More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02675 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  61.21 
 
 
585 aa  644    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02675  general secretory pathway protein E  100 
 
 
575 aa  1155    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0856  general secretory pathway protein E  80.46 
 
 
566 aa  894    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.67783  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0546  general secretory pathway protein E  81.46 
 
 
573 aa  894    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0871321 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0769  general secretory pathway protein E  80.46 
 
 
566 aa  894    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  60.5 
 
 
580 aa  625  1e-178  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  66.67 
 
 
585 aa  621  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  66.67 
 
 
585 aa  621  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2183  general secretory pathway protein E  59.93 
 
 
563 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  51.64 
 
 
567 aa  509  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  51.54 
 
 
578 aa  509  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  50.18 
 
 
575 aa  505  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  49.45 
 
 
559 aa  489  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  50.18 
 
 
578 aa  485  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  43.27 
 
 
558 aa  449  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  50.1 
 
 
514 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.49 
 
 
571 aa  427  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  43.31 
 
 
570 aa  420  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  43.9 
 
 
599 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  44.08 
 
 
599 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  44.08 
 
 
599 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  47.52 
 
 
521 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  45.2 
 
 
553 aa  416  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  43.7 
 
 
603 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  41.9 
 
 
571 aa  412  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  41.79 
 
 
871 aa  413  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  41.71 
 
 
565 aa  413  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  43.52 
 
 
566 aa  412  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.83 
 
 
563 aa  414  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  42.57 
 
 
568 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  42.88 
 
 
573 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  39.65 
 
 
564 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  41.4 
 
 
571 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  41.76 
 
 
555 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  45.09 
 
 
550 aa  406  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  46.61 
 
 
520 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  41.86 
 
 
566 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  45.19 
 
 
520 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.66 
 
 
568 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.55 
 
 
568 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  42.44 
 
 
558 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.55 
 
 
568 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  43.36 
 
 
561 aa  405  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.49 
 
 
568 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  41.62 
 
 
557 aa  404  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  42.91 
 
 
568 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  42 
 
 
568 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0893  type II secretion system protein E  47.92 
 
 
557 aa  403  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0853399  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  42.21 
 
 
556 aa  405  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.63 
 
 
568 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.92 
 
 
568 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.91 
 
 
568 aa  405  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  41.64 
 
 
553 aa  405  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  41.62 
 
 
553 aa  404  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  46.95 
 
 
514 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  40.88 
 
 
561 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2611  putative general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  47.01 
 
 
517 aa  402  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  45.73 
 
 
520 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  45.73 
 
 
520 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  43.37 
 
 
553 aa  402  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  42.32 
 
 
570 aa  400  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  39.5 
 
 
558 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  40.69 
 
 
557 aa  399  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  42.03 
 
 
564 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.59 
 
 
568 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  43.56 
 
 
500 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  43.48 
 
 
501 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  49.33 
 
 
518 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  42.48 
 
 
561 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3009  type II secretion system protein E  46.68 
 
 
561 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  40.07 
 
 
570 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  41.67 
 
 
554 aa  397  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  40.6 
 
 
562 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  41.61 
 
 
557 aa  394  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  46.8 
 
 
497 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  46.26 
 
 
503 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  46.8 
 
 
497 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  53.62 
 
 
469 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  44.42 
 
 
610 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  45.98 
 
 
497 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  46.8 
 
 
497 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2107  type II secretion system protein E  44.55 
 
 
606 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  45.87 
 
 
522 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  46.8 
 
 
497 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  46.8 
 
 
497 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  46.8 
 
 
497 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  39.75 
 
 
577 aa  392  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  45.87 
 
 
495 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  41.76 
 
 
552 aa  394  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  46.8 
 
 
497 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  42.11 
 
 
563 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  46.47 
 
 
499 aa  393  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2028  type II secretion system protein E  45.08 
 
 
541 aa  391  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115803  normal  0.0405936 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  52.21 
 
 
524 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  50.13 
 
 
523 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  44.73 
 
 
513 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  44.49 
 
 
515 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  50.65 
 
 
514 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  43.52 
 
 
575 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  53.62 
 
 
469 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>