More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4189 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  100 
 
 		 557 aa  1125    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  43.83 
 
 		 553 aa  464  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  47.69 
 
 		 520 aa  458  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  46.96 
 
 		 520 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  45.72 
 
 		 520 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  46.96 
 
 		 520 aa  451  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  41.84 
 
 		 556 aa  448  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  46.02 
 
 		 514 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.75 
 
 		 563 aa  445  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  41.84 
 
 		 558 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  42.71 
 
 		 787 aa  445  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  44.03 
 
 		 603 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  42.53 
 
 		 568 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  42.05 
 
 		 571 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  41.87 
 
 		 871 aa  437  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.35 
 
 		 568 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.35 
 
 		 568 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.09 
 
 		 568 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  43.67 
 
 		 599 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  40.56 
 
 		 564 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  43.67 
 
 		 599 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  43.67 
 
 		 599 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  42 
 
 		 573 aa  432  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  40.81 
 
 		 558 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  46.88 
 
 		 514 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  40.74 
 
 		 568 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  44.16 
 
 		 521 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  42.93 
 
 		 570 aa  425  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  42.75 
 
 		 564 aa  427  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  41.03 
 
 		 566 aa  422  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  40.43 
 
 		 568 aa  425  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  42.42 
 
 		 558 aa  425  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  40.85 
 
 		 557 aa  425  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.03 
 
 		 571 aa  423  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.89 
 
 		 568 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  41.42 
 
 		 577 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.27 
 
 		 568 aa  422  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  42.19 
 
 		 559 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  46.76 
 
 		 585 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  40.68 
 
 		 554 aa  418  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  41.42 
 
 		 561 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  44.44 
 
 		 567 aa  418  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  41.55 
 
 		 553 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  44.73 
 
 		 610 aa  415  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  39.36 
 
 		 557 aa  412  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  42.91 
 
 		 570 aa  412  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  41.34 
 
 		 561 aa  411  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  40.5 
 
 		 553 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  41.01 
 
 		 589 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  39.96 
 
 		 555 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  38.9 
 
 		 561 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  40.81 
 
 		 576 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.96 
 
 		 568 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  40.46 
 
 		 572 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  40.07 
 
 		 563 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  41.32 
 
 		 577 aa  404  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.72 
 
 		 568 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.89 
 
 		 571 aa  405  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  45.7 
 
 		 580 aa  404  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.72 
 
 		 568 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  39.68 
 
 		 571 aa  399  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  42.46 
 
 		 577 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0856  general secretory pathway protein E  46.12 
 
 		 566 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.67783  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  52.75 
 
 		 469 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  38.6 
 
 		 565 aa  402  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0769  general secretory pathway protein E  46.12 
 
 		 566 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  42.48 
 
 		 575 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  52.5 
 
 		 469 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  51.06 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1783  type IV pilus biogenesis protein PilB, putative  41.33 
 
 		 574 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  39.29 
 
 		 570 aa  398  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  39.89 
 
 		 553 aa  397  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  42.68 
 
 		 575 aa  399  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  38.85 
 
 		 585 aa  393  1e-108  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2420  type II secretion system protein E  40.84 
 
 		 573 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1387  type II secretion system protein E  38.93 
 
 		 577 aa  393  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00517077  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  42.2 
 
 		 578 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  51 
 
 		 487 aa  393  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  51.39 
 
 		 513 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  39.54 
 
 		 577 aa  394  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02675  general secretory pathway protein E  43.07 
 
 		 575 aa  394  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  38.84 
 
 		 573 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  51.01 
 
 		 498 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  47.75 
 
 		 515 aa  392  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  50.75 
 
 		 497 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  39.58 
 
 		 559 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  51.26 
 
 		 522 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1964  general secretion pathway protein E  39.12 
 
 		 583 aa  390  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1039  type II secretion system protein E  40.64 
 
 		 583 aa  392  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  38.93 
 
 		 885 aa  390  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  39.82 
 
 		 888 aa  391  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  50.5 
 
 		 497 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  50.5 
 
 		 497 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  51.01 
 
 		 499 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  50.5 
 
 		 497 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  50.86 
 
 		 514 aa  387  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  50.5 
 
 		 497 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  50.5 
 
 		 497 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  50.12 
 
 		 523 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  50.75 
 
 		 499 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>