More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1114 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  100 
 
 		 585 aa  1169    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  65.23 
 
 		 580 aa  714    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02675  general secretory pathway protein E  61.21 
 
 		 575 aa  632  1e-180  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0546  general secretory pathway protein E  62.17 
 
 		 573 aa  632  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0871321 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0769  general secretory pathway protein E  60.36 
 
 		 566 aa  622  1e-177  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0856  general secretory pathway protein E  60.36 
 
 		 566 aa  622  1e-177  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.67783  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  56.99 
 
 		 585 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  58 
 
 		 585 aa  588  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2183  general secretory pathway protein E  55.08 
 
 		 563 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  52.58 
 
 		 559 aa  553  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  52.26 
 
 		 578 aa  550  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  53.21 
 
 		 575 aa  545  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  51.24 
 
 		 567 aa  520  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  52.15 
 
 		 578 aa  518  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  44.88 
 
 		 558 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  55.14 
 
 		 514 aa  463  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.27 
 
 		 571 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  47.09 
 
 		 566 aa  456  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  45.17 
 
 		 603 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  41.54 
 
 		 568 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  42.12 
 
 		 568 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  42.93 
 
 		 871 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  45.08 
 
 		 599 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  45.45 
 
 		 599 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  45.57 
 
 		 561 aa  444  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  45.68 
 
 		 570 aa  443  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.71 
 
 		 568 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  45.08 
 
 		 599 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  44.44 
 
 		 553 aa  444  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  44.64 
 
 		 573 aa  443  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.77 
 
 		 568 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  43.63 
 
 		 558 aa  442  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  43.07 
 
 		 561 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.77 
 
 		 568 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2611  putative general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  48.44 
 
 		 517 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1787  type II secretion system protein E  46.95 
 
 		 544 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  41.32 
 
 		 568 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  41.77 
 
 		 571 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  45 
 
 		 553 aa  441  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  42.5 
 
 		 558 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.55 
 
 		 563 aa  441  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.88 
 
 		 568 aa  436  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  43.65 
 
 		 553 aa  435  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2107  type II secretion system protein E  44.56 
 
 		 606 aa  436  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.49 
 
 		 568 aa  438  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.13 
 
 		 568 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  44.57 
 
 		 885 aa  433  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  39.72 
 
 		 564 aa  432  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.81 
 
 		 568 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  42.75 
 
 		 566 aa  433  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  42.52 
 
 		 555 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0893  type II secretion system protein E  49.71 
 
 		 557 aa  432  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0853399  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  42.65 
 
 		 556 aa  435  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.32 
 
 		 569 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0910  type II secretion system protein E  47.36 
 
 		 561 aa  432  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.661185 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  43.29 
 
 		 553 aa  434  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.14 
 
 		 569 aa  433  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  41.27 
 
 		 557 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  41.32 
 
 		 569 aa  430  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.93 
 
 		 568 aa  430  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  40.98 
 
 		 570 aa  432  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  41.8 
 
 		 561 aa  428  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3009  type II secretion system protein E  46.53 
 
 		 561 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  40.93 
 
 		 571 aa  426  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  45.09 
 
 		 575 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.97 
 
 		 569 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  43.57 
 
 		 563 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2028  type II secretion system protein E  45.4 
 
 		 541 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115803  normal  0.0405936 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0413  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.35 
 
 		 568 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  44.4 
 
 		 520 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  50.45 
 
 		 522 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0741  type II secretion system protein E  43.26 
 
 		 569 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97893  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1278  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  45.35 
 
 		 549 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  39.24 
 
 		 552 aa  424  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0420  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.14 
 
 		 569 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.29 
 
 		 571 aa  421  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  50.23 
 
 		 495 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  45.52 
 
 		 521 aa  420  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  43.12 
 
 		 550 aa  419  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  47.68 
 
 		 520 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  45.45 
 
 		 515 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3029  general secretion pathway protein E  41.97 
 
 		 550 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599486  hitchhiker  0.00121357 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  42.16 
 
 		 557 aa  419  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  44.52 
 
 		 572 aa  421  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  40.14 
 
 		 787 aa  420  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  47.25 
 
 		 501 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  43.23 
 
 		 888 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  49.09 
 
 		 497 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  49.09 
 
 		 497 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  49.09 
 
 		 497 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  49.09 
 
 		 497 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  49.09 
 
 		 497 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  49.09 
 
 		 497 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  49.09 
 
 		 497 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  46.76 
 
 		 557 aa  418  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.41 
 
 		 569 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1586  type II secretion system protein E  43.95 
 
 		 538 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0294354 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  51.95 
 
 		 518 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  43.82 
 
 		 569 aa  418  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3423  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.97 
 
 		 569 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>