More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1128 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  59.78 
 
 		 557 aa  661    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  59.78 
 
 		 557 aa  654    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  60.07 
 
 		 556 aa  671    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  100 
 
 		 563 aa  1137    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  63.69 
 
 		 553 aa  711    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  48.02 
 
 		 871 aa  520  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  46.7 
 
 		 558 aa  505  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  46.74 
 
 		 558 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  45.96 
 
 		 558 aa  498  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  46.77 
 
 		 561 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  48.19 
 
 		 561 aa  487  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  43.83 
 
 		 568 aa  477  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  44.9 
 
 		 577 aa  476  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  47.74 
 
 		 572 aa  474  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  46.2 
 
 		 553 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  43.24 
 
 		 568 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.47 
 
 		 568 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  43.47 
 
 		 565 aa  471  1.0000000000000001e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.09 
 
 		 568 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.47 
 
 		 568 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  46.45 
 
 		 553 aa  463  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.11 
 
 		 568 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  45.29 
 
 		 573 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  45.52 
 
 		 553 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  42.5 
 
 		 787 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.35 
 
 		 571 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  46.18 
 
 		 559 aa  456  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.96 
 
 		 563 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  41.67 
 
 		 561 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  46.22 
 
 		 561 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  45.72 
 
 		 520 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  43.14 
 
 		 555 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  44.77 
 
 		 564 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  42.93 
 
 		 570 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  41.34 
 
 		 571 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  44.85 
 
 		 521 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  42.86 
 
 		 577 aa  445  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.01 
 
 		 568 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  41.55 
 
 		 566 aa  444  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  42.65 
 
 		 568 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.01 
 
 		 568 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  42.24 
 
 		 571 aa  441  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  45.05 
 
 		 570 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.75 
 
 		 568 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  43.51 
 
 		 888 aa  439  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  47.27 
 
 		 520 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  40.89 
 
 		 564 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  47.46 
 
 		 520 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  42.65 
 
 		 554 aa  436  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  44.65 
 
 		 603 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  44.3 
 
 		 559 aa  434  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  44.75 
 
 		 599 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  43.09 
 
 		 580 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  44.55 
 
 		 599 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.38 
 
 		 568 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  44.75 
 
 		 599 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  44.42 
 
 		 573 aa  432  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  43.27 
 
 		 885 aa  429  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  42.25 
 
 		 569 aa  430  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  40.21 
 
 		 567 aa  431  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  43.57 
 
 		 585 aa  427  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1701  type II secretion system protein E  39.89 
 
 		 578 aa  428  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  48.19 
 
 		 550 aa  425  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  43.17 
 
 		 568 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1586  type II secretion system protein E  41.74 
 
 		 546 aa  423  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.562805 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.75 
 
 		 562 aa  424  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.21 
 
 		 571 aa  424  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  38.86 
 
 		 570 aa  420  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  44.83 
 
 		 520 aa  420  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  42.34 
 
 		 589 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  42.68 
 
 		 891 aa  421  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  43.19 
 
 		 520 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  45.38 
 
 		 514 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  40.64 
 
 		 569 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1022  type II secretion system protein E  43.78 
 
 		 554 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.18 
 
 		 569 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.28 
 
 		 569 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  44.71 
 
 		 610 aa  414  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0376  type II secretion system protein E  43.01 
 
 		 670 aa  413  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  42.81 
 
 		 575 aa  413  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  42.34 
 
 		 552 aa  415  1e-114  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3783  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.58 
 
 		 568 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.458272  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  42.83 
 
 		 514 aa  415  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  40.57 
 
 		 569 aa  411  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0313  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.62 
 
 		 569 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  43.33 
 
 		 578 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0369  type IV pilus biogenesis protein PilB  40.39 
 
 		 568 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0217494  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3389  type II secretion system protein E  49.87 
 
 		 569 aa  411  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.87 
 
 		 569 aa  409  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0420  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.25 
 
 		 569 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.93 
 
 		 569 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  40.97 
 
 		 566 aa  410  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4182  type II secretion system protein E  41.92 
 
 		 676 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  42.6 
 
 		 578 aa  410  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0509  pilus biogenesis ATPase  39.07 
 
 		 572 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0385141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.79 
 
 		 570 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00735332  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  40.07 
 
 		 557 aa  408  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3942  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.58 
 
 		 570 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3423  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.42 
 
 		 569 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1964  general secretion pathway protein E  38.79 
 
 		 583 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>