More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3833 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3910  putative phytochrome sensor protein  71.9 
 
 
727 aa  659    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0454039  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3833  type II secretion system protein E  100 
 
 
568 aa  1165    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.522953 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.04 
 
 
568 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  42.58 
 
 
568 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.23 
 
 
568 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.23 
 
 
568 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  44.06 
 
 
568 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.97 
 
 
568 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.74 
 
 
568 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  46.01 
 
 
871 aa  431  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.73 
 
 
568 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  43.65 
 
 
568 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  42.38 
 
 
557 aa  421  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  42.53 
 
 
566 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  42.51 
 
 
577 aa  419  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  43.79 
 
 
560 aa  419  1e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  44.05 
 
 
571 aa  419  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  45.58 
 
 
558 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1701  type II secretion system protein E  44.94 
 
 
578 aa  418  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  43.62 
 
 
553 aa  418  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.08 
 
 
568 aa  413  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.65 
 
 
563 aa  412  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  43.31 
 
 
553 aa  414  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  42.54 
 
 
557 aa  410  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.44 
 
 
571 aa  412  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  44.62 
 
 
577 aa  407  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  41.5 
 
 
555 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  41.5 
 
 
556 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  41.43 
 
 
558 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  41.59 
 
 
553 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.99 
 
 
568 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  40.38 
 
 
787 aa  405  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  43.06 
 
 
885 aa  396  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  43.54 
 
 
599 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  43.74 
 
 
599 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  43.54 
 
 
599 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.22 
 
 
571 aa  393  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  40.14 
 
 
559 aa  392  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  41.88 
 
 
563 aa  395  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1971  type II secretion system protein E  44.15 
 
 
670 aa  393  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  43.88 
 
 
561 aa  394  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2609  type IV pilus assembly protein, putative  38.66 
 
 
645 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0376  type II secretion system protein E  43.65 
 
 
670 aa  391  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0861  type II secretion system protein E  39.59 
 
 
642 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  44.67 
 
 
520 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2071  ATPase  53.38 
 
 
666 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  42.21 
 
 
603 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  42.69 
 
 
570 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1610  type II secretion system protein E  42.16 
 
 
673 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1636  type II secretion system protein E  42.16 
 
 
673 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  39.93 
 
 
553 aa  386  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  43.7 
 
 
891 aa  386  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  51.03 
 
 
888 aa  387  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  42.55 
 
 
573 aa  385  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  41.21 
 
 
572 aa  385  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4695  type II secretion system protein E  41.81 
 
 
668 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.912927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4182  type II secretion system protein E  43.1 
 
 
676 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  42.13 
 
 
565 aa  380  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  42.89 
 
 
520 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  40.69 
 
 
574 aa  379  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1748  type II secretion system protein E  46.2 
 
 
723 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  42.94 
 
 
521 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  39.14 
 
 
806 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  49.11 
 
 
499 aa  379  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2681  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.25 
 
 
572 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722105  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  39.49 
 
 
558 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  41.44 
 
 
561 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  42.33 
 
 
521 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1244  putative phytochrome sensor protein  42.92 
 
 
772 aa  372  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000557718  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  38.77 
 
 
557 aa  372  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1638  type II secretion system protein E  40.33 
 
 
644 aa  375  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  47.53 
 
 
559 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0295  putative phytochrome sensor protein  47.87 
 
 
767 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.42905  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0279  putative phytochrome sensor protein  46.87 
 
 
767 aa  375  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  38.73 
 
 
570 aa  375  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  42.33 
 
 
521 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  42.89 
 
 
521 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  42.33 
 
 
521 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  42.74 
 
 
521 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  41.01 
 
 
573 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  39.89 
 
 
570 aa  375  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  39.31 
 
 
612 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  42.33 
 
 
521 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  42.74 
 
 
521 aa  375  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  39.68 
 
 
564 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  44.33 
 
 
514 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  40.54 
 
 
569 aa  372  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  41.72 
 
 
561 aa  372  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  39.69 
 
 
571 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  42.6 
 
 
575 aa  371  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  39.6 
 
 
561 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  38.43 
 
 
594 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1971  putative phytochrome sensor protein  48.52 
 
 
771 aa  372  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000984823  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  47.46 
 
 
523 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  41.41 
 
 
568 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002545  type 4 fimbrial assembly ATPase PilB  42.23 
 
 
561 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.255614  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  43.12 
 
 
578 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  43.03 
 
 
520 aa  371  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  42.04 
 
 
585 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2141  type II secretion system protein E  38.24 
 
 
569 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000466372  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>