
 
 		 577 aa  354  2e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2681  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.07 
 
 		 572 aa  354  2.9999999999999997e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  35.09 
 
 		 570 aa  351  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0069  type II secretion system protein E  36.1 
 
 		 570 aa  352  2e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.73093  normal  0.361926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>