More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1659 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1659  type II secretion system protein E  100 
 
 		 785 aa  1606    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.233969  normal  0.903835 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0411  type II secretion system protein E  59.48 
 
 		 702 aa  845    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319721  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0279  putative phytochrome sensor protein  49.06 
 
 		 767 aa  530  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0295  putative phytochrome sensor protein  49.23 
 
 		 767 aa  529  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.42905  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1244  putative phytochrome sensor protein  45.97 
 
 		 772 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000557718  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1971  putative phytochrome sensor protein  48.29 
 
 		 771 aa  512  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000984823  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1638  type II secretion system protein E  45.76 
 
 		 644 aa  499  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2609  type IV pilus assembly protein, putative  45.09 
 
 		 645 aa  482  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0861  type II secretion system protein E  45.59 
 
 		 642 aa  477  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0421  putative phytochrome sensor protein  42.5 
 
 		 770 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0467  putative GAF sensor protein  44.55 
 
 		 736 aa  456  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.116791  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0923  putative phytochrome sensor protein  43.2 
 
 		 794 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3938  putative GAF sensor protein  41.95 
 
 		 806 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  43.02 
 
 		 841 aa  431  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00443  type II secretion system protein E:GAF domain  45.04 
 
 		 738 aa  428  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1966  type II secretion system protein E  40.13 
 
 		 642 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56575  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  40.07 
 
 		 871 aa  403  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  41.24 
 
 		 553 aa  382  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3153  type II secretion system protein E  49.43 
 
 		 684 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3152  type II secretion system protein E  50.12 
 
 		 677 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  40.34 
 
 		 568 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.24 
 
 		 568 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.17 
 
 		 568 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.97 
 
 		 568 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.17 
 
 		 568 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  41.25 
 
 		 599 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  38.46 
 
 		 557 aa  372  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.79 
 
 		 568 aa  372  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  39.58 
 
 		 553 aa  372  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  38.47 
 
 		 568 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.27 
 
 		 568 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  39.52 
 
 		 568 aa  369  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  37.63 
 
 		 561 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  40.14 
 
 		 603 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  41.42 
 
 		 599 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  39.72 
 
 		 566 aa  365  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  40.18 
 
 		 560 aa  365  1e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  37.09 
 
 		 556 aa  365  2e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  38.87 
 
 		 563 aa  365  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2000  type IV pilus assembly protein PilB  41.6 
 
 		 562 aa  364  3e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.758865  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  41.77 
 
 		 599 aa  363  8e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.28 
 
 		 568 aa  361  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.99 
 
 		 568 aa  362  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.41 
 
 		 562 aa  361  3e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.05 
 
 		 563 aa  360  5e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  37.31 
 
 		 558 aa  360  7e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  38.83 
 
 		 571 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  41.22 
 
 		 561 aa  358  2.9999999999999997e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  37.99 
 
 		 563 aa  358  2.9999999999999997e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  37.88 
 
 		 885 aa  356  7.999999999999999e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  37.28 
 
 		 558 aa  355  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0413  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.36 
 
 		 568 aa  355  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0069  type II secretion system protein E  36.84 
 
 		 570 aa  354  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.73093  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4447  type IV pilus biogenesis protein PilB  36.7 
 
 		 566 aa  353  5e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.33 
 
 		 571 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  38.61 
 
 		 553 aa  353  5.9999999999999994e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3833  type II secretion system protein E  41.4 
 
 		 568 aa  353  8e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522953 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.72 
 
 		 569 aa  352  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  37.3 
 
 		 557 aa  352  2e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  38.97 
 
 		 553 aa  352  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0064  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilB  36.49 
 
 		 591 aa  351  3e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.978792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  37.74 
 
 		 555 aa  351  3e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.13 
 
 		 571 aa  350  5e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0787  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.41 
 
 		 549 aa  350  6e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  39.45 
 
 		 577 aa  350  9e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  37.48 
 
 		 888 aa  349  1e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  45.67 
 
 		 498 aa  349  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  36.05 
 
 		 569 aa  349  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0312  type II secretion system protein E  36.46 
 
 		 571 aa  349  1e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  40.38 
 
 		 578 aa  347  3e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3423  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.02 
 
 		 569 aa  348  3e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  40.67 
 
 		 520 aa  347  5e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1701  type II secretion system protein E  37.16 
 
 		 578 aa  346  8e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2184  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.96 
 
 		 572 aa  346  8.999999999999999e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  37.8 
 
 		 572 aa  345  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.22 
 
 		 569 aa  346  1e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  35.88 
 
 		 576 aa  345  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  36.93 
 
 		 561 aa  345  2e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0369  type IV pilus biogenesis protein PilB  37.24 
 
 		 568 aa  345  2e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0217494  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0313  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.01 
 
 		 569 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2174  type II secretion system protein E  41.67 
 
 		 579 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.32 
 
 		 569 aa  344  4e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  46.73 
 
 		 500 aa  344  4e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  39.16 
 
 		 561 aa  343  5e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3910  putative phytochrome sensor protein  40.52 
 
 		 727 aa  343  5e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0454039  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0420  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.92 
 
 		 569 aa  343  7e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  38.13 
 
 		 577 aa  343  8e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  37.5 
 
 		 573 aa  343  9e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0362  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.7 
 
 		 569 aa  343  9e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0183  type IV pilus assembly protein  36.7 
 
 		 569 aa  343  9e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  36.07 
 
 		 564 aa  343  1e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3004  type II secretion system protein E  36.92 
 
 		 573 aa  342  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000330393 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3867  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.88 
 
 		 570 aa  343  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  40.85 
 
 		 514 aa  343  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  45.73 
 
 		 503 aa  343  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.81 
 
 		 569 aa  341  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4060  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.53 
 
 		 570 aa  340  5e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0244852  normal  0.314215 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  40.79 
 
 		 575 aa  340  7e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3942  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.7 
 
 		 570 aa  339  9e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  40.07 
 
 		 578 aa  339  9.999999999999999e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>