More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0608 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  75.59 
 
 		 514 aa  777    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  74.71 
 
 		 520 aa  806    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  100 
 
 		 520 aa  1041    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  80.58 
 
 		 520 aa  874    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  71.15 
 
 		 521 aa  749    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  99.62 
 
 		 520 aa  1038    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  53.14 
 
 		 603 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  55.04 
 
 		 599 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  55.04 
 
 		 599 aa  571  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  55.23 
 
 		 599 aa  568  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  51.26 
 
 		 570 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  54.18 
 
 		 515 aa  491  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  53.77 
 
 		 522 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  48.66 
 
 		 610 aa  485  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  48.46 
 
 		 871 aa  483  1e-135  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  54.26 
 
 		 498 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  53.56 
 
 		 495 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  52.03 
 
 		 518 aa  484  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3053  general secretory pathway protein E  52.1 
 
 		 518 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3400  general secretory pathway protein E  52.1 
 
 		 518 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  53.75 
 
 		 499 aa  478  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  53.17 
 
 		 513 aa  480  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  53.54 
 
 		 499 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  52.07 
 
 		 502 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  47.88 
 
 		 553 aa  481  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  51.85 
 
 		 502 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  53.33 
 
 		 499 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  53.54 
 
 		 497 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  53.75 
 
 		 499 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  53.54 
 
 		 497 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  53.54 
 
 		 497 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  53.54 
 
 		 497 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  53.33 
 
 		 497 aa  478  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  53.54 
 
 		 497 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  53.54 
 
 		 499 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  53.54 
 
 		 497 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  53.54 
 
 		 497 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  53.54 
 
 		 499 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  49.32 
 
 		 520 aa  475  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  53.59 
 
 		 491 aa  472  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  51.74 
 
 		 489 aa  472  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  47.97 
 
 		 523 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  47.73 
 
 		 558 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  49.04 
 
 		 521 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  48.78 
 
 		 503 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  49.23 
 
 		 521 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3115  general secretion pathway protein E  52.51 
 
 		 533 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  48.54 
 
 		 521 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  48.36 
 
 		 523 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  50.72 
 
 		 514 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  50.1 
 
 		 514 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  48.84 
 
 		 521 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  48.54 
 
 		 520 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4590  general secretion pathway protein E  50.31 
 
 		 509 aa  465  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  48.17 
 
 		 521 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  46.2 
 
 		 564 aa  464  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  48.17 
 
 		 521 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2925  general secretory pathway protein E  52.14 
 
 		 495 aa  465  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366791  normal  0.218914 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  45.68 
 
 		 558 aa  464  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  48.17 
 
 		 521 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  48.17 
 
 		 521 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  46.9 
 
 		 523 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  48.98 
 
 		 500 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  48.98 
 
 		 501 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  44.38 
 
 		 568 aa  455  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  49.59 
 
 		 487 aa  456  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  50 
 
 		 521 aa  458  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  50.31 
 
 		 498 aa  457  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2399  general secretory pathway protein E  49.79 
 
 		 515 aa  457  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178866 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  47.22 
 
 		 557 aa  456  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  47.2 
 
 		 573 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  45.8 
 
 		 556 aa  453  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  48.98 
 
 		 499 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  49.9 
 
 		 503 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.8 
 
 		 568 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  48.19 
 
 		 514 aa  449  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  46.9 
 
 		 524 aa  451  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  47.75 
 
 		 563 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.2 
 
 		 568 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  49.48 
 
 		 494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  45.93 
 
 		 580 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  43.8 
 
 		 568 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  47.2 
 
 		 553 aa  446  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03957  Type II secretory pathway, ATPase PulE-like protein  48.98 
 
 		 519 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  51.33 
 
 		 498 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  49.39 
 
 		 511 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  46.6 
 
 		 561 aa  442  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0249  type II secretion system protein E  51.24 
 
 		 522 aa  442  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  47.09 
 
 		 561 aa  444  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  44.59 
 
 		 557 aa  442  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0142  general secretory pathway protein E  55.42 
 
 		 502 aa  444  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  48.28 
 
 		 553 aa  442  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  47.43 
 
 		 497 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  47.53 
 
 		 497 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  44.68 
 
 		 571 aa  439  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  49.38 
 
 		 501 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  42.69 
 
 		 787 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1415  general secretory pathway protein E  49.1 
 
 		 490 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  44.31 
 
 		 558 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  55.39 
 
 		 469 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>