More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0860 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0860  general secretion pathway protein E  100 
 
 		 500 aa  1007    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  47.55 
 
 		 520 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  46.18 
 
 		 494 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  46.39 
 
 		 494 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  45.6 
 
 		 521 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  45.4 
 
 		 520 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  45.19 
 
 		 520 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  44.99 
 
 		 520 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  53.67 
 
 		 507 aa  410  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  44.84 
 
 		 580 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  43.99 
 
 		 565 aa  407  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  44.44 
 
 		 553 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  46.34 
 
 		 497 aa  403  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  45.67 
 
 		 523 aa  402  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  45.27 
 
 		 523 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  45.27 
 
 		 553 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  46.33 
 
 		 503 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  44.51 
 
 		 503 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  46.03 
 
 		 497 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  43.88 
 
 		 558 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  45.06 
 
 		 515 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  46.37 
 
 		 520 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  45.31 
 
 		 514 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  44.76 
 
 		 514 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  45.97 
 
 		 489 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  44.76 
 
 		 571 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  46.03 
 
 		 497 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  46.03 
 
 		 497 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2399  general secretory pathway protein E  45.69 
 
 		 515 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178866 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  45.55 
 
 		 514 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  46.39 
 
 		 514 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  46.08 
 
 		 487 aa  396  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  46.23 
 
 		 520 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  42.94 
 
 		 573 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  46.12 
 
 		 497 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  44.03 
 
 		 500 aa  397  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  43.84 
 
 		 566 aa  395  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  46.31 
 
 		 469 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  44.33 
 
 		 585 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  44.69 
 
 		 524 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  44.44 
 
 		 558 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  53.67 
 
 		 502 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  44.47 
 
 		 499 aa  394  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  44.71 
 
 		 599 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  48.9 
 
 		 518 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  42.62 
 
 		 556 aa  392  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  45.84 
 
 		 513 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  45.42 
 
 		 521 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  53.67 
 
 		 502 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  46 
 
 		 469 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  46.03 
 
 		 561 aa  393  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  45.21 
 
 		 521 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  44.06 
 
 		 568 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0546  general secretory pathway protein E  45.36 
 
 		 573 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0871321 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  45.27 
 
 		 497 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  45.27 
 
 		 497 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  45.27 
 
 		 497 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  45.29 
 
 		 498 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  46.06 
 
 		 491 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  42.92 
 
 		 871 aa  389  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  45.27 
 
 		 497 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  45.27 
 
 		 497 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  45.27 
 
 		 499 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  42.33 
 
 		 570 aa  389  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1415  general secretory pathway protein E  46.77 
 
 		 490 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  45.06 
 
 		 497 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  50.61 
 
 		 567 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  44.6 
 
 		 521 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  42.17 
 
 		 589 aa  392  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  43.91 
 
 		 599 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  45.06 
 
 		 499 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  44.49 
 
 		 521 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0249  type II secretion system protein E  44.53 
 
 		 522 aa  389  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  45.06 
 
 		 499 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  44.06 
 
 		 523 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  45.21 
 
 		 521 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  41.55 
 
 		 570 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  44.86 
 
 		 499 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  45.06 
 
 		 499 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  44.86 
 
 		 499 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  50.52 
 
 		 559 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  45.27 
 
 		 497 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  45.27 
 
 		 497 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  43.9 
 
 		 493 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  44.11 
 
 		 493 aa  388  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  45.12 
 
 		 521 aa  388  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  44.11 
 
 		 493 aa  388  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  43.64 
 
 		 501 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  44.4 
 
 		 521 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.93 
 
 		 568 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  43.84 
 
 		 568 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0251  type II secretion system protein E  44.62 
 
 		 484 aa  385  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2925  general secretory pathway protein E  45.42 
 
 		 495 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366791  normal  0.218914 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  44.65 
 
 		 522 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  44.4 
 
 		 521 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  44.4 
 
 		 521 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  44.11 
 
 		 493 aa  388  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  44.86 
 
 		 495 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  43.9 
 
 		 493 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.15 
 
 		 571 aa  386  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>