More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2377 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  71.31 
 
 
518 aa  694    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  100 
 
 
489 aa  976    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2399  general secretory pathway protein E  72.99 
 
 
515 aa  727    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000178866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  64.6 
 
 
502 aa  618  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  62.81 
 
 
520 aa  620  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  64.18 
 
 
502 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  62.01 
 
 
520 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2925  general secretory pathway protein E  63.71 
 
 
495 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366791  normal  0.218914 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  59.75 
 
 
523 aa  590  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  60.16 
 
 
521 aa  588  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  60.37 
 
 
521 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  60.16 
 
 
521 aa  591  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  61.68 
 
 
523 aa  590  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  60.82 
 
 
500 aa  585  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  60.16 
 
 
521 aa  587  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  60.41 
 
 
503 aa  587  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  60.16 
 
 
514 aa  586  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  59.14 
 
 
521 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  60.49 
 
 
501 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  59.14 
 
 
521 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  59.14 
 
 
521 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  59.43 
 
 
524 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  59.18 
 
 
523 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  59.14 
 
 
521 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  60.04 
 
 
521 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4590  general secretion pathway protein E  59.88 
 
 
509 aa  578  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  59.34 
 
 
499 aa  580  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  59.14 
 
 
514 aa  578  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0232  general secretory pathway protein E  59.14 
 
 
525 aa  581  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03957  Type II secretory pathway, ATPase PulE-like protein  60.08 
 
 
519 aa  577  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  57.97 
 
 
503 aa  575  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  58.93 
 
 
497 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  59.47 
 
 
511 aa  575  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  58.73 
 
 
497 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  58.52 
 
 
497 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  58.73 
 
 
497 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0249  type II secretion system protein E  58.22 
 
 
522 aa  572  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  57.49 
 
 
494 aa  568  1e-161  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  57.49 
 
 
494 aa  570  1e-161  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0142  general secretory pathway protein E  60.86 
 
 
502 aa  567  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1415  general secretory pathway protein E  60.16 
 
 
490 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  58.73 
 
 
497 aa  559  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  58.85 
 
 
498 aa  551  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  57.52 
 
 
487 aa  547  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  55.28 
 
 
494 aa  543  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  59.47 
 
 
498 aa  543  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  57.29 
 
 
501 aa  536  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0251  type II secretion system protein E  55.21 
 
 
484 aa  531  1e-149  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2859  general secretory pathway protein E  58.02 
 
 
498 aa  530  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1413  general secretory pathway protein E  57.49 
 
 
498 aa  522  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3268  general secretion pathway protein E  52.06 
 
 
503 aa  513  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000698586  hitchhiker  0.0000000000000127286 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  55.58 
 
 
513 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0954  general secretory pathway protein E  52.06 
 
 
503 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.120459  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2584  general secretory pathway protein E  55.01 
 
 
486 aa  513  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855979  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1005  type II secretion system protein E  52.06 
 
 
503 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  55.46 
 
 
493 aa  501  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1044  type II secretion system protein E  55.76 
 
 
482 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  53.91 
 
 
477 aa  502  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  55.62 
 
 
491 aa  502  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  55.46 
 
 
493 aa  501  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  55.46 
 
 
493 aa  501  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0402565 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  55.46 
 
 
493 aa  500  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4179  type II secretion system protein E  55.56 
 
 
482 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.262241  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  55.46 
 
 
493 aa  500  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  53.88 
 
 
468 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3053  general secretory pathway protein E  54.84 
 
 
518 aa  498  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3400  general secretory pathway protein E  54.64 
 
 
518 aa  497  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  52.89 
 
 
499 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1047  type II secretion system protein E  55.12 
 
 
483 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  52.89 
 
 
499 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1088  type II secretion system protein E  55.12 
 
 
482 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2652  type II secretion system protein E  54.87 
 
 
505 aa  490  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  53.1 
 
 
499 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  52.89 
 
 
499 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  53.1 
 
 
499 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  52.26 
 
 
497 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  52.26 
 
 
497 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  52.26 
 
 
497 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  53.56 
 
 
469 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  52.26 
 
 
497 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  52.26 
 
 
497 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  52.69 
 
 
499 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  52.88 
 
 
497 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0316  type II secretion system protein E  51.96 
 
 
497 aa  488  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.218046  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  52.26 
 
 
497 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  51.02 
 
 
507 aa  488  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  52.69 
 
 
498 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  52.26 
 
 
497 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3115  general secretion pathway protein E  54.23 
 
 
533 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  52.25 
 
 
515 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  51.63 
 
 
599 aa  482  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  52.47 
 
 
495 aa  482  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  52.47 
 
 
522 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  53.86 
 
 
469 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  51.63 
 
 
599 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  52.06 
 
 
521 aa  481  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  52.47 
 
 
520 aa  481  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2210  general secretory pathway protein E  52.27 
 
 
477 aa  479  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  51.02 
 
 
599 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  52.57 
 
 
520 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>