More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3085 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3085  type II secretion system protein E  100 
 
 
560 aa  1111    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.136067 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  50.93 
 
 
552 aa  535  1e-150  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  46.07 
 
 
570 aa  476  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  44.01 
 
 
565 aa  443  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.77 
 
 
571 aa  437  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  41.37 
 
 
568 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  41.29 
 
 
568 aa  432  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.07 
 
 
563 aa  434  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  41.44 
 
 
558 aa  435  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.57 
 
 
568 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.07 
 
 
568 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  45.29 
 
 
520 aa  428  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  40.43 
 
 
568 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.25 
 
 
568 aa  425  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  40.9 
 
 
566 aa  425  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  40.11 
 
 
571 aa  424  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  42.65 
 
 
553 aa  422  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.25 
 
 
568 aa  425  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  41.21 
 
 
558 aa  420  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  46.5 
 
 
520 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  46.25 
 
 
550 aa  419  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.44 
 
 
568 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  43.01 
 
 
553 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  44.04 
 
 
599 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  46.19 
 
 
514 aa  415  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  41.89 
 
 
585 aa  414  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  43.68 
 
 
599 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.25 
 
 
568 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  43.05 
 
 
557 aa  413  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  44.49 
 
 
559 aa  415  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  46.23 
 
 
520 aa  415  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  43.68 
 
 
599 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  46.23 
 
 
520 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  42.09 
 
 
570 aa  409  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  42.81 
 
 
610 aa  411  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  41.3 
 
 
555 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  38.21 
 
 
564 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.73 
 
 
568 aa  411  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  42.6 
 
 
556 aa  410  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  41.86 
 
 
561 aa  411  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  47.19 
 
 
585 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2183  general secretory pathway protein E  48.12 
 
 
563 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  52.55 
 
 
487 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  43.52 
 
 
553 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  45.19 
 
 
521 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  47 
 
 
585 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  40.22 
 
 
573 aa  405  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  42.14 
 
 
577 aa  403  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  45.27 
 
 
603 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  54.62 
 
 
469 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  44.88 
 
 
567 aa  402  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  42.7 
 
 
557 aa  404  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  54.62 
 
 
469 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  42.83 
 
 
871 aa  402  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  50.35 
 
 
495 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.59 
 
 
571 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2000  type IV pilus assembly protein PilB  43.49 
 
 
562 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.758865  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0769  general secretory pathway protein E  46.35 
 
 
566 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  49.88 
 
 
515 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  50.12 
 
 
522 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.49 
 
 
568 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  37.95 
 
 
787 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  41.6 
 
 
580 aa  398  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  41.83 
 
 
885 aa  397  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  41.34 
 
 
564 aa  397  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  41.17 
 
 
806 aa  396  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  52.43 
 
 
518 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  47.71 
 
 
513 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  43.74 
 
 
891 aa  397  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2210  general secretory pathway protein E  54.09 
 
 
477 aa  398  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0856  general secretory pathway protein E  46.35 
 
 
566 aa  397  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.67783  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  48.95 
 
 
497 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  42.89 
 
 
561 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  48.95 
 
 
497 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  48.95 
 
 
497 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  47.75 
 
 
491 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  48.95 
 
 
497 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  54.09 
 
 
468 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  43.85 
 
 
575 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  48.95 
 
 
497 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  48.71 
 
 
497 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  38.67 
 
 
561 aa  393  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  49.41 
 
 
499 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  48.95 
 
 
497 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  40.86 
 
 
573 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002545  type 4 fimbrial assembly ATPase PilB  43.65 
 
 
561 aa  394  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.255614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  49.41 
 
 
499 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  49.41 
 
 
499 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  49.41 
 
 
499 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  49.41 
 
 
499 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  48.95 
 
 
497 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3115  general secretion pathway protein E  48.4 
 
 
533 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  40.4 
 
 
568 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0755  general secretory pathway protein E  47.73 
 
 
469 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  49.07 
 
 
499 aa  392  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02675  general secretory pathway protein E  45.14 
 
 
575 aa  389  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  48.3 
 
 
498 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  38.41 
 
 
571 aa  391  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  53.47 
 
 
477 aa  391  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  40.96 
 
 
566 aa  391  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>