More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1280 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  72.57 
 
 		 514 aa  737    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  100 
 
 		 521 aa  1047    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  71.65 
 
 		 520 aa  766    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  70.76 
 
 		 520 aa  730    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  71.7 
 
 		 520 aa  767    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  71.15 
 
 		 520 aa  733    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  54.32 
 
 		 599 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  54.32 
 
 		 599 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  54.32 
 
 		 599 aa  558  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  52.99 
 
 		 603 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  54 
 
 		 495 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  53.8 
 
 		 515 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  49.42 
 
 		 570 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  51.93 
 
 		 518 aa  490  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  52.58 
 
 		 522 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  52.92 
 
 		 513 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  54.51 
 
 		 497 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  54.51 
 
 		 497 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  54.51 
 
 		 497 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  53.46 
 
 		 491 aa  485  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  54.51 
 
 		 497 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  54.51 
 
 		 497 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  54.91 
 
 		 497 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  54.51 
 
 		 497 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  54.51 
 
 		 497 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  54.38 
 
 		 499 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  50.2 
 
 		 520 aa  482  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  52.55 
 
 		 498 aa  484  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  54.18 
 
 		 499 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  53.77 
 
 		 498 aa  482  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  49.4 
 
 		 514 aa  482  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  50.72 
 
 		 503 aa  483  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  54.18 
 
 		 499 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  49.5 
 
 		 521 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  50 
 
 		 500 aa  478  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  52.06 
 
 		 489 aa  481  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  50.4 
 
 		 523 aa  478  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  54.53 
 
 		 499 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  49.13 
 
 		 523 aa  478  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  53.97 
 
 		 499 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  51.86 
 
 		 502 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  53.97 
 
 		 499 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  53.7 
 
 		 498 aa  476  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  49.52 
 
 		 524 aa  477  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  49.8 
 
 		 514 aa  475  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  50 
 
 		 521 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  50 
 
 		 521 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  50.2 
 
 		 501 aa  474  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  50.7 
 
 		 523 aa  474  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  49.7 
 
 		 520 aa  473  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  51.24 
 
 		 502 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  49.11 
 
 		 521 aa  473  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3053  general secretory pathway protein E  51.81 
 
 		 518 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3115  general secretion pathway protein E  52.42 
 
 		 533 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4590  general secretion pathway protein E  49.32 
 
 		 509 aa  471  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3400  general secretory pathway protein E  51.81 
 
 		 518 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  48.07 
 
 		 499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  48.85 
 
 		 521 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  46.62 
 
 		 871 aa  466  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  48.07 
 
 		 521 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  48.85 
 
 		 521 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  48.85 
 
 		 521 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  48.85 
 
 		 521 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  49.39 
 
 		 553 aa  464  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  48.59 
 
 		 497 aa  463  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2925  general secretory pathway protein E  51.41 
 
 		 495 aa  465  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366791  normal  0.218914 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  48.87 
 
 		 558 aa  462  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  48.39 
 
 		 497 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  48.39 
 
 		 497 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  47.28 
 
 		 580 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  50.93 
 
 		 487 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03957  Type II secretory pathway, ATPase PulE-like protein  50.2 
 
 		 519 aa  459  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  48.39 
 
 		 497 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2399  general secretory pathway protein E  50.83 
 
 		 515 aa  460  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178866 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  48.88 
 
 		 511 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  51.04 
 
 		 471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  47.67 
 
 		 610 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0755  general secretory pathway protein E  51.67 
 
 		 469 aa  450  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0249  type II secretion system protein E  51.98 
 
 		 522 aa  450  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  49.49 
 
 		 501 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  45.97 
 
 		 553 aa  450  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  48.19 
 
 		 497 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  50.1 
 
 		 503 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  46.07 
 
 		 514 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2859  general secretory pathway protein E  51.12 
 
 		 498 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  51.99 
 
 		 469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1413  general secretory pathway protein E  51.75 
 
 		 498 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  48.55 
 
 		 561 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1415  general secretory pathway protein E  49.7 
 
 		 490 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  52.2 
 
 		 469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3137  pili biogenesis ATPase  50.52 
 
 		 474 aa  444  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629616  hitchhiker  0.0029573 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  46.64 
 
 		 558 aa  442  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1330  type II secretion system protein E  51.77 
 
 		 474 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  44.85 
 
 		 563 aa  442  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  43.65 
 
 		 564 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  49.69 
 
 		 477 aa  440  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  48.47 
 
 		 553 aa  440  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0232  general secretory pathway protein E  48.06 
 
 		 525 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0142  general secretory pathway protein E  54.63 
 
 		 502 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1072  general secretory pathway protein E  50.73 
 
 		 463 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.538099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>