More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0069 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3942  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  57.67 
 
 
570 aa  681    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04882  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  56.54 
 
 
577 aa  656    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415694  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5162  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  57.98 
 
 
561 aa  671    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5488  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  54.51 
 
 
580 aa  637    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.388204  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4447  type IV pilus biogenesis protein PilB  57.54 
 
 
566 aa  641    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  58.38 
 
 
569 aa  689    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0926  type IV pilus biogenesis protein PilB  57.89 
 
 
564 aa  689    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3167  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  56.34 
 
 
577 aa  637    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.644973  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3867  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  57.67 
 
 
570 aa  680    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0798  type II secretion system protein E  58.25 
 
 
564 aa  697    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0064  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilB  95.78 
 
 
591 aa  1117    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.978792  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0313  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  56.84 
 
 
569 aa  668    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  57.5 
 
 
570 aa  680    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00735332  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0312  type II secretion system protein E  59.82 
 
 
571 aa  695    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4820  type II secretion system protein E  58.72 
 
 
566 aa  697    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0775  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  59.25 
 
 
567 aa  684    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.621188  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  56.99 
 
 
569 aa  665    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0787  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  57.79 
 
 
549 aa  664    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0863  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  59.04 
 
 
573 aa  664    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2114  pilus biogenesis protein  54.59 
 
 
577 aa  635    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4060  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  57.67 
 
 
570 aa  681    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0244852  normal  0.314215 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3389  type II secretion system protein E  56.47 
 
 
569 aa  659    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0069  type II secretion system protein E  100 
 
 
570 aa  1169    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.73093  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2681  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  57.73 
 
 
572 aa  682    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722105  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3423  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  58.02 
 
 
569 aa  685    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12090  type IV pilus assembly protein  59.43 
 
 
566 aa  676    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0805  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  54.45 
 
 
577 aa  637    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0420  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  57.67 
 
 
569 aa  683    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0768  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  54.34 
 
 
577 aa  635    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  57.87 
 
 
569 aa  687    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2079  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  57.09 
 
 
578 aa  677    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.292786 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3783  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  55.93 
 
 
568 aa  654    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.458272  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0369  type IV pilus biogenesis protein PilB  56.18 
 
 
568 aa  663    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0217494  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58750  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  58 
 
 
567 aa  681    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.497058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  56.24 
 
 
569 aa  665    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  58.48 
 
 
569 aa  689    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0413  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  57.24 
 
 
568 aa  669    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2034  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  54.94 
 
 
577 aa  631  1e-180  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.226289  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2141  type II secretion system protein E  54.9 
 
 
569 aa  631  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000466372  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2096  type IV pilus assembly protein PilB  53.97 
 
 
571 aa  628  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2370  type IV pilus assembly protein, PilB  53.71 
 
 
571 aa  623  1e-177  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.881077  normal  0.0893992 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3680  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  52.67 
 
 
578 aa  620  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0639  type II secretion system protein E  52.58 
 
 
571 aa  619  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0766  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  52.84 
 
 
578 aa  615  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.59759  normal  0.16115 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0509  pilus biogenesis ATPase  52.74 
 
 
572 aa  615  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0385141 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  52.46 
 
 
562 aa  612  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2184  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  54.21 
 
 
572 aa  613  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.48405  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1175  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  53.68 
 
 
571 aa  614  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.323553  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0841  type II secretion system protein E  53.09 
 
 
578 aa  608  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0657263  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0550  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  51.86 
 
 
574 aa  609  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  53.13 
 
 
555 aa  611  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.762326  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4220  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  53.62 
 
 
577 aa  607  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1479  pilus assembly protein PilB  51.65 
 
 
574 aa  603  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1504  pilus assembly protein PilB  51.3 
 
 
574 aa  602  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2902  type II secretion system protein E  52.75 
 
 
577 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1579  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  53.12 
 
 
565 aa  604  1.0000000000000001e-171  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2174  type II secretion system protein E  49.39 
 
 
579 aa  587  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2960  type II secretion system protein E  49.82 
 
 
586 aa  545  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548556  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3070  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.9 
 
 
575 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2705  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  51.25 
 
 
575 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0362  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.77 
 
 
569 aa  546  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0183  type IV pilus assembly protein  47.77 
 
 
569 aa  546  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2825  type IV pilus assembly protein  50.54 
 
 
575 aa  544  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00509282  normal  0.0351792 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0151  type II secretion system protein E  62.82 
 
 
420 aa  544  1e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3108  type II secretion system protein E  50.36 
 
 
573 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.275217  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2000  type IV pilus assembly protein PilB  50.85 
 
 
562 aa  533  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.758865  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  47.5 
 
 
561 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.05 
 
 
568 aa  513  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  46.11 
 
 
568 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  45.29 
 
 
568 aa  509  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.55 
 
 
568 aa  509  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.43 
 
 
568 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  45.99 
 
 
568 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.39 
 
 
563 aa  508  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002545  type 4 fimbrial assembly ATPase PilB  50.29 
 
 
561 aa  508  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.255614  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.99 
 
 
568 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.99 
 
 
568 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  45.33 
 
 
566 aa  501  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2630  type IV pilus assembly protein PilB  49.52 
 
 
563 aa  496  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.74 
 
 
568 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.57 
 
 
568 aa  491  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  44.52 
 
 
571 aa  489  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.39 
 
 
568 aa  491  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.44 
 
 
571 aa  482  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.01 
 
 
571 aa  462  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  41.56 
 
 
557 aa  438  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  41.43 
 
 
871 aa  434  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  40.57 
 
 
556 aa  427  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  40.77 
 
 
559 aa  428  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  41.14 
 
 
553 aa  428  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  40.07 
 
 
558 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  41.28 
 
 
557 aa  423  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  40.91 
 
 
577 aa  420  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  39.02 
 
 
561 aa  419  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  45.29 
 
 
553 aa  412  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  45.04 
 
 
561 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  37.63 
 
 
585 aa  405  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  41.01 
 
 
558 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  39.75 
 
 
572 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  39.55 
 
 
558 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>