More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0410 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  100 
 
 		 565 aa  1154    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  45.85 
 
 		 871 aa  493  9.999999999999999e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  44.22 
 
 		 553 aa  483  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  43.99 
 
 		 568 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.63 
 
 		 568 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.63 
 
 		 568 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  47.21 
 
 		 550 aa  469  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  43.9 
 
 		 558 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.8 
 
 		 563 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.01 
 
 		 571 aa  468  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  43.47 
 
 		 563 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  42.06 
 
 		 552 aa  468  9.999999999999999e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  43.9 
 
 		 787 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.93 
 
 		 568 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  45.92 
 
 		 553 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  41.88 
 
 		 568 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  45.74 
 
 		 555 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  42.24 
 
 		 568 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  42.29 
 
 		 566 aa  456  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  41.55 
 
 		 571 aa  457  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  43.22 
 
 		 558 aa  456  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  42.7 
 
 		 570 aa  456  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  43.63 
 
 		 557 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  43.01 
 
 		 573 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.16 
 
 		 568 aa  452  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  41.88 
 
 		 553 aa  449  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  42.16 
 
 		 557 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  41.98 
 
 		 556 aa  448  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1586  type II secretion system protein E  45.01 
 
 		 546 aa  446  1.0000000000000001e-124  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.562805 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.73 
 
 		 568 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.71 
 
 		 568 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.37 
 
 		 568 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  41.56 
 
 		 561 aa  444  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  45.42 
 
 		 520 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  39.93 
 
 		 564 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  39.83 
 
 		 570 aa  437  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  42.62 
 
 		 599 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  42.62 
 
 		 599 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  43.12 
 
 		 599 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  41.34 
 
 		 561 aa  433  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  43.54 
 
 		 891 aa  433  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.65 
 
 		 568 aa  433  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  40.57 
 
 		 569 aa  429  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  42.44 
 
 		 603 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  44.2 
 
 		 520 aa  430  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  41.83 
 
 		 553 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  43.86 
 
 		 520 aa  430  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  43.86 
 
 		 520 aa  431  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  41.01 
 
 		 570 aa  425  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  43.8 
 
 		 521 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  41.32 
 
 		 885 aa  428  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  41.52 
 
 		 572 aa  427  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  40.97 
 
 		 564 aa  428  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3085  type II secretion system protein E  44.01 
 
 		 560 aa  428  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136067 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  44.81 
 
 		 514 aa  425  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  41.7 
 
 		 589 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0856  general secretory pathway protein E  44.82 
 
 		 566 aa  419  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.67783  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  41.33 
 
 		 580 aa  422  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0769  general secretory pathway protein E  45.03 
 
 		 566 aa  421  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  39.96 
 
 		 571 aa  418  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  41.82 
 
 		 559 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  43.84 
 
 		 582 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  41.05 
 
 		 570 aa  416  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  40.5 
 
 		 578 aa  419  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  40.14 
 
 		 568 aa  413  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  38.68 
 
 		 559 aa  415  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  39.86 
 
 		 594 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02675  general secretory pathway protein E  45.57 
 
 		 575 aa  412  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  40.59 
 
 		 888 aa  412  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  40.43 
 
 		 578 aa  411  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  44.76 
 
 		 585 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  44.35 
 
 		 585 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  39.53 
 
 		 577 aa  410  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  39.82 
 
 		 575 aa  411  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  39.96 
 
 		 561 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  40.07 
 
 		 554 aa  410  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2183  general secretory pathway protein E  40.6 
 
 		 563 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  41.02 
 
 		 637 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  40.87 
 
 		 591 aa  410  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_002620  TC0860  general secretion pathway protein E  43.99 
 
 		 500 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  37.34 
 
 		 561 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0546  general secretory pathway protein E  42.94 
 
 		 573 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0871321 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  39.34 
 
 		 562 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 806 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  42.86 
 
 		 746 aa  403  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  40.04 
 
 		 576 aa  405  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.43 
 
 		 571 aa  405  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  40.11 
 
 		 585 aa  405  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  40.53 
 
 		 585 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  39.49 
 
 		 577 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  39.42 
 
 		 823 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  46.63 
 
 		 498 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  38.34 
 
 		 567 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  37.89 
 
 		 577 aa  402  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  38.67 
 
 		 563 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  38.74 
 
 		 573 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  38.6 
 
 		 557 aa  402  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  39.04 
 
 		 560 aa  399  9.999999999999999e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  48.06 
 
 		 502 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2420  type II secretion system protein E  39.55 
 
 		 573 aa  398  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>