More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3167 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2681  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  58.14 
 
 		 572 aa  673    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722105  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4060  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  56.03 
 
 		 570 aa  652    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0244852  normal  0.314215 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  55.14 
 
 		 569 aa  640    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3167  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  100 
 
 		 577 aa  1181    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.644973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04882  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  86.87 
 
 		 577 aa  1033    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415694  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  56.21 
 
 		 569 aa  648    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  56.74 
 
 		 569 aa  661    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0312  type II secretion system protein E  59.15 
 
 		 571 aa  692    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3423  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  56.21 
 
 		 569 aa  646    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0313  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  55.67 
 
 		 569 aa  643    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3867  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  56.03 
 
 		 570 aa  653    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  56.03 
 
 		 570 aa  652    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00735332  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0369  type IV pilus biogenesis protein PilB  55.85 
 
 		 568 aa  647    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0217494  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0787  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  60.04 
 
 		 549 aa  685    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0069  type II secretion system protein E  56.34 
 
 		 570 aa  641    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.73093  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3942  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  56.21 
 
 		 570 aa  654    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2034  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  80.83 
 
 		 577 aa  928    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.226289  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2114  pilus biogenesis protein  80.48 
 
 		 577 aa  925    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0420  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  56.54 
 
 		 569 aa  650    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  56.56 
 
 		 569 aa  655    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2079  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  58.52 
 
 		 578 aa  682    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292786 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3783  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  55.32 
 
 		 568 aa  639    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.458272  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  56.56 
 
 		 569 aa  652    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0064  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilB  56.11 
 
 		 591 aa  632  1e-180  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.978792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0413  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  54.82 
 
 		 568 aa  629  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4820  type II secretion system protein E  55.5 
 
 		 566 aa  627  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0863  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  57.02 
 
 		 573 aa  624  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1579  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  53.32 
 
 		 565 aa  618  1e-176  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3389  type II secretion system protein E  54.26 
 
 		 569 aa  620  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2096  type IV pilus assembly protein PilB  54.13 
 
 		 571 aa  615  1e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4447  type IV pilus biogenesis protein PilB  54.83 
 
 		 566 aa  613  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2370  type IV pilus assembly protein, PilB  53.98 
 
 		 571 aa  614  9.999999999999999e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.881077  normal  0.0893992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12090  type IV pilus assembly protein  54.9 
 
 		 566 aa  613  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58750  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  53.77 
 
 		 567 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.497058 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0926  type IV pilus biogenesis protein PilB  52.54 
 
 		 564 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0798  type II secretion system protein E  52.89 
 
 		 564 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2184  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  55.81 
 
 		 572 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5162  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  53.95 
 
 		 561 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1479  pilus assembly protein PilB  52.11 
 
 		 574 aa  598  1e-170  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1504  pilus assembly protein PilB  51.75 
 
 		 574 aa  597  1e-169  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0775  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  54.29 
 
 		 567 aa  594  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.621188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1175  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  53.06 
 
 		 571 aa  588  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.323553  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0639  type II secretion system protein E  53.26 
 
 		 571 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0805  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  51.71 
 
 		 577 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.53 
 
 		 562 aa  580  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0768  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  51.54 
 
 		 577 aa  581  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2141  type II secretion system protein E  50.95 
 
 		 569 aa  580  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000466372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0509  pilus biogenesis ATPase  51.38 
 
 		 572 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0385141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0841  type II secretion system protein E  50.6 
 
 		 578 aa  566  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0657263  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5488  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.77 
 
 		 580 aa  563  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.388204  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  51.61 
 
 		 555 aa  563  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.762326  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0766  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.7 
 
 		 578 aa  560  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.59759  normal  0.16115 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0550  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  51.24 
 
 		 574 aa  560  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2174  type II secretion system protein E  49.47 
 
 		 579 aa  558  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3680  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.4 
 
 		 578 aa  556  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2902  type II secretion system protein E  49.83 
 
 		 577 aa  549  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4220  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.91 
 
 		 577 aa  550  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  49.17 
 
 		 568 aa  542  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2960  type II secretion system protein E  51.47 
 
 		 586 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548556  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3108  type II secretion system protein E  52.91 
 
 		 573 aa  538  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.275217  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  48.62 
 
 		 568 aa  532  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2825  type IV pilus assembly protein  51.4 
 
 		 575 aa  535  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00509282  normal  0.0351792 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3070  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  51.21 
 
 		 575 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2705  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  51.59 
 
 		 575 aa  534  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.92 
 
 		 568 aa  531  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0183  type IV pilus assembly protein  47.74 
 
 		 569 aa  527  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0362  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.74 
 
 		 569 aa  527  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.7 
 
 		 568 aa  522  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  48.41 
 
 		 566 aa  520  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.05 
 
 		 568 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  49.81 
 
 		 568 aa  512  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.49 
 
 		 568 aa  512  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.05 
 
 		 568 aa  514  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2000  type IV pilus assembly protein PilB  47.8 
 
 		 562 aa  510  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.758865  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.62 
 
 		 568 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.62 
 
 		 568 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.29 
 
 		 568 aa  503  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  45.52 
 
 		 561 aa  504  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.36 
 
 		 563 aa  498  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2630  type IV pilus assembly protein PilB  50 
 
 		 563 aa  495  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002545  type 4 fimbrial assembly ATPase PilB  45.69 
 
 		 561 aa  486  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.255614  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  47.78 
 
 		 571 aa  488  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.91 
 
 		 571 aa  466  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.41 
 
 		 571 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0151  type II secretion system protein E  54.69 
 
 		 420 aa  451  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  42.01 
 
 		 559 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  43.62 
 
 		 553 aa  434  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  40.6 
 
 		 557 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  40.14 
 
 		 871 aa  419  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  41.45 
 
 		 553 aa  415  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  39.58 
 
 		 556 aa  412  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  41.09 
 
 		 573 aa  415  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0504  Type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  50.62 
 
 		 431 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823394  normal  0.112253 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  40.43 
 
 		 572 aa  410  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  39.61 
 
 		 557 aa  409  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3527  type IV fimbrial biogenesis protein,PilB  52.88 
 
 		 419 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  43.59 
 
 		 561 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0453  type II/IV secretion system protein  52.62 
 
 		 407 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3506  type IV pilus biogenesis protein PilB  52.62 
 
 		 407 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2655  type II secretion system protein E  50.38 
 
 		 432 aa  405  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>