More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2859 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  65.23 
 
 		 521 aa  643    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  81.33 
 
 		 498 aa  791    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2859  general secretory pathway protein E  100 
 
 		 498 aa  1003    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  81.12 
 
 		 498 aa  827    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  65.98 
 
 		 524 aa  647    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  64.81 
 
 		 521 aa  636    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1413  general secretory pathway protein E  95.38 
 
 		 498 aa  921    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  64.69 
 
 		 523 aa  635    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  65.02 
 
 		 521 aa  643    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  65.43 
 
 		 521 aa  645    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  62.52 
 
 		 514 aa  642    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  64.61 
 
 		 523 aa  645    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  65.02 
 
 		 521 aa  644    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  64.81 
 
 		 523 aa  638    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  70.77 
 
 		 501 aa  712    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  66.39 
 
 		 520 aa  654    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  64.2 
 
 		 521 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  64.2 
 
 		 521 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  64.2 
 
 		 521 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  64.2 
 
 		 521 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  63.37 
 
 		 514 aa  626  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  62.14 
 
 		 503 aa  616  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4590  general secretion pathway protein E  63.45 
 
 		 509 aa  614  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  62.05 
 
 		 511 aa  612  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03957  Type II secretory pathway, ATPase PulE-like protein  63.37 
 
 		 519 aa  608  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  61.93 
 
 		 501 aa  605  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  60.49 
 
 		 499 aa  605  9.999999999999999e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  62.14 
 
 		 500 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  62.27 
 
 		 497 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  62.27 
 
 		 497 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  62.27 
 
 		 497 aa  599  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  62.27 
 
 		 497 aa  599  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  61.57 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0232  general secretory pathway protein E  61.48 
 
 		 525 aa  596  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  61.57 
 
 		 502 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  59.18 
 
 		 494 aa  582  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  62.27 
 
 		 497 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2399  general secretory pathway protein E  58.62 
 
 		 515 aa  573  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178866 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  58.88 
 
 		 493 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  59.09 
 
 		 493 aa  570  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  59.09 
 
 		 493 aa  570  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  58.88 
 
 		 493 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  59.09 
 
 		 493 aa  570  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1415  general secretory pathway protein E  59.67 
 
 		 490 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2925  general secretory pathway protein E  59.43 
 
 		 495 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366791  normal  0.218914 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  59.02 
 
 		 518 aa  558  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  57.35 
 
 		 520 aa  554  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  58.02 
 
 		 489 aa  550  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  55.74 
 
 		 494 aa  546  1e-154  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  54.92 
 
 		 494 aa  542  1e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0249  type II secretion system protein E  54.71 
 
 		 522 aa  541  9.999999999999999e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3268  general secretion pathway protein E  55.18 
 
 		 503 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000698586  hitchhiker  0.0000000000000127286 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1005  type II secretion system protein E  55.18 
 
 		 503 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  55.49 
 
 		 503 aa  536  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0954  general secretory pathway protein E  55.18 
 
 		 503 aa  537  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.120459  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0251  type II secretion system protein E  55.69 
 
 		 484 aa  534  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  55.14 
 
 		 499 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  54.94 
 
 		 499 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  54.12 
 
 		 499 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  53.7 
 
 		 497 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  53.7 
 
 		 497 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  53.7 
 
 		 497 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  53.7 
 
 		 497 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  53.7 
 
 		 497 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  55.37 
 
 		 468 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  54.12 
 
 		 499 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  53.91 
 
 		 497 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  54.12 
 
 		 499 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  53.7 
 
 		 497 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  53.7 
 
 		 497 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  54.12 
 
 		 499 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  54.32 
 
 		 495 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  53.91 
 
 		 498 aa  514  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  54.32 
 
 		 522 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  53.42 
 
 		 515 aa  512  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3314  type II secretion system protein E  52.59 
 
 		 491 aa  511  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  53.78 
 
 		 491 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  52.65 
 
 		 513 aa  506  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  51.74 
 
 		 487 aa  497  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3400  general secretory pathway protein E  52.71 
 
 		 518 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  53.67 
 
 		 471 aa  493  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0142  general secretory pathway protein E  53.88 
 
 		 502 aa  492  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3053  general secretory pathway protein E  52.51 
 
 		 518 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  53.09 
 
 		 469 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  52.58 
 
 		 469 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3115  general secretion pathway protein E  52.81 
 
 		 533 aa  487  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1330  type II secretion system protein E  54.47 
 
 		 474 aa  486  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2584  general secretory pathway protein E  52.88 
 
 		 486 aa  481  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0755  general secretory pathway protein E  51.44 
 
 		 469 aa  477  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2210  general secretory pathway protein E  50.93 
 
 		 477 aa  473  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1755  general secretory pathway protein E  52.56 
 
 		 462 aa  472  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.571927  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  50.41 
 
 		 477 aa  474  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0543  type II secretion system protein E  51.53 
 
 		 462 aa  472  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3137  pili biogenesis ATPase  51.74 
 
 		 474 aa  473  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629616  hitchhiker  0.0029573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1072  general secretory pathway protein E  51.84 
 
 		 463 aa  474  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.538099  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2652  type II secretion system protein E  51.64 
 
 		 505 aa  470  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0316  type II secretion system protein E  50.52 
 
 		 497 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.218046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  53.39 
 
 		 507 aa  470  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0916  general secretory pathway protein E  52.25 
 
 		 453 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346946 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0645  general secretory pathway protein E  52.25 
 
 		 462 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>