More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0232 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  64.2 
 
 		 497 aa  640    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  66.86 
 
 		 523 aa  711    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4590  general secretion pathway protein E  70.12 
 
 		 509 aa  690    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  69.11 
 
 		 521 aa  709    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  71.22 
 
 		 501 aa  687    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  71.02 
 
 		 500 aa  690    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  69.47 
 
 		 521 aa  710    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  69.47 
 
 		 521 aa  709    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  64.2 
 
 		 497 aa  640    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  69.14 
 
 		 514 aa  704    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  70.46 
 
 		 521 aa  711    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  69.47 
 
 		 521 aa  710    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  64.2 
 
 		 497 aa  643    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  64.2 
 
 		 497 aa  640    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0232  general secretory pathway protein E  100 
 
 		 525 aa  1068    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  68.8 
 
 		 503 aa  687    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  69.67 
 
 		 521 aa  717    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  68.91 
 
 		 524 aa  709    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  69.67 
 
 		 521 aa  719    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  67.75 
 
 		 523 aa  704    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  67.82 
 
 		 514 aa  711    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  69.29 
 
 		 521 aa  716    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03957  Type II secretory pathway, ATPase PulE-like protein  80.5 
 
 		 519 aa  828    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  67.15 
 
 		 499 aa  660    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  70.5 
 
 		 520 aa  716    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  70.23 
 
 		 511 aa  677    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  68.63 
 
 		 523 aa  715    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  69.47 
 
 		 521 aa  710    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  62.4 
 
 		 498 aa  627  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  63.64 
 
 		 502 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  63.64 
 
 		 502 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  63.99 
 
 		 497 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2925  general secretory pathway protein E  63.32 
 
 		 495 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366791  normal  0.218914 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  63.73 
 
 		 498 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  61.52 
 
 		 501 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2399  general secretory pathway protein E  58.14 
 
 		 515 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178866 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  61.43 
 
 		 518 aa  599  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  59.14 
 
 		 489 aa  598  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2859  general secretory pathway protein E  61.48 
 
 		 498 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  59.52 
 
 		 520 aa  583  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1413  general secretory pathway protein E  61.27 
 
 		 498 aa  580  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1415  general secretory pathway protein E  60.29 
 
 		 490 aa  581  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  57.61 
 
 		 494 aa  580  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  57.84 
 
 		 494 aa  577  1.0000000000000001e-163  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  57.43 
 
 		 494 aa  573  1.0000000000000001e-162  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  57.85 
 
 		 503 aa  562  1.0000000000000001e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0249  type II secretion system protein E  55.86 
 
 		 522 aa  564  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0142  general secretory pathway protein E  56.69 
 
 		 502 aa  550  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  54.89 
 
 		 493 aa  545  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  54.89 
 
 		 493 aa  545  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0251  type II secretion system protein E  57 
 
 		 484 aa  546  1e-154  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  54.89 
 
 		 493 aa  545  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  54.89 
 
 		 493 aa  544  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  54.89 
 
 		 493 aa  544  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  52.84 
 
 		 513 aa  531  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  53.81 
 
 		 497 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  53.81 
 
 		 497 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  53.81 
 
 		 497 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  53.81 
 
 		 497 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  53.81 
 
 		 497 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  53.81 
 
 		 497 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  53.81 
 
 		 497 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3268  general secretion pathway protein E  56.03 
 
 		 503 aa  519  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000698586  hitchhiker  0.0000000000000127286 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  54.23 
 
 		 499 aa  521  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1005  type II secretion system protein E  56.03 
 
 		 503 aa  519  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  54.02 
 
 		 497 aa  518  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  54.02 
 
 		 499 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  54.02 
 
 		 499 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0954  general secretory pathway protein E  56.03 
 
 		 503 aa  519  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.120459  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  54.02 
 
 		 499 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  54.23 
 
 		 498 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  54.02 
 
 		 515 aa  521  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  55.62 
 
 		 491 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  53.81 
 
 		 499 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  53.48 
 
 		 477 aa  514  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  56.62 
 
 		 487 aa  514  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  53.61 
 
 		 499 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  53.91 
 
 		 468 aa  510  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2210  general secretory pathway protein E  52.57 
 
 		 477 aa  509  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  53.83 
 
 		 522 aa  508  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  54.04 
 
 		 495 aa  511  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  52.76 
 
 		 469 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3400  general secretory pathway protein E  53.01 
 
 		 518 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  53.59 
 
 		 471 aa  504  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3053  general secretory pathway protein E  52.82 
 
 		 518 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  52.47 
 
 		 469 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3314  type II secretion system protein E  50.62 
 
 		 491 aa  495  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3137  pili biogenesis ATPase  51.83 
 
 		 474 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629616  hitchhiker  0.0029573 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3115  general secretion pathway protein E  53.07 
 
 		 533 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  50.41 
 
 		 507 aa  488  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1044  type II secretion system protein E  51.85 
 
 		 482 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1088  type II secretion system protein E  53.39 
 
 		 482 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0645  general secretory pathway protein E  52.04 
 
 		 462 aa  479  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181851  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1047  type II secretion system protein E  52.06 
 
 		 483 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0666  general secretory pathway protein E  52.04 
 
 		 462 aa  479  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.726571 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0755  general secretory pathway protein E  50.8 
 
 		 469 aa  479  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1330  type II secretion system protein E  52.57 
 
 		 474 aa  481  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4179  type II secretion system protein E  51.65 
 
 		 482 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.262241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2652  type II secretion system protein E  51.94 
 
 		 505 aa  475  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2584  general secretory pathway protein E  48.98 
 
 		 486 aa  475  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855979  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>