More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3506 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_3251  type II/IV secretion system protein  99.26 
 
 
407 aa  795    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2531  type II/IV secretion system protein  99.26 
 
 
419 aa  795    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0453  type II/IV secretion system protein  99.51 
 
 
407 aa  796    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3527  type IV fimbrial biogenesis protein,PilB  99.02 
 
 
419 aa  790    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1136  type II/IV secretion system protein  94.06 
 
 
423 aa  728    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3531  type IV pilus biogenesis protein PilB  99.51 
 
 
407 aa  797    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3506  type IV pilus biogenesis protein PilB  100 
 
 
407 aa  801    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1311  type II/IV secretion system protein  99.26 
 
 
407 aa  795    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2818  type II secretion system protein E  79.49 
 
 
455 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.016239  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0504  Type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  73.79 
 
 
431 aa  594  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823394  normal  0.112253 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3663  type II secretion system protein E  77.38 
 
 
425 aa  568  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533957  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3452  type II secretion system protein E  73.06 
 
 
431 aa  569  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.190294  hitchhiker  0.00352779 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0506  type II secretion system protein E  77.52 
 
 
414 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0103937  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0481  type II secretion system protein E  78.04 
 
 
414 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00626406  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0096  type II secretion system protein E  78.42 
 
 
428 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.188131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0578  type II secretion system protein E  78.42 
 
 
428 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000399212  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0548  type II secretion system protein E  77.89 
 
 
424 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000248612  normal  0.0592698 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2655  type II secretion system protein E  71.36 
 
 
432 aa  554  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1175  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  55.28 
 
 
571 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.323553  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2825  type IV pilus assembly protein  53.5 
 
 
575 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00509282  normal  0.0351792 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3108  type II secretion system protein E  53.14 
 
 
573 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.275217  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2960  type II secretion system protein E  52.63 
 
 
586 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548556  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2705  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  52.72 
 
 
575 aa  448  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5488  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  54.78 
 
 
580 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.388204  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3680  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  55.04 
 
 
578 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3070  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  52.23 
 
 
575 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0805  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  54.52 
 
 
577 aa  444  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0768  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  54.22 
 
 
577 aa  444  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4220  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  54.9 
 
 
577 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  54.26 
 
 
555 aa  444  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.762326  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0841  type II secretion system protein E  52.97 
 
 
578 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0657263  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0766  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  52.71 
 
 
578 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.59759  normal  0.16115 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0509  pilus biogenesis ATPase  52.58 
 
 
572 aa  437  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0385141 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0639  type II secretion system protein E  52.7 
 
 
571 aa  436  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2370  type IV pilus assembly protein, PilB  53.87 
 
 
571 aa  437  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.881077  normal  0.0893992 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2902  type II secretion system protein E  54.01 
 
 
577 aa  436  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2141  type II secretion system protein E  51.79 
 
 
569 aa  434  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000466372  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0550  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  53.49 
 
 
574 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2184  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  55.38 
 
 
572 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.48405  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0787  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  54.57 
 
 
549 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0312  type II secretion system protein E  53.45 
 
 
571 aa  419  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1579  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  53.25 
 
 
565 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0313  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.39 
 
 
569 aa  411  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0362  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  51.67 
 
 
569 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.39 
 
 
569 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0413  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.79 
 
 
568 aa  410  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  49.5 
 
 
568 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0369  type IV pilus biogenesis protein PilB  50.78 
 
 
568 aa  409  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0217494  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  51.03 
 
 
568 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.65 
 
 
569 aa  411  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.74 
 
 
562 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0183  type IV pilus assembly protein  51.67 
 
 
569 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2681  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  51.8 
 
 
572 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  49.25 
 
 
568 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2114  pilus biogenesis protein  51.7 
 
 
577 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  50.39 
 
 
569 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.77 
 
 
568 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  48.97 
 
 
566 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2034  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  51.96 
 
 
577 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.226289  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.77 
 
 
568 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2079  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  52.06 
 
 
578 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.292786 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3167  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  52.48 
 
 
577 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.644973  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3783  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.13 
 
 
568 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.458272  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.26 
 
 
568 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.49 
 
 
568 aa  403  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.48 
 
 
568 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3389  type II secretion system protein E  49.87 
 
 
569 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0420  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.13 
 
 
569 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.13 
 
 
569 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2096  type IV pilus assembly protein PilB  52.06 
 
 
571 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.87 
 
 
570 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00735332  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3942  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.87 
 
 
570 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2174  type II secretion system protein E  53.66 
 
 
579 aa  401  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3423  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.13 
 
 
569 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.72 
 
 
568 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.61 
 
 
569 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4447  type IV pilus biogenesis protein PilB  49.1 
 
 
566 aa  395  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4060  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.87 
 
 
570 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0244852  normal  0.314215 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.46 
 
 
568 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3867  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.87 
 
 
570 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.23 
 
 
571 aa  395  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0926  type IV pilus biogenesis protein PilB  50.64 
 
 
564 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.72 
 
 
563 aa  392  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.95 
 
 
568 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04882  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  51.17 
 
 
577 aa  394  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415694  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0798  type II secretion system protein E  50.39 
 
 
564 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1479  pilus assembly protein PilB  47.81 
 
 
574 aa  385  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12090  type IV pilus assembly protein  50.13 
 
 
566 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1504  pilus assembly protein PilB  47.68 
 
 
574 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0863  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  49.87 
 
 
573 aa  383  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.21 
 
 
571 aa  381  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5162  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  48.84 
 
 
561 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0064  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilB  47.3 
 
 
591 aa  379  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.978792  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  49.24 
 
 
553 aa  380  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  46.51 
 
 
571 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0069  type II secretion system protein E  47.3 
 
 
570 aa  377  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.73093  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2000  type IV pilus assembly protein PilB  50 
 
 
562 aa  376  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.758865  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58750  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  48.07 
 
 
567 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.497058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4820  type II secretion system protein E  48.83 
 
 
566 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0775  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.79 
 
 
567 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.621188  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>