More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3393 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3115  general secretion pathway protein E  83.4 
 
 		 533 aa  802    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  75.46 
 
 		 497 aa  743    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  75.71 
 
 		 495 aa  740    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  92.26 
 
 		 491 aa  897    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  75.46 
 
 		 497 aa  743    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  75.1 
 
 		 498 aa  735    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  75.51 
 
 		 499 aa  740    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3400  general secretory pathway protein E  82.02 
 
 		 518 aa  800    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  75.46 
 
 		 497 aa  743    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  75.72 
 
 		 497 aa  731    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  74.49 
 
 		 499 aa  731    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  75.3 
 
 		 522 aa  736    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  75.46 
 
 		 497 aa  743    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  100 
 
 		 513 aa  1033    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  73.63 
 
 		 515 aa  740    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  75.1 
 
 		 499 aa  734    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  74.7 
 
 		 499 aa  734    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  75.1 
 
 		 499 aa  734    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  75.41 
 
 		 499 aa  734    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  75.46 
 
 		 497 aa  743    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  75.46 
 
 		 497 aa  743    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  75.46 
 
 		 497 aa  743    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3053  general secretory pathway protein E  82.21 
 
 		 518 aa  801    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  64.42 
 
 		 469 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  63.64 
 
 		 471 aa  594  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  64.21 
 
 		 469 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2210  general secretory pathway protein E  66.23 
 
 		 477 aa  593  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  65.8 
 
 		 468 aa  593  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3137  pili biogenesis ATPase  62.47 
 
 		 474 aa  592  1e-168  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629616  hitchhiker  0.0029573 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  62.15 
 
 		 487 aa  586  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0755  general secretory pathway protein E  59.84 
 
 		 469 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1072  general secretory pathway protein E  60.74 
 
 		 463 aa  571  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.538099  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1330  type II secretion system protein E  61.43 
 
 		 474 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0666  general secretory pathway protein E  62.55 
 
 		 462 aa  561  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.726571 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0645  general secretory pathway protein E  62.55 
 
 		 462 aa  561  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181851  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0543  type II secretion system protein E  61.98 
 
 		 462 aa  561  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  59.92 
 
 		 477 aa  552  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1755  general secretory pathway protein E  61.52 
 
 		 462 aa  551  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.571927  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  56.29 
 
 		 521 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5698  general secretory pathway protein E  61.52 
 
 		 453 aa  551  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0566211 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0916  general secretory pathway protein E  61.32 
 
 		 453 aa  547  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346946 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  57.2 
 
 		 520 aa  548  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  55.67 
 
 		 521 aa  542  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  55.88 
 
 		 521 aa  545  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  55.42 
 
 		 521 aa  535  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  55.46 
 
 		 521 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  55.46 
 
 		 521 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  55.26 
 
 		 521 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  55.46 
 
 		 514 aa  537  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  55.46 
 
 		 521 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  55.05 
 
 		 521 aa  531  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  55.53 
 
 		 523 aa  533  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  55.56 
 
 		 514 aa  532  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  55.03 
 
 		 523 aa  533  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  55.33 
 
 		 523 aa  530  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  54.83 
 
 		 524 aa  527  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  55.44 
 
 		 502 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  55.1 
 
 		 518 aa  518  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2399  general secretory pathway protein E  55.91 
 
 		 515 aa  518  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178866 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  51.98 
 
 		 499 aa  519  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  53.21 
 
 		 500 aa  515  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  55.62 
 
 		 498 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  58.11 
 
 		 502 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  54.81 
 
 		 501 aa  514  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0232  general secretory pathway protein E  52.84 
 
 		 525 aa  513  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  55.58 
 
 		 489 aa  512  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  57.24 
 
 		 503 aa  513  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2925  general secretory pathway protein E  58.21 
 
 		 495 aa  508  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366791  normal  0.218914 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03957  Type II secretory pathway, ATPase PulE-like protein  55.71 
 
 		 519 aa  506  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  53.31 
 
 		 501 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  51.22 
 
 		 494 aa  508  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  54.18 
 
 		 511 aa  505  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4590  general secretion pathway protein E  53.86 
 
 		 509 aa  503  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1415  general secretory pathway protein E  54.4 
 
 		 490 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  53.2 
 
 		 520 aa  501  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  51.93 
 
 		 494 aa  496  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  53.68 
 
 		 498 aa  495  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  52.44 
 
 		 497 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  51.53 
 
 		 494 aa  494  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  52.44 
 
 		 497 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0249  type II secretion system protein E  51.18 
 
 		 522 aa  492  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  52.92 
 
 		 521 aa  489  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  52.34 
 
 		 497 aa  491  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0251  type II secretion system protein E  52.17 
 
 		 484 aa  491  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  52.44 
 
 		 497 aa  490  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  54 
 
 		 503 aa  487  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.666057 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  54.82 
 
 		 493 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  54.82 
 
 		 493 aa  484  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2859  general secretory pathway protein E  52.65 
 
 		 498 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  54.82 
 
 		 493 aa  484  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  54.82 
 
 		 493 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  54.82 
 
 		 493 aa  484  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1413  general secretory pathway protein E  52.15 
 
 		 498 aa  481  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  51.44 
 
 		 520 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  54.45 
 
 		 520 aa  474  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  53.55 
 
 		 514 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4179  type II secretion system protein E  52.98 
 
 		 482 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.262241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  52.24 
 
 		 497 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0142  general secretory pathway protein E  53.1 
 
 		 502 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  52.95 
 
 		 520 aa  463  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>